25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4305 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_4305  membrane protein-like protein  100 
 
 		 679 aa  1289    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.345935  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3578  hypothetical protein  37.38 
 
 		 604 aa  213  1e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.214461  normal  0.0454091 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2837  hypothetical protein  44.74 
 
 		 614 aa  162  2e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7071  hypothetical protein  38.25 
 
 		 639 aa  101  5e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0888  hypothetical protein  32.13 
 
 		 601 aa  79  0.0000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1901  membrane protein-like protein  39.73 
 
 		 1146 aa  51.6  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.95592  normal  0.876478 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4210  collagen adhesion protein  37.63 
 
 		 2179 aa  48.9  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.950826  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1379  hypothetical protein  45 
 
 		 920 aa  48.1  0.0005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3483  membrane protein-like protein  36.99 
 
 		 989 aa  48.1  0.0006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.736371  normal  0.107925 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0657  hypothetical protein  22.96 
 
 		 573 aa  47.4  0.0008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0416794  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0691  hypothetical protein  22.96 
 
 		 573 aa  47.4  0.0008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00673286  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1640  putative integral membrane protein  26.89 
 
 		 954 aa  47  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5173  membrane protein-like protein  34.78 
 
 		 1124 aa  46.6  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.747728  normal  0.0847519 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3194  membrane protein-like  34.78 
 
 		 1155 aa  46.6  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1751  putative integral membrane protein  26.89 
 
 		 954 aa  47  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0104  membrane protein-like  29.36 
 
 		 934 aa  47.4  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5093  membrane protein-like protein  29.26 
 
 		 1133 aa  46.6  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.161035 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0453  membrane protein-like  38.36 
 
 		 1133 aa  46.2  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.201937  normal  0.0526268 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1095  collagen adhesion protein  35.37 
 
 		 2272 aa  46.2  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5106  membrane protein-like protein  34.78 
 
 		 1130 aa  46.6  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0951295  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0802  hypothetical protein  43.24 
 
 		 957 aa  45.4  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.627232 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4568  membrane protein-like protein  29.26 
 
 		 1139 aa  45.8  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.95183 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0606  hypothetical protein  27.53 
 
 		 573 aa  45.1  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000211502  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0732  hypothetical protein  43.24 
 
 		 953 aa  44.3  0.007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.40961  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4612  hypothetical protein  24.56 
 
 		 573 aa  44.3  0.007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000184306  normal  0.241609 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>