107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_1015 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_1015  Colicin V production protein  100 
 
 		 161 aa  308  2.9999999999999997e-83  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.280554  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3696  Colicin V production protein  40.67 
 
 		 162 aa  88.2  5e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3791  Colicin V production protein  38.67 
 
 		 162 aa  85.9  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3051  colicin V production protein  44.53 
 
 		 163 aa  82.4  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00964388  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0771  colicin V production protein  33.56 
 
 		 182 aa  82.8  0.000000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3091  CvpA family protein  39.68 
 
 		 178 aa  79.7  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0393  colicin V production protein  44.34 
 
 		 178 aa  80.1  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4049  colicin V production protein  34.32 
 
 		 169 aa  77.8  0.00000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.868969  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0510  Colicin V production protein  33.33 
 
 		 190 aa  71.2  0.000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.103168  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0356  Colicin V production protein  37.82 
 
 		 169 aa  68.6  0.00000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0161  colicin V production protein  35.43 
 
 		 162 aa  67.4  0.00000000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.781375  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0192  cvpA family protein  34.65 
 
 		 162 aa  67.4  0.00000000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2681  CvpA family protein  31.68 
 
 		 166 aa  66.6  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1298  hypothetical protein  30.66 
 
 		 177 aa  63.9  0.000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1297  hypothetical protein  30.66 
 
 		 177 aa  63.5  0.000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_180  integral membrane colicin V production protein  33.07 
 
 		 162 aa  62.8  0.000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00284357  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0780  colicin V production protein  28.1 
 
 		 173 aa  59.3  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1872  colicin V production protein  33.04 
 
 		 159 aa  58.9  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.356571  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1807  Colicin V production protein  35.09 
 
 		 165 aa  58.9  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1966  colicin V production protein  33.61 
 
 		 166 aa  58.5  0.00000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.530952 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1558  cvpA family protein  26.17 
 
 		 190 aa  58.2  0.00000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.383217  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1977  colicin V production transmembrane protein  31.47 
 
 		 165 aa  57.8  0.00000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.16947 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0448  cvpA family protein  26.85 
 
 		 187 aa  57.8  0.00000006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.179388  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0486  conserved hypothetical integral membrane protein, CvpA family  26.9 
 
 		 189 aa  57.8  0.00000007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0422  cvpA family protein  26.85 
 
 		 187 aa  57  0.0000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00865734  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2303  colicin V production protein  35.59 
 
 		 162 aa  56.6  0.0000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2490  CvpA family protein  38.32 
 
 		 177 aa  55.1  0.0000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.904842  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0552  Colicin V production protein  28.18 
 
 		 162 aa  54.3  0.0000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0223  CvpA family protein  33.07 
 
 		 206 aa  53.5  0.000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.903437  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3799  colicin V production protein  33.33 
 
 		 160 aa  51.6  0.000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1329  Colicin V production protein  30.83 
 
 		 192 aa  51.6  0.000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0804105  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0823  hypothetical protein  29.73 
 
 		 178 aa  51.6  0.000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2194  Colicin V production protein  31.1 
 
 		 186 aa  52  0.000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0524  bacteriocin production protein  29.73 
 
 		 163 aa  51.6  0.000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00361211  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1482  colicin V production protein  31.43 
 
 		 162 aa  49.7  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.842254 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1655  colicin V production protein  33.9 
 
 		 162 aa  49.7  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00513231  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2211  Colicin V production protein  35.45 
 
 		 171 aa  49.7  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1429  colicin V production protein  31.43 
 
 		 162 aa  48.9  0.00003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.550584  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1494  colicin V production protein  31.43 
 
 		 162 aa  48.9  0.00003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0578  Colicin V production protein  30.97 
 
 		 184 aa  48.9  0.00003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.637194  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2073  2-oxoglutarate dehydrogenase, E1 component  28.95 
 
 		 168 aa  48.1  0.00005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.576692  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2981  colicin V production protein  33.05 
 
 		 162 aa  48.1  0.00005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0259461  normal  0.577017 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1999  colicin V production protein  30.97 
 
 		 185 aa  47.8  0.00006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.148494  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0696  colicin V production protein  22.31 
 
 		 200 aa  47.8  0.00006  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.518135  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2739  colicin V production protein  30.71 
 
 		 162 aa  47.8  0.00006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2438  colicin V production protein  31.43 
 
 		 162 aa  47.8  0.00006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2756  colicin V production protein  30.71 
 
 		 162 aa  47.8  0.00006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2833  colicin V production protein  30.71 
 
 		 162 aa  47.8  0.00006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.021527 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2131  Colicin V production protein  35.09 
 
 		 165 aa  48.1  0.00006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.519275  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1620  Colicin V production protein  30.71 
 
 		 162 aa  47.8  0.00006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0904729  normal  0.930325 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05660  Colicin V production protein  27.43 
 
 		 163 aa  47.8  0.00006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3812  cvpA family protein  33.01 
 
 		 195 aa  47.4  0.00008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1667  colicin V production protein  33.01 
 
 		 195 aa  47.4  0.00008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3762  colicin V production protein  30.97 
 
 		 185 aa  47.4  0.00008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3242  colicin V production protein  29.41 
 
 		 179 aa  47.4  0.00008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00343248  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1533  colicin V production protein  30.97 
 
 		 185 aa  47.4  0.00008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2147  colicin V production protein  31.65 
 
 		 162 aa  47  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.936952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1620  colicin V production protein  32.2 
 
 		 162 aa  46.6  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3077  Colicin V production protein  29.46 
 
 		 158 aa  47  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.770622 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3065  colicin V production protein  30 
 
 		 162 aa  46.2  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2300  colicin V production protein  31.58 
 
 		 171 aa  46.2  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.113958  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0307  CvpA family protein  24.39 
 
 		 206 aa  46.2  0.0002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.617948  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1608  colicin V production protein  29.41 
 
 		 162 aa  46.2  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1560  colicin V production protein  30.09 
 
 		 185 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.328677  normal  0.213335 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4680  cvpA family protein  29.41 
 
 		 179 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0235312  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4449  cvpA family protein  29.41 
 
 		 179 aa  45.4  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00103413  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4287  colicin V production protein  29.41 
 
 		 179 aa  45.4  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000285679  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4298  colicin V production protein  29.41 
 
 		 179 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000698337  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4796  cvpA family protein  29.41 
 
 		 179 aa  45.4  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0185853  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002878  colicin V production protein  28.29 
 
 		 163 aa  45.4  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1489  colicin V production protein  32.14 
 
 		 166 aa  45.8  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000231949  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03096  hypothetical protein  28.95 
 
 		 163 aa  45.4  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1044  Colicin V production protein  25.9 
 
 		 188 aa  45.8  0.0003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.572812 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4664  cvpA family protein  29.41 
 
 		 179 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0457781  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0574  cvpA family protein  29.41 
 
 		 179 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000461155  normal  0.549376 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4667  cvpA family protein  29.41 
 
 		 179 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000766782 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1398  colicin V production protein  30 
 
 		 162 aa  45.1  0.0004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1144  CvpA family protein  25.86 
 
 		 191 aa  45.1  0.0004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.111431  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2551  colicin V production protein  27.43 
 
 		 162 aa  45.1  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2605  colicin V production protein  27.43 
 
 		 162 aa  45.1  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.685477 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2593  colicin V production protein  27.43 
 
 		 162 aa  45.1  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.272788  normal  0.627447 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2505  colicin V production protein  27.43 
 
 		 162 aa  45.1  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2714  colicin V production protein  27.43 
 
 		 162 aa  45.1  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.134664  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4382  colicin V production protein  29.41 
 
 		 179 aa  44.7  0.0006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000181447  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0367  CvpA family protein  25.71 
 
 		 161 aa  44.3  0.0007  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.202665  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0129  membrane protein CvpA, putative  27.73 
 
 		 196 aa  44.3  0.0008  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.058893  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4680  cvpA family protein  29.41 
 
 		 179 aa  44.3  0.0008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000294849  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02238  membrane protein required for colicin V production  26.55 
 
 		 162 aa  43.5  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1343  Colicin V production protein  26.55 
 
 		 162 aa  43.9  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0732005  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2162  colicin V production protein  32.08 
 
 		 193 aa  43.5  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.340208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2712  colicin V production protein  33.33 
 
 		 170 aa  43.5  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.240429  normal  0.143429 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2464  colicin V production protein  26.55 
 
 		 162 aa  43.5  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2607  colicin V production protein  26.55 
 
 		 162 aa  43.5  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1339  colicin V production protein  26.55 
 
 		 162 aa  43.5  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2469  colicin V production protein  26.55 
 
 		 162 aa  43.5  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2691  colicin V production protein  26.55 
 
 		 162 aa  43.9  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02198  hypothetical protein  26.55 
 
 		 162 aa  43.5  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0999  CvpA family protein  29.92 
 
 		 205 aa  42.7  0.002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000386189  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2862  colicin V production protein  25.66 
 
 		 162 aa  42.4  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.488852  normal  0.252984 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3453  colicin V production protein  26.55 
 
 		 162 aa  42  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>