27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4641 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_4641  hypothetical protein  100 
 
 		 142 aa  280  6.000000000000001e-75  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3478  hypothetical protein  51.26 
 
 		 148 aa  109  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00929426  hitchhiker  0.00647977 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3789  transcriptional regulator, MarR family  45.59 
 
 		 147 aa  105  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.379829  hitchhiker  0.00361313 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2394  transcriptional regulator, MarR family  47.93 
 
 		 148 aa  100  5e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.629641  normal  0.970499 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4112  transcriptional regulator, MarR family  32.41 
 
 		 152 aa  48.5  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0425216  normal  0.0879154 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3216  MarR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 174 aa  48.5  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0422342 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26700  transcriptional regulator  31.88 
 
 		 166 aa  48.1  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.347504  normal  0.248869 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8819  transcriptional regulator, MarR family  31.03 
 
 		 214 aa  46.2  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0213904  normal  0.276407 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4874  regulatory protein, MarR  25.36 
 
 		 161 aa  44.3  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0298906  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2867  transcriptional regulator, MarR family  29.73 
 
 		 152 aa  44.7  0.0005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0322809  normal  0.0426996 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0324  transcriptional regulator, MarR family  31.86 
 
 		 150 aa  44.3  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.491291  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2075  transcriptional regulator, MarR family  31.97 
 
 		 150 aa  43.9  0.0007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1140  MarR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 160 aa  43.5  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0619  MarR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 160 aa  43.5  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.267818  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2352  MarR family regulatory protein  30.84 
 
 		 160 aa  43.5  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0279  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 165 aa  43.5  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.159434  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0848  MarR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 160 aa  43.5  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1055  MarR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 160 aa  43.5  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.435281  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1813  MarR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 160 aa  43.5  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.213004  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12901  transcriptional regulator  31.82 
 
 		 139 aa  42.4  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.562288  normal  0.906652 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4187  MarR family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 158 aa  41.6  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2393  hypothetical protein  35.71 
 
 		 157 aa  42  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03320  transcriptional regulator  34.34 
 
 		 150 aa  41.2  0.005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4917  MarR family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 167 aa  40.8  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.36194  normal  0.834518 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5466  MarR family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 167 aa  40.4  0.007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.17419 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7503  transcriptional regulator, MarR family  33.6 
 
 		 156 aa  40.4  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2467  MarR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 158 aa  40  0.01  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.411287  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>