38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_1798 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_1798  hypothetical protein  100 
 
 
166 aa  347  5e-95  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0394364  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0148  hypothetical protein  35.04 
 
 
153 aa  82  0.000000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1556  hypothetical protein  35.85 
 
 
130 aa  66.6  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.606485 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1000  hypothetical protein  42.55 
 
 
131 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1070  hypothetical protein  32.48 
 
 
123 aa  59.3  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00610238  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3578  hypothetical protein  26.24 
 
 
162 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.461789  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4144  hypothetical protein  31.75 
 
 
127 aa  52.4  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.752301 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0947  hypothetical protein  30.46 
 
 
195 aa  52.4  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.936738 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6143  hypothetical protein  32.52 
 
 
127 aa  51.2  0.000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3349  hypothetical protein  24.11 
 
 
142 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.42671  normal  0.0171262 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0488  hypothetical protein  30.89 
 
 
127 aa  50.1  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0572  hypothetical protein  30.16 
 
 
127 aa  50.1  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.541327  hitchhiker  0.00799235 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2199  hypothetical protein  32.8 
 
 
127 aa  50.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.699425  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2873  hypothetical protein  31.71 
 
 
127 aa  49.3  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2813  hypothetical protein  32.8 
 
 
127 aa  50.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2731  hypothetical protein  31.71 
 
 
127 aa  49.3  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1519  hypothetical protein  28.18 
 
 
152 aa  48.9  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2824  hypothetical protein  32.8 
 
 
127 aa  48.9  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2309  hypothetical protein  28.45 
 
 
181 aa  47.8  0.00007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00812325 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0458  hypothetical protein  32.77 
 
 
135 aa  46.6  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5108  hypothetical protein  29.17 
 
 
129 aa  46.6  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0303  hypothetical protein  29.6 
 
 
127 aa  45.4  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4907  hypothetical protein  33.33 
 
 
128 aa  45.1  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3965  hypothetical protein  27.74 
 
 
138 aa  45.4  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0275074  normal  0.202471 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0550  hypothetical protein  31.4 
 
 
128 aa  45.1  0.0005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.906026  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2912  hypothetical protein  31.4 
 
 
127 aa  44.7  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0566  hypothetical protein  31.4 
 
 
127 aa  44.7  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1483  hypothetical protein  31.4 
 
 
128 aa  45.1  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0105  hypothetical protein  31.4 
 
 
127 aa  44.7  0.0005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.516432  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2101  hypothetical protein  30 
 
 
141 aa  45.1  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0911395  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0733  hypothetical protein  31.4 
 
 
128 aa  45.1  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.253076  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3581  hypothetical protein  28.1 
 
 
160 aa  43.5  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0455  hypothetical protein  30 
 
 
144 aa  43.5  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.596707  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6643  hypothetical protein  25.74 
 
 
123 aa  42  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.174293  normal  0.0338703 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1730  hypothetical protein  28.28 
 
 
149 aa  42  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000217513  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5385  hypothetical protein  25.89 
 
 
125 aa  41.6  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2267  hypothetical protein  29.55 
 
 
148 aa  41.6  0.006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0150  hypothetical protein  27.27 
 
 
153 aa  40.8  0.008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>