56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_0868 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_0868  hypothetical protein  100 
 
 
125 aa  251  2.0000000000000002e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0879  hypothetical protein  66.13 
 
 
133 aa  167  4e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.374693  hitchhiker  0.0000252652 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1195  hypothetical protein  54.1 
 
 
145 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.350794  normal  0.0471945 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0855  GTP-binding signal recognition particle  52.46 
 
 
145 aa  131  1.9999999999999998e-30  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.471576  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2551  hypothetical protein  47.54 
 
 
133 aa  130  7.999999999999999e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.311981  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0072  hypothetical protein  47.2 
 
 
134 aa  129  1.0000000000000001e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.391845  normal  0.0725128 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1610  hypothetical protein  52.46 
 
 
151 aa  127  6e-29  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00644955  normal  0.0278049 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1481  hypothetical protein  56.03 
 
 
144 aa  125  1.0000000000000001e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2464  hypothetical protein  49.59 
 
 
135 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1033  hypothetical protein  46.72 
 
 
149 aa  123  7e-28  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2929  hypothetical protein  47.11 
 
 
127 aa  119  1.9999999999999998e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.20874  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2540  GTP-binding signal recognition particle SRP54, G-domain  47.15 
 
 
137 aa  114  3.9999999999999997e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1210  hypothetical protein  45.45 
 
 
140 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0426652 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0976  hypothetical protein  46.9 
 
 
130 aa  99  2e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.216139  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1849  hypothetical protein  38.52 
 
 
123 aa  91.3  4e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0465  hypothetical protein  45.87 
 
 
125 aa  90.9  5e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2581  hypothetical protein  41.75 
 
 
125 aa  89.4  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1634  hypothetical protein  40.78 
 
 
125 aa  88.6  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.541924  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4808  hypothetical protein  42.48 
 
 
132 aa  86.7  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.754824 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1694  hypothetical protein  38.33 
 
 
122 aa  84.7  4e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4353  hypothetical protein  47 
 
 
127 aa  84.7  4e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1435  hypothetical protein  41.07 
 
 
130 aa  84.3  5e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0902  hypothetical protein  45.45 
 
 
129 aa  84  7e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000090715  hitchhiker  0.00000319035 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0238  hypothetical protein  42.5 
 
 
129 aa  83.2  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.973581  normal  0.0299279 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3252  hypothetical protein  47 
 
 
147 aa  82  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00216047  hitchhiker  3.08199e-16 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3030  hypothetical protein  41.18 
 
 
140 aa  82.4  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1141  hypothetical protein  38.33 
 
 
133 aa  81.6  0.000000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.63559  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0411  hypothetical protein  60 
 
 
80 aa  81.3  0.000000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2108  hypothetical protein  38.83 
 
 
128 aa  79.7  0.00000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2876  hypothetical protein  38.05 
 
 
127 aa  79.7  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.585701  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2927  hypothetical protein  41.96 
 
 
148 aa  79  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.435469  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2357  hypothetical protein  34.21 
 
 
134 aa  78.2  0.00000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0657686  normal  0.192695 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0081  hypothetical protein  36.84 
 
 
137 aa  77.4  0.00000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0149  hypothetical protein  42.16 
 
 
123 aa  77  0.00000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2568  hypothetical protein  38.52 
 
 
136 aa  75.9  0.0000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.995822 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1333  hypothetical protein  42 
 
 
128 aa  75.1  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.879036  normal  0.042363 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0701  hypothetical protein  39.29 
 
 
137 aa  75.1  0.0000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.580234  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2386  hypothetical protein  34.95 
 
 
130 aa  74.3  0.0000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6543  hypothetical protein  40.74 
 
 
114 aa  73.6  0.0000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1051  hypothetical protein  40.78 
 
 
126 aa  72  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4372  hypothetical protein  33.98 
 
 
125 aa  71.6  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000174807 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0943  hypothetical protein  35.85 
 
 
134 aa  70.1  0.000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3619  hypothetical protein  38.61 
 
 
125 aa  70.1  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.737608 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0167  hypothetical protein  38 
 
 
113 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.205181  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4311  hypothetical protein  33.01 
 
 
125 aa  69.3  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1568  hypothetical protein  33.06 
 
 
124 aa  68.9  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.214101  normal  0.171245 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1246  hypothetical protein  36.28 
 
 
130 aa  65.5  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1375  hypothetical protein  35.92 
 
 
125 aa  65.9  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1242  hypothetical protein  33.66 
 
 
135 aa  65.5  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0574  hypothetical protein  43.56 
 
 
130 aa  64.7  0.0000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.476606  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1620  hypothetical protein  33.98 
 
 
133 aa  63.9  0.0000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0805096  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1499  hypothetical protein  38.04 
 
 
112 aa  63.2  0.000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00140337  hitchhiker  0.0000264658 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0410  hypothetical protein  78.95 
 
 
39 aa  62.8  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3085  hypothetical protein  57.45 
 
 
48 aa  59.7  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0134  hypothetical protein  32.84 
 
 
166 aa  52  0.000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.14952  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3086  hypothetical protein  42.86 
 
 
53 aa  46.2  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>