21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0891 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_0891  hypothetical protein  100 
 
 		 352 aa  663    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0621  hypothetical protein  32.17 
 
 		 366 aa  72  0.00000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00805323 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3466  SH3 type 3 domain-containing protein  50.91 
 
 		 1281 aa  64.7  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.180669  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4391  hypothetical protein  31.55 
 
 		 205 aa  55.8  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.531521  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0836  hypothetical protein  57.58 
 
 		 268 aa  55.1  0.000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000351202 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1095  collagen adhesion protein  36.73 
 
 		 2272 aa  53.5  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0612  hypothetical protein  30.13 
 
 		 210 aa  51.2  0.00003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0046816 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4210  collagen adhesion protein  36.78 
 
 		 2179 aa  51.2  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.950826  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0610  pullulanase, type I  30.25 
 
 		 1888 aa  49.3  0.0001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2288  serine/threonine protein kinase  53.57 
 
 		 771 aa  48.5  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000513908 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0810  laminin G  49.21 
 
 		 433 aa  48.5  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.478954  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1710  hypothetical protein  44.58 
 
 		 522 aa  47.4  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.636106  normal  0.107463 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0889  hypothetical protein  30.23 
 
 		 218 aa  46.6  0.0007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4505  PT repeat-containing protein  47.3 
 
 		 453 aa  45.1  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1612  Pectate lyase/Amb allergen  45.83 
 
 		 1409 aa  44.7  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3078  cellulosome anchoring protein, cohesin region  46.48 
 
 		 2313 aa  44.3  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44995  predicted protein  32.35 
 
 		 1217 aa  43.9  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00833272  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0267  type 3a, cellulose-binding  34.11 
 
 		 671 aa  43.5  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44994  predicted protein  35.63 
 
 		 840 aa  43.5  0.006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0685164  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48493  predicted protein  42.42 
 
 		 551 aa  43.5  0.006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.0000192267  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1986  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  27.14 
 
 		 257 aa  43.1  0.008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>