55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_0393 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_0393  colicin V production protein  100 
 
 		 178 aa  348  3e-95  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3091  CvpA family protein  58.43 
 
 		 178 aa  206  1e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4049  colicin V production protein  52.73 
 
 		 169 aa  167  1e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.868969  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3791  Colicin V production protein  55.21 
 
 		 162 aa  159  3e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3696  Colicin V production protein  55.83 
 
 		 162 aa  159  3e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3051  colicin V production protein  37.32 
 
 		 163 aa  90.5  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00964388  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2681  CvpA family protein  31.13 
 
 		 166 aa  76.3  0.0000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1015  Colicin V production protein  44.17 
 
 		 161 aa  75.1  0.0000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.280554  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2194  Colicin V production protein  37.9 
 
 		 186 aa  70.9  0.00000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0510  Colicin V production protein  30.56 
 
 		 190 aa  63.5  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.103168  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05660  Colicin V production protein  27.7 
 
 		 163 aa  62  0.000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_180  integral membrane colicin V production protein  34 
 
 		 162 aa  57.8  0.00000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00284357  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0780  colicin V production protein  27.27 
 
 		 173 aa  57.4  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0161  colicin V production protein  34.67 
 
 		 162 aa  54.3  0.0000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.781375  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0356  Colicin V production protein  34.55 
 
 		 169 aa  54.3  0.0000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0192  cvpA family protein  34 
 
 		 162 aa  53.9  0.000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0223  CvpA family protein  27.84 
 
 		 206 aa  52.4  0.000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.903437  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1297  hypothetical protein  28.8 
 
 		 177 aa  51.2  0.000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1298  hypothetical protein  28.12 
 
 		 177 aa  50.8  0.000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1807  Colicin V production protein  28.83 
 
 		 165 aa  50.8  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02100  hypothetical protein  32.69 
 
 		 178 aa  49.7  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1977  colicin V production transmembrane protein  27.93 
 
 		 165 aa  49.7  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.16947 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1644  CvpA family protein  28.68 
 
 		 218 aa  49.3  0.00003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0823  hypothetical protein  33.07 
 
 		 178 aa  48.9  0.00004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1966  colicin V production protein  27.42 
 
 		 166 aa  47.8  0.00008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.530952 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0777  colicin V production protein  26.28 
 
 		 188 aa  47  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000136777  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0448  cvpA family protein  29.91 
 
 		 187 aa  47.4  0.0001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.179388  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1672  colicin V production protein  30.97 
 
 		 163 aa  47.4  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02505  colicin V production protein  25.2 
 
 		 248 aa  47.4  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.785902  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1044  Colicin V production protein  27.7 
 
 		 188 aa  47.4  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.572812 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0771  colicin V production protein  32.26 
 
 		 182 aa  45.8  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1558  cvpA family protein  29.06 
 
 		 190 aa  45.8  0.0003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.383217  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0422  cvpA family protein  29.06 
 
 		 187 aa  46.2  0.0003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00865734  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3799  colicin V production protein  33.02 
 
 		 160 aa  44.7  0.0007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1154  Colicin V production protein  28.46 
 
 		 162 aa  44.7  0.0008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.418061  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1560  colicin V production protein  27.27 
 
 		 185 aa  44.3  0.0009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.328677  normal  0.213335 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2490  CvpA family protein  37.84 
 
 		 177 aa  44.3  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.904842  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1533  colicin V production protein  27.27 
 
 		 185 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0578  Colicin V production protein  27.27 
 
 		 184 aa  43.9  0.001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.637194  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3762  colicin V production protein  27.27 
 
 		 185 aa  43.9  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1999  colicin V production protein  26.67 
 
 		 185 aa  43.5  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.148494  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0733  Colicin V production protein  34.52 
 
 		 167 aa  43.1  0.002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.018844  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0129  membrane protein CvpA, putative  27.45 
 
 		 196 aa  43.1  0.002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.058893  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2300  colicin V production protein  28.91 
 
 		 171 aa  43.1  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.113958  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0552  Colicin V production protein  28.18 
 
 		 162 aa  43.1  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2401  colicin V production protein  27.72 
 
 		 234 aa  43.1  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2503  colicin V production protein  29.23 
 
 		 207 aa  42.7  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1051  colicin V production protein  30.28 
 
 		 184 aa  42.4  0.004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0960  colicin V production protein  30.28 
 
 		 184 aa  42.4  0.004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0660005  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1872  colicin V production protein  27.97 
 
 		 159 aa  41.6  0.007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.356571  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0405  colicin V production protein  36.15 
 
 		 236 aa  41.2  0.008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23900  hypothetical protein  36.78 
 
 		 180 aa  41.2  0.008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00157781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2024  hypothetical protein  36.78 
 
 		 184 aa  40.8  0.009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0917  colicin V production protein  32.71 
 
 		 166 aa  41.2  0.009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0486  conserved hypothetical integral membrane protein, CvpA family  24.84 
 
 		 189 aa  40.8  0.01  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>