46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_3355 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_3355  Methyltransferase type 11  100 
 
 		 285 aa  598  1e-170  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.109468  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1373  glycosyl transferase group 1  34.67 
 
 		 689 aa  128  9.000000000000001e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.167388  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4045  Methyltransferase type 12  29.75 
 
 		 249 aa  71.2  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.741361 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1253  hypothetical protein  29.09 
 
 		 255 aa  68.2  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.470333  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2117  Methyltransferase type 11  23.39 
 
 		 221 aa  54.7  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4283  methyltransferase type 11  34.65 
 
 		 257 aa  52.4  0.000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.706274  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1147  methyltransferase type 12  32.54 
 
 		 288 aa  48.9  0.00009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.941804  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2892  hypothetical protein  26.67 
 
 		 621 aa  48.9  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4502  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.63 
 
 		 244 aa  47.4  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.166087 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2225  Methyltransferase type 11  33.03 
 
 		 281 aa  46.2  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.449222  normal  0.183181 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1423  methyltransferase type 11  24.29 
 
 		 279 aa  45.8  0.0007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5793  Methyltransferase type 11  23.76 
 
 		 219 aa  45.8  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3053  methyltransferase type 12  27.93 
 
 		 332 aa  45.4  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2507  methyltransferase type 12  32.35 
 
 		 272 aa  44.7  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2589  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.16 
 
 		 262 aa  45.1  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.672659 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1837  methyltransferase type 12  31.37 
 
 		 302 aa  44.7  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.322151  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1227  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  24.28 
 
 		 232 aa  44.7  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000143556  normal  0.238391 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1845  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  23.73 
 
 		 234 aa  43.9  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00431464  normal  0.756459 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1318  glycosyl transferase family protein  21.9 
 
 		 1314 aa  44.3  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.581884  normal  0.368047 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1317  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  23.28 
 
 		 229 aa  43.9  0.003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000124117  hitchhiker  3.42912e-24 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1958  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  23.9 
 
 		 232 aa  43.9  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.937117  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1074  methyltransferase type 11  25.22 
 
 		 436 aa  44.3  0.003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.257037  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0711  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  22.45 
 
 		 247 aa  43.9  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0438785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1365  methyltransferase type 12  27.39 
 
 		 189 aa  43.5  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0655112  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2740  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26 
 
 		 238 aa  43.5  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2861  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  21.49 
 
 		 240 aa  43.5  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0308666  decreased coverage  0.000000000135895 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2963  methyltransferase type 12  25 
 
 		 303 aa  43.5  0.004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0752  methyltransferase type 11  30.69 
 
 		 214 aa  43.5  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2203  trans-aconitate 2-methyltransferase  24.37 
 
 		 258 aa  43.1  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.968625  hitchhiker  0.00608144 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0893  Methyltransferase type 12  27.89 
 
 		 190 aa  43.1  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000264031  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2768  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.21 
 
 		 247 aa  43.1  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1858  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  23.08 
 
 		 245 aa  42.7  0.006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2177  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  28 
 
 		 345 aa  42.7  0.007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.225032  hitchhiker  0.000137631 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1603  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  27.37 
 
 		 251 aa  42.7  0.007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.905646  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1055  glycosyl transferase family 2  25.17 
 
 		 1162 aa  42.7  0.007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.289988  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1458  methyltransferase type 11  24.37 
 
 		 265 aa  42.4  0.008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3368  Methyltransferase type 12  26.53 
 
 		 190 aa  42.4  0.008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2928  SAM-dependent methyltransferase  28.26 
 
 		 218 aa  42.4  0.008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000530736  hitchhiker  0.00484041 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0712  Methyltransferase type 11  28.45 
 
 		 246 aa  42.4  0.008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1804  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  29.41 
 
 		 422 aa  42.4  0.008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.399037  hitchhiker  0.0000000665268 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1538  Generic methyltransferase  26.73 
 
 		 238 aa  42.4  0.009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23220  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  24.43 
 
 		 232 aa  42.4  0.009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0574161  hitchhiker  0.00443225 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2384  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  27.62 
 
 		 258 aa  42.4  0.009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.528666  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2150  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  21.82 
 
 		 236 aa  42  0.01  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7600  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  24.51 
 
 		 254 aa  42.4  0.01  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.906312  normal  0.192206 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0720  hypothetical protein  25.86 
 
 		 234 aa  42  0.01  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.842265 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>