More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0232 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_0232  Cellulose synthase (UDP-forming)  100 
 
 		 544 aa  1110    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0230  Cellulose synthase (UDP-forming)  36.96 
 
 		 586 aa  242  1e-62  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.634513  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6029  cellulose synthase (UDP-forming)  33.33 
 
 		 712 aa  236  8e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3154  glycosyl transferase family 2  33.4 
 
 		 620 aa  224  3e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00273511 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2377  cellulose synthase (UDP-forming)  33.47 
 
 		 716 aa  220  5e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.77594  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1834  glycosyl transferase family 2  33.02 
 
 		 591 aa  220  5e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000172396  normal  0.276871 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3677  glycosyl transferase family protein  32.07 
 
 		 579 aa  208  2e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.846949  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3042  Cellulose synthase (UDP-forming)  31.31 
 
 		 980 aa  207  5e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0324719 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1978  cellulose synthase (UDP-forming)  34.2 
 
 		 788 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.693808 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0333  cellulose synthase  34.2 
 
 		 788 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.963251  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3940  cellulose synthase (UDP-forming)  31.48 
 
 		 699 aa  202  9.999999999999999e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0284472 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3895  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  32.16 
 
 		 702 aa  200  7e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0797  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.86 
 
 		 845 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.429971  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3128  glycosyl transferase family 2  31.7 
 
 		 1231 aa  197  5.000000000000001e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3521  cellulose synthase (UDP-forming)  29.6 
 
 		 855 aa  195  1e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0192109  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1027  cellulose synthase, catalytic subunit  29.17 
 
 		 739 aa  194  2e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1585  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.78 
 
 		 848 aa  194  4e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.161966  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2013  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.78 
 
 		 848 aa  194  4e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.508961  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2226  cellulose synthase, catalytic subunit (UDP-forming)  31.57 
 
 		 846 aa  194  4e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.467064  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0691  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.78 
 
 		 848 aa  194  4e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.227734  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0626  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.28 
 
 		 846 aa  194  5e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0631818  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4083  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  30.52 
 
 		 696 aa  192  1e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4173  hypothetical protein  38.02 
 
 		 778 aa  192  1e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.703833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0962  cellulose synthase (UDP-forming)  31 
 
 		 788 aa  192  1e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.373289 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1921  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  33.33 
 
 		 846 aa  191  2e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.18381 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0073  cellulose synthase catalytic subunit  30.9 
 
 		 899 aa  191  4e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1263  cellulose synthase (UDP-forming)  30.15 
 
 		 845 aa  190  5e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1297  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  30.15 
 
 		 845 aa  190  5.999999999999999e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0874534  normal  0.0554868 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4530  cellulose synthase (UDP-forming)  32.55 
 
 		 845 aa  189  1e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.365333 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0076  cellulose synthase catalytic subunit  30.69 
 
 		 899 aa  189  1e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3930  cellulose synthase catalytic subunit  30.08 
 
 		 872 aa  188  3e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.475933  normal  0.886251 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2256  glycosyl transferase family protein  29.31 
 
 		 857 aa  187  5e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.548829 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1518  glycosyl transferase family 2  29.82 
 
 		 547 aa  187  5e-46  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3827  cellulose synthase catalytic subunit  29.17 
 
 		 874 aa  186  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3814  cellulose synthase catalytic subunit  29.17 
 
 		 874 aa  186  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.24815 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3995  cellulose synthase catalytic subunit  29.17 
 
 		 874 aa  185  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3891  cellulose synthase catalytic subunit  29.17 
 
 		 874 aa  185  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.894407  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3197  cellulose synthase catalytic subunit  31.32 
 
 		 869 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.611786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1171  cellulose synthase (UDP-forming)  31.67 
 
 		 909 aa  185  2.0000000000000003e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.917806  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3935  cellulose synthase catalytic subunit  29.17 
 
 		 874 aa  185  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0933136  normal  0.932976 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2140  cellulose synthase, catalytic subunit (UDP-forming)  31.43 
 
 		 848 aa  183  6e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.659899  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2635  cellulose synthase catalytic subunit  31.11 
 
 		 869 aa  183  8.000000000000001e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0208  cellulose synthase (UDP-forming)  31.47 
 
 		 564 aa  183  8.000000000000001e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0946427  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03381  cellulose synthase, catalytic subunit  28.84 
 
 		 872 aa  182  1e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.634734  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0180  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  28.84 
 
 		 872 aa  182  1e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03334  hypothetical protein  28.84 
 
 		 872 aa  182  1e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.461813  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0184  cellulose synthase catalytic subunit  28.84 
 
 		 872 aa  182  1e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4021  cellulose synthase catalytic subunit  28.84 
 
 		 872 aa  182  1e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2151  cellulose synthase (UDP-forming)  30.09 
 
 		 737 aa  182  1e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.242321 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3842  cellulose synthase catalytic subunit  28.84 
 
 		 872 aa  182  1e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.870898  normal  0.567384 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0903  cellulose synthase (UDP-forming)  29.21 
 
 		 845 aa  182  1e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.314195  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1385  cellulose synthase (UDP-forming)  29.21 
 
 		 845 aa  182  1e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.240967  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1363  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  29.21 
 
 		 845 aa  181  2e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.176892 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4898  cellulose synthase catalytic subunit  28.63 
 
 		 872 aa  181  4e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0148  cellulose synthase catalytic subunit  29.35 
 
 		 867 aa  181  4e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.805146 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0932  cellulose synthase catalytic subunit  28.74 
 
 		 872 aa  180  5.999999999999999e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3128  cellulose synthase (UDP-forming)  30.2 
 
 		 607 aa  180  5.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.887302  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0992  cellulose synthase (UDP-forming)  31.58 
 
 		 501 aa  180  7e-44  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.832352 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2136  cellulose synthase catalytic subunit  30.9 
 
 		 869 aa  180  7e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3597  glycosyltransferase  28.19 
 
 		 741 aa  180  7e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3256  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  28.73 
 
 		 743 aa  178  2e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.843653 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3939  cellulose synthase catalytic subunit  28.42 
 
 		 872 aa  177  4e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.556774  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0340  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  30.31 
 
 		 503 aa  173  6.999999999999999e-42  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00114469  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5208  cellulose synthase (UDP-forming)  32.47 
 
 		 726 aa  172  1e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.823689  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1279  Cellulose synthase (UDP-forming)  35.54 
 
 		 672 aa  172  2e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.14202  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1245  Cellulose synthase (UDP-forming)  35.54 
 
 		 672 aa  172  2e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.731886  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1133  cellulose synthase (UDP-forming)  35.54 
 
 		 672 aa  171  3e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0362124  normal  0.973174 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1339  Cellulose synthase (UDP-forming)  29.9 
 
 		 718 aa  171  4e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3509  cellulose synthase (UDP-forming)  32.59 
 
 		 666 aa  169  2e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.901561  normal  0.396718 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0107  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  30.59 
 
 		 811 aa  169  2e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.885965 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1847  glycosyl transferase family 2  33.25 
 
 		 1140 aa  169  2e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1367  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  31.89 
 
 		 831 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.393143  normal  0.0964081 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1204  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  31.35 
 
 		 730 aa  167  4e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1567  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  32.08 
 
 		 834 aa  167  5e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.554043  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0374  cellulose synthase (UDP-forming)  34.13 
 
 		 661 aa  167  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5836  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  27.84 
 
 		 734 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.481815 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3726  cellulose synthase (UDP-forming)  35.19 
 
 		 664 aa  166  1.0000000000000001e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2040  cellulose synthase (UDP-forming)  28.04 
 
 		 734 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0510287  normal  0.186236 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1293  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  31.71 
 
 		 730 aa  164  3e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.541147  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0275  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  31.37 
 
 		 794 aa  164  3e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1568  cellulose synthase catalytic subunit  30.96 
 
 		 665 aa  164  3e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.479707 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05090  Cellulose synthase subunit AB  32.2 
 
 		 1455 aa  164  3e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4645  Cellulose synthase (UDP-forming)  33.44 
 
 		 664 aa  164  6e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.998424 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1312  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  30.81 
 
 		 822 aa  163  7e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.779544  normal  0.794607 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4799  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  31.35 
 
 		 930 aa  163  8.000000000000001e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.105872 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2031  glycosyl transferase family protein  34.38 
 
 		 1140 aa  162  2e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.550572  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3398  Cellulose synthase (UDP-forming)  30.95 
 
 		 768 aa  161  3e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.874799  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1932  glycosyl transferase family 2  34.06 
 
 		 1140 aa  161  3e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.273416  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4805  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  31.28 
 
 		 804 aa  160  6e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.254969  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1778  glycosyl transferase family protein  34.71 
 
 		 1129 aa  159  2e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.073121 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2074  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  26.79 
 
 		 851 aa  157  3e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00117209 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00787  cellulose synthase catalytic subunit  30.87 
 
 		 707 aa  157  7e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2949  glycosyl transferase family 2  36.58 
 
 		 773 aa  155  2e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.496141 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1398  cellulose synthase (UDP-forming)  28.78 
 
 		 740 aa  155  2e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.00289904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0298  cellulose synthase (UDP-forming)  27.27 
 
 		 618 aa  155  2e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.78317  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5535  cellulose synthase  30.93 
 
 		 729 aa  154  4e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3741  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  31.36 
 
 		 810 aa  154  5e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7195  putative glycosyl transferase  29.85 
 
 		 888 aa  153  8e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.80662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1704  glycosyl transferase family protein  28.86 
 
 		 514 aa  152  1e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3169  Cellulose synthase (UDP-forming)  36.24 
 
 		 773 aa  152  1e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>