24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3846 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_3846  blue (type 1) copper domain protein  100 
 
 		 163 aa  317  5e-86  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.884405  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4075  hypothetical protein  45.24 
 
 		 145 aa  73.9  0.0000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.0000044282  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3421  hypothetical protein  37.93 
 
 		 176 aa  73.2  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5638  hypothetical protein  39.42 
 
 		 132 aa  69.7  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.273492  normal  0.361806 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1897  blue (type 1) copper domain protein  29.5 
 
 		 243 aa  63.9  0.0000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3376  blue (type 1) copper domain protein  32.11 
 
 		 186 aa  63.2  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.176163  normal  0.399462 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0503  multicopper oxidase, type 3  34.69 
 
 		 479 aa  55.8  0.0000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.16251 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3626  multicopper oxidase, type 3  36.54 
 
 		 856 aa  54.7  0.0000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.227058  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2353  hypothetical protein  30.99 
 
 		 396 aa  50.4  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5010  hypothetical protein  31.53 
 
 		 138 aa  50.1  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.672437  normal  0.0999643 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05180  Copper binding protein, plastocyanin/azurin family  29.33 
 
 		 166 aa  49.7  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.566763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3995  blue (type1) copper domain-containing protein  32.56 
 
 		 180 aa  46.2  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.704782  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1295  nitrite reductase (NO-forming)  28.85 
 
 		 463 aa  45.4  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2794  hypothetical protein  34.95 
 
 		 471 aa  45.8  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4852  hypothetical protein  27.73 
 
 		 138 aa  44.7  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.69474  normal  0.0614733 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1734  hypothetical protein  40 
 
 		 385 aa  44.3  0.0007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0725409  normal  0.221375 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6338  membrane-bound dehydrogenase domain protein  30.25 
 
 		 957 aa  43.5  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3041  blue (type 1) copper domain protein  32.35 
 
 		 157 aa  43.5  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.445011 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4335  hypothetical protein  26.89 
 
 		 138 aa  43.9  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.324626  normal  0.0167527 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1915  hypothetical protein  39.51 
 
 		 375 aa  43.5  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.395386 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3112  blue (type1) copper domain-containing protein  42.42 
 
 		 159 aa  43.1  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2975  copper tolerance protein  42.11 
 
 		 143 aa  41.6  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.226437  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0759  blue (type1) copper domain-containing protein  29.17 
 
 		 287 aa  41.6  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00521723  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1147  hypothetical protein  28.74 
 
 		 128 aa  40.8  0.008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>