65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_R0046 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_R0046  tRNA-Ser  100 
 
 		 88 bp  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00798672  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0008  tRNA-Ser  95.45 
 
 		 88 bp  143  8e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  8.59905e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0001  tRNA-Ser  86.36 
 
 		 88 bp  79.8  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0076  tRNA-Ser  88.41 
 
 		 88 bp  73.8  0.000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0040  tRNA-Ser  85.23 
 
 		 88 bp  71.9  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Ser-3  tRNA-Ser  88.24 
 
 		 90 bp  65.9  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.86368  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0054  tRNA-Ser  88.24 
 
 		 90 bp  65.9  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0075  tRNA-Ser  86.96 
 
 		 88 bp  65.9  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0009  tRNA-Ser  93.18 
 
 		 88 bp  63.9  0.000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.39796e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0053  tRNA-Ser  85.51 
 
 		 88 bp  58  0.0000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000572043  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0061  tRNA-Ser  96.88 
 
 		 91 bp  56  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0952351  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0052  tRNA-Ser  82.95 
 
 		 88 bp  56  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.360325 
 
 
-
 
NC_002967  TDE_tRNA-Pseudo-1  tRNA-OTHER  90.7 
 
 		 85 bp  54  0.000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.526537  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0009  tRNA-Ser  86.21 
 
 		 88 bp  52  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.56396 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_R0041  tRNA-Ser  86.21 
 
 		 88 bp  52  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0730439  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0028  tRNA-Ser  96.67 
 
 		 88 bp  52  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000693874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0060  tRNA-Ser  96.67 
 
 		 90 bp  52  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.100748  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_R0051  tRNA-Ser  86.21 
 
 		 88 bp  52  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0001  tRNA-Ser  93.94 
 
 		 91 bp  50.1  0.00009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0024  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 90 bp  50.1  0.00009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000000192923  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0006  tRNA-Ser  91.67 
 
 		 88 bp  48.1  0.0003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Ser-4  tRNA-Ser  93.75 
 
 		 88 bp  48.1  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.57943  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_R0054  tRNA-Ser  93.55 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1169  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 92 bp  46.1  0.001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000109978  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0062  tRNA-Ser  93.55 
 
 		 91 bp  46.1  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000500445  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_R0056  tRNA-Ser  93.55 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.189519  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0060  tRNA-Ser  93.55 
 
 		 91 bp  46.1  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000594401  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0059  tRNA-Ser  93.55 
 
 		 91 bp  46.1  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000119289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0040  tRNA-Ser  93.55 
 
 		 91 bp  46.1  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0094275  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0041  tRNA-Ser  93.55 
 
 		 91 bp  46.1  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00826938  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0060  tRNA-Ser  93.55 
 
 		 91 bp  46.1  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0136432  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0038  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 92 bp  46.1  0.001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0072  tRNA-Ser  93.55 
 
 		 91 bp  46.1  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000100373  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t059  tRNA-Ser  93.55 
 
 		 91 bp  46.1  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000191448  hitchhiker  0.0000692537 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6026  tRNA-Ser  93.55 
 
 		 89 bp  46.1  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.045296 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0082  tRNA-Ser  93.55 
 
 		 91 bp  46.1  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00228786  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET_tRNA-Ser-4  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 92 bp  46.1  0.001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.110057  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0045  tRNA-Ser  96.3 
 
 		 88 bp  46.1  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000000150485  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t031  tRNA-Ser  93.55 
 
 		 91 bp  46.1  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t032  tRNA-Ser  93.55 
 
 		 91 bp  46.1  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t044  tRNA-Ser  93.55 
 
 		 91 bp  46.1  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_4308  tRNA-Ser  93.55 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0020  tRNA-Ser  93.55 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.79696  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0088  tRNA-Ser  93.55 
 
 		 91 bp  46.1  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00139579  hitchhiker  0.0000269185 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0021  tRNA-Ser  93.55 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0080  tRNA-Ser  93.55 
 
 		 91 bp  46.1  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000427026  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0081  tRNA-Ser  93.55 
 
 		 91 bp  46.1  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000367206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0080  tRNA-Ser  93.55 
 
 		 91 bp  46.1  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000011536  normal  0.292608 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0078  tRNA-Ser  93.55 
 
 		 91 bp  46.1  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000000673855  normal  0.197197 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0077  tRNA-Ser  93.55 
 
 		 91 bp  46.1  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000000799433  normal  0.199277 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0099  tRNA-Ser  93.55 
 
 		 91 bp  46.1  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.70942  hitchhiker  0.000224903 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0081  tRNA-Ser  93.55 
 
 		 91 bp  46.1  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000139666  normal  0.289592 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0091  tRNA-Ser  93.55 
 
 		 91 bp  46.1  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00307776  normal  0.28235 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6020  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_R0006  tRNA-Ser  84.48 
 
 		 88 bp  44.1  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.315835 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0034  tRNA-Ser  91.18 
 
 		 91 bp  44.1  0.005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0054  tRNA-Ser  91.18 
 
 		 93 bp  44.1  0.005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000000329774  hitchhiker  1.7085e-24 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0007  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 92 bp  44.1  0.005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000441599  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0044  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 88 bp  44.1  0.005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.919429  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0044  tRNA-Ser  84.48 
 
 		 88 bp  44.1  0.005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.417846 
 
 
-
 
NC_006369  lplt15  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 88 bp  44.1  0.005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppt15  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 88 bp  44.1  0.005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60420  tRNA-Ser  87.1 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0028  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 88 bp  44.1  0.005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.208638  hitchhiker  0.00938841 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0025  tRNA-Ser  91.18 
 
 		 93 bp  44.1  0.005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.325911  normal  0.0387574 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>