28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_3522 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_3522  outer membrane protein, putative  100 
 
 		 201 aa  395  1e-109  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.550518  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0073  outer membrane protein, putative  64.36 
 
 		 200 aa  264  5.999999999999999e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2408  OmpW family protein  51.46 
 
 		 205 aa  196  3e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00013458  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3960  hypothetical protein  50.24 
 
 		 209 aa  182  3e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000187243  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0290  hypothetical protein  48.29 
 
 		 199 aa  181  6e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0309  hypothetical protein  46.34 
 
 		 199 aa  171  5e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000000916474  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2945  hypothetical protein  47.34 
 
 		 199 aa  168  6e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000242113  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1159  OmpW family protein  39.73 
 
 		 224 aa  150  8.999999999999999e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.14248  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0561  hypothetical protein  39.04 
 
 		 196 aa  125  4.0000000000000003e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.01609e-34 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0549  hypothetical protein  37.3 
 
 		 196 aa  122  3e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000486601  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1840  OmpW family protein  38.21 
 
 		 210 aa  95.1  5e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5886  OmpW family outer membrane protein  26.7 
 
 		 245 aa  52.8  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5426  OmpW  32.14 
 
 		 216 aa  49.3  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.73158  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000903  outer membrane protein W precursor  35.14 
 
 		 214 aa  47.8  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0976  OmpW family protein  28.87 
 
 		 210 aa  47.8  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.591363 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3290  putative outer membrane signal peptide protein  31.93 
 
 		 196 aa  47.4  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.106393  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4836  OmpW family protein  28.64 
 
 		 204 aa  45.8  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0700  OmpW family protein  29.14 
 
 		 202 aa  43.5  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.496076  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1244  OmpW  29.82 
 
 		 195 aa  43.5  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  unclonable  0.00000000847221  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0946  putative outer membrane protein precursor of unknown function  27.45 
 
 		 243 aa  42.4  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.270942  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2819  hypothetical protein  29.46 
 
 		 397 aa  42.4  0.005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0220  OmpW family protein  29.19 
 
 		 198 aa  42  0.006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.221002 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2289  OmpW family protein  29.41 
 
 		 195 aa  42  0.007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.473084  normal  0.0354952 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1585  OmpW family protein  29.41 
 
 		 195 aa  42  0.007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2967  outer membrane signal peptide protein  27.69 
 
 		 224 aa  41.6  0.008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0915  OmpW family protein  29.77 
 
 		 217 aa  41.6  0.009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0499  lipid A oxidase  33.33 
 
 		 224 aa  41.6  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.309577 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06904  outer membrane protein W  32.43 
 
 		 213 aa  41.2  0.01  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>