More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3165 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_3165  aldo/keto reductase  100 
 
 
326 aa  648    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.148665  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12920  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  67.58 
 
 
330 aa  432  1e-120  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0782  aldo/keto reductase  64.55 
 
 
330 aa  414  9.999999999999999e-116  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3749  aldo/keto reductase  62.8 
 
 
326 aa  396  1e-109  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1764  aldo/keto reductase  61.89 
 
 
327 aa  389  1e-107  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0110946 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1573  aldo/keto reductase  60.12 
 
 
331 aa  389  1e-107  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.91818  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2488  aldo/keto reductase  60.12 
 
 
330 aa  386  1e-106  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0175  aldo/keto reductase  65.7 
 
 
309 aa  386  1e-106  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0823113  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1081  aldo/keto reductase  60.67 
 
 
327 aa  373  1e-102  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.128024  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2079  aldo/keto reductase  61.77 
 
 
338 aa  374  1e-102  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1777  aldo/keto reductase  60.37 
 
 
327 aa  369  1e-101  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.578556  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4002  aldo/keto reductase  60.06 
 
 
328 aa  367  1e-100  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3419  aldo/keto reductase  56.4 
 
 
328 aa  358  7e-98  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5009  aldo/keto reductase  58.84 
 
 
328 aa  358  9.999999999999999e-98  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5904  aldo/keto reductase  60.82 
 
 
317 aa  354  8.999999999999999e-97  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.407545  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1674  putative oxidoreductase  58.72 
 
 
325 aa  352  5e-96  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.165877  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2046  aldo/keto reductase  57.19 
 
 
325 aa  352  5.9999999999999994e-96  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.259437 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01130  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  55.52 
 
 
345 aa  350  2e-95  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3198  aldo/keto reductase  55.79 
 
 
326 aa  329  4e-89  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1253  aldo/keto reductase  53.05 
 
 
328 aa  328  8e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.131134  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1797  aldo/keto reductase  53.05 
 
 
328 aa  327  1.0000000000000001e-88  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1184  aldo/keto reductase  50.76 
 
 
329 aa  325  9e-88  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2410  aldo/keto reductase  51.64 
 
 
331 aa  323  2e-87  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0936644  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2005  aldo/keto reductase  52.49 
 
 
339 aa  322  6e-87  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.188789  normal  0.288175 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1344  aldo/keto reductase  52.13 
 
 
328 aa  316  4e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.310096  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0234  aldo/keto reductase  46.34 
 
 
328 aa  316  4e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0871019 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0146  aldo/keto reductase  49.24 
 
 
327 aa  315  9.999999999999999e-85  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.743062 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2503  aldo/keto reductase  42.38 
 
 
328 aa  303  2.0000000000000002e-81  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.652399  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0869  aldo/keto reductase  47.06 
 
 
325 aa  294  2e-78  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2668  aldo/keto reductase  45.51 
 
 
326 aa  291  8e-78  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0177157 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0821  aldo/keto reductase  45.82 
 
 
327 aa  278  6e-74  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.146536 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1479  putative oxidoreducatse  43.34 
 
 
326 aa  273  4.0000000000000004e-72  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2141  aldo/keto reductase  41.41 
 
 
326 aa  264  2e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.186273 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1826  aldo/keto reductase  43.41 
 
 
329 aa  236  4e-61  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1537  aldo/keto reductase  36.59 
 
 
329 aa  169  8e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.499861 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4586  aldo/keto reductase  32.73 
 
 
330 aa  157  2e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00281248  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03950  aldo/keto reductase  30.15 
 
 
312 aa  156  4e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.168395  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1762  aldo/keto reductase  37.17 
 
 
327 aa  152  7e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.795834  normal  0.385791 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0423  aldo/keto reductase  31.49 
 
 
323 aa  151  1e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0304393 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2866  D-threo-aldose 1-dehydrogenase  31.03 
 
 
308 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3049  aldo/keto reductase  32.65 
 
 
323 aa  145  7.0000000000000006e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.134681 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2655  aldo/keto reductase  29.78 
 
 
309 aa  145  1e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.841541  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1272  aldo/keto reductase  36.97 
 
 
327 aa  145  1e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.200155  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4552  aldo/keto reductase  29.45 
 
 
323 aa  144  3e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.569712  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0748  aldo/keto reductase  28.57 
 
 
329 aa  142  7e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.58635  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2428  D-threo-aldose 1-dehydrogenase  29.78 
 
 
308 aa  142  7e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.466791 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0514  aldo/keto reductase  27.49 
 
 
332 aa  142  7e-33  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2987  aldo/keto reductase  32.18 
 
 
319 aa  142  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3132  aldo/keto reductase  32.18 
 
 
319 aa  142  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3100  aldo/keto reductase  32.02 
 
 
319 aa  141  1.9999999999999998e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.124867  normal  0.776601 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0143  aldo/keto reductase  34.19 
 
 
318 aa  140  3e-32  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2698  aryl-alcohol dehydrogenase-related oxidoreductase  47.74 
 
 
225 aa  139  7.999999999999999e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.2103  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12040  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  37.85 
 
 
343 aa  139  1e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2283  aldo/keto reductase  32.52 
 
 
357 aa  138  1e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0203552  normal  0.105124 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1831  aldo/keto reductase family oxidoreductase  29.5 
 
 
311 aa  137  2e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0759  aldo/keto reductase  35.03 
 
 
302 aa  137  2e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.206569  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1283  aldo/keto reductase  33.22 
 
 
306 aa  137  2e-31  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1003  aldo/keto reductase  30.63 
 
 
319 aa  137  2e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.350642  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1711  aldo/keto reductase  31.21 
 
 
340 aa  137  2e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.476202 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4632  aldo/keto reductase  30.63 
 
 
319 aa  136  4e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.962922 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1861  aldo/keto reductase family oxidoreductase  29.72 
 
 
311 aa  136  6.0000000000000005e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.474884  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2003  aldo/keto reductase family oxidoreductase  29.72 
 
 
311 aa  136  6.0000000000000005e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.53794  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2037  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  29.72 
 
 
311 aa  136  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.1767399999999999e-20 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1815  aldo/keto reductase family oxidoreductase  30.03 
 
 
311 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.809952  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2005  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  30.59 
 
 
311 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6576  aldo/keto reductase  36.05 
 
 
349 aa  135  9.999999999999999e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.455998  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0494  aldo/keto reductase  30.51 
 
 
315 aa  135  9.999999999999999e-31  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.722341 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2080  aldo/keto reductase family oxidoreductase  29.41 
 
 
311 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0058504  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2116  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  29.41 
 
 
311 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.638189  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1866  aldo/keto reductase  29.41 
 
 
311 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3304  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  29.51 
 
 
311 aa  134  3e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00236042 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3607  aldo/keto reductase  32.8 
 
 
331 aa  134  3e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6755  aldo/keto reductase  31.58 
 
 
333 aa  133  3.9999999999999996e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.978262  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2138  aldo/keto reductase  27.16 
 
 
327 aa  133  3.9999999999999996e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.111642  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1282  aldo/keto reductase  36.44 
 
 
346 aa  133  3.9999999999999996e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10970  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  35.47 
 
 
327 aa  133  5e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3050  aldo/keto reductase  33.03 
 
 
319 aa  132  6e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0652752  normal  0.843265 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3036  aldo/keto reductase  35.22 
 
 
328 aa  132  9e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0625383  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7603  aldo/keto reductase  35.13 
 
 
326 aa  131  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4295  aldo/keto reductase  33.65 
 
 
327 aa  131  1.0000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0895367  normal  0.198699 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1185  aldo/keto reductase  28.57 
 
 
319 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0397337 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1920  aldo/keto reductase  30.03 
 
 
319 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.770373  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1002  aldo/keto reductase  33.13 
 
 
317 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.11413 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2442  aldo/keto reductase  34.89 
 
 
309 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0966  aldo/keto reductase  33.13 
 
 
317 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0713951 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2439  putative aldo/keto reductase  35.03 
 
 
341 aa  129  6e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.608138  decreased coverage  0.000840189 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0968  aldo/keto reductase  35.44 
 
 
349 aa  129  7.000000000000001e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00511053 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3524  aldo/keto reductase  39.88 
 
 
321 aa  129  8.000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2287  aldo/keto reductase  32.9 
 
 
330 aa  129  8.000000000000001e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000000438369  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2829  aldo/keto reductase  33.97 
 
 
341 aa  129  8.000000000000001e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4943  aldo/keto reductase  36.59 
 
 
333 aa  128  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.020989  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0148  aldo/keto reductase  35.4 
 
 
352 aa  128  1.0000000000000001e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.243266  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0899  aldo/keto reductase  29.32 
 
 
319 aa  128  2.0000000000000002e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.666079  normal  0.29354 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3576  oxidoreductase  29.41 
 
 
323 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0243  Aryl-alcohol dehydrogenase related enzyme  28.8 
 
 
305 aa  127  2.0000000000000002e-28  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5158  aldo/keto reductase  32.53 
 
 
331 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0244  aldo/keto reductase family oxidoreductase  31.46 
 
 
312 aa  127  3e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49800  oxidoreductase  32.36 
 
 
329 aa  127  3e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3281  aldo/keto reductase  31.53 
 
 
351 aa  127  4.0000000000000003e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0667  aldo/keto reductase  33.23 
 
 
302 aa  127  4.0000000000000003e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>