25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_3433 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_3433  putative chemotactic signal-response protein CheL  100 
 
 
108 aa  218  3e-56  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2850  hypothetical protein  48.72 
 
 
109 aa  79.3  0.00000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00545868  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2555  hypothetical protein  44.05 
 
 
109 aa  72.8  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.818029 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0761  hypothetical protein  35.09 
 
 
137 aa  65.9  0.0000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3046  flagellar protein FlgJ-like protein  41.94 
 
 
126 aa  57  0.00000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2832  Rod binding protein-like protein  36.36 
 
 
135 aa  54.7  0.0000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1953  hypothetical protein  35.23 
 
 
108 aa  52.8  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3690  chemotactic signal-response protein CheL  52.17 
 
 
105 aa  50.8  0.000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2976  flagellar protein FlgJ, putative  34.88 
 
 
96 aa  50.4  0.000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.740729 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0800  hypothetical protein  28.95 
 
 
109 aa  49.3  0.00002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3453  hypothetical protein  32.99 
 
 
123 aa  48.5  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1263  rod binding-like protein  34.72 
 
 
122 aa  47.8  0.00005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.346021  normal  0.499347 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5549  hypothetical protein  34.44 
 
 
119 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.844447 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0435  flagellar protein FlgJ-like protein  37.84 
 
 
121 aa  45.8  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3758  rod binding protein-like protein  37.5 
 
 
120 aa  45.1  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4705  hypothetical protein  28.92 
 
 
116 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00630861  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4102  rod binding protein-like protein  32.88 
 
 
120 aa  44.3  0.0006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.106959  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2531  Flagellar protein FlgJ-like protein  35.48 
 
 
128 aa  43.9  0.0007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3154  membrane proteins, metalloendopeptidase-like  36.14 
 
 
388 aa  43.9  0.0008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0946  hypothetical protein  27.27 
 
 
119 aa  43.1  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000907933  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4205  flagellar protein FlgJ, putative  38.78 
 
 
100 aa  41.6  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.346346  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3842  rod binding protein-like protein  34.72 
 
 
118 aa  42  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00348653 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1152  putative FlgJ-like flagellar protein  28.17 
 
 
108 aa  42  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3042  hypothetical protein  28.38 
 
 
119 aa  41.2  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.557771 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3266  hypothetical protein  28.38 
 
 
119 aa  41.2  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>