More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3547 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_3547  2,5-didehydrogluconate reductase  100 
 
 
278 aa  569  1e-161  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.802476  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4957  2,5-didehydrogluconate reductase  69.09 
 
 
279 aa  403  1e-111  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.607517  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1394  2,5-didehydrogluconate reductase  67.03 
 
 
282 aa  388  1e-107  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1360  2,5-didehydrogluconate reductase  66.67 
 
 
282 aa  389  1e-107  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.603872  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4697  2,5-didehydrogluconate reductase  68.35 
 
 
282 aa  388  1e-107  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.973362  normal  0.111177 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1378  2,5-didehydrogluconate reductase  66.67 
 
 
282 aa  389  1e-107  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1769  2,5-didehydrogluconate reductase  68.23 
 
 
281 aa  387  1e-106  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.904108  normal  0.360608 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2581  2,5-didehydrogluconate reductase  66.43 
 
 
282 aa  376  1e-103  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4383  aldo/keto reductase  65.58 
 
 
283 aa  369  1e-101  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3214  2,5-didehydrogluconate reductase  60.44 
 
 
280 aa  357  9.999999999999999e-98  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00515928  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0084  aldo/keto reductase  60 
 
 
276 aa  346  2e-94  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1600  2,5-didehydrogluconate reductase  60.71 
 
 
289 aa  345  6e-94  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1587  2,5-didehydrogluconate reductase  57.66 
 
 
276 aa  331  9e-90  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0625741  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1160  2,5-didehydrogluconate reductase  57.35 
 
 
276 aa  325  6e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7952  2,5-didehydrogluconate reductase  57.46 
 
 
270 aa  324  1e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1395  2,5-didehydrogluconate reductase  54.24 
 
 
281 aa  316  2e-85  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.330402  decreased coverage  0.000466795 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4349  2,5-didehydrogluconate reductase  57.88 
 
 
275 aa  314  9.999999999999999e-85  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00162069  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1721  2,5-didehydrogluconate reductase  54.41 
 
 
276 aa  311  1e-83  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.222212  normal  0.459314 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3534  2,5-didehydrogluconate reductase  53.56 
 
 
272 aa  310  2e-83  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.946669  normal  0.675115 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0968  aldo/keto reductase  54.38 
 
 
274 aa  308  8e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3013  2,5-didehydrogluconate reductase  52.55 
 
 
276 aa  308  8e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.856221  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0861  aldo/keto reductase  55.68 
 
 
274 aa  307  1.0000000000000001e-82  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.274237  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1913  2,5-didehydrogluconate reductase  52.92 
 
 
278 aa  303  1.0000000000000001e-81  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.143661  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0183  aldo/keto reductase family oxidoreductase  52.19 
 
 
275 aa  303  3.0000000000000004e-81  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.285008  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4126  2,5-didehydrogluconate reductase  52.65 
 
 
294 aa  302  4.0000000000000003e-81  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15550  aldo/keto reductase, diketogulonate reductase  53.68 
 
 
282 aa  298  5e-80  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00501077  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1989  aldo/keto reductase  49.83 
 
 
291 aa  298  8e-80  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000065841 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0519  2,5-didehydrogluconate reductase  51.85 
 
 
275 aa  298  9e-80  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00901409  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0164  aldo/keto reductase family oxidoreductase  51.82 
 
 
357 aa  296  2e-79  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.432724  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4225  oxidoreductase  50.74 
 
 
276 aa  295  5e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1985  2,5-didehydrogluconate reductase  53.31 
 
 
278 aa  294  1e-78  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1919  2,5-didehydrogluconate reductase  50.73 
 
 
276 aa  291  6e-78  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.894727 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1985  2,5-didehydrogluconate reductase  50.36 
 
 
276 aa  290  1e-77  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.163279  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1420  2,5-didehydrogluconate reductase  52.19 
 
 
274 aa  288  9e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.917399  normal  0.103944 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1380  2,5-didehydrogluconate reductase  49.44 
 
 
275 aa  287  1e-76  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5104  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  49.81 
 
 
277 aa  287  1e-76  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3900  aldo/keto reductase  52.19 
 
 
308 aa  286  2e-76  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.835176  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0216  aldo/keto reductase family oxidoreductase  49.44 
 
 
277 aa  286  2.9999999999999996e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0239  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  49.44 
 
 
277 aa  286  2.9999999999999996e-76  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0187  aldo/keto reductase  49.81 
 
 
277 aa  286  4e-76  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0222  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  49.44 
 
 
277 aa  285  5e-76  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1972  2,5-didehydrogluconate reductase  50.18 
 
 
298 aa  285  5.999999999999999e-76  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3761  2,5-didehydrogluconate reductase  50 
 
 
276 aa  283  2.0000000000000002e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1500  putative oxidoreductase protein  51.31 
 
 
276 aa  283  2.0000000000000002e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.181777  normal  0.869656 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0197  aldo/keto reductase family oxidoreductase  49.44 
 
 
277 aa  283  2.0000000000000002e-75  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0196  aldo/keto reductase family oxidoreductase  49.44 
 
 
277 aa  283  2.0000000000000002e-75  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0216  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  49.44 
 
 
277 aa  283  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2796  2,5-didehydrogluconate reductase  49.09 
 
 
275 aa  283  2.0000000000000002e-75  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4977  2,5-didehydrogluconate reductase  48.56 
 
 
294 aa  282  5.000000000000001e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0181  2,5-didehydrogluconate reductase  49.07 
 
 
277 aa  282  5.000000000000001e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0184  aldo/keto reductase  49.07 
 
 
277 aa  281  6.000000000000001e-75  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0848  Aldehyde reductase  52.79 
 
 
274 aa  281  7.000000000000001e-75  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4166  aldo/keto reductase family oxidoreductase  50.55 
 
 
275 aa  281  8.000000000000001e-75  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2300  2,5-didehydrogluconate reductase  51.47 
 
 
278 aa  281  8.000000000000001e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.109418 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2023  2,5-didehydrogluconate reductase  51.1 
 
 
278 aa  279  3e-74  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.760724 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4006  aldo/keto reductase family oxidoreductase  50.18 
 
 
275 aa  279  4e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000973326  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3853  aldo/keto reductase family oxidoreductase  50.18 
 
 
312 aa  279  4e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.230626  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4319  aldo/keto reductase family oxidoreductase  50.18 
 
 
275 aa  279  4e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4121  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  50.18 
 
 
275 aa  279  4e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000119845 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3839  aldo/keto reductase family oxidoreductase  50.18 
 
 
275 aa  278  6e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4207  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  49.45 
 
 
275 aa  278  6e-74  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4543  2,5-didehydrogluconate reductase  50.18 
 
 
295 aa  278  7e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4230  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  49.82 
 
 
275 aa  276  2e-73  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0196  2,5-didehydrogluconate reductase  48.33 
 
 
277 aa  277  2e-73  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4216  2,5-diketo-D-gluconate reductase A  50.55 
 
 
274 aa  276  3e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.296306  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4086  aldo/keto reductase  48.54 
 
 
276 aa  275  5e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.968066 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1030  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  49.45 
 
 
275 aa  275  6e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1615  2,5-didehydrogluconate reductase  49.25 
 
 
272 aa  275  7e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.808798  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5462  aldo/keto reductase  49.82 
 
 
276 aa  274  9e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.414898  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0336  2,5-diketo-D-gluconate reductase A  48.9 
 
 
275 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3928  2,5-didehydrogluconate reductase  49.09 
 
 
275 aa  273  3e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0821638  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02540  aldo/keto reductase, diketogulonate reductase  49.26 
 
 
279 aa  273  3e-72  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.935575  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0988  2,5-didehydrogluconate reductase  47.58 
 
 
272 aa  272  5.000000000000001e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0343  2,5-diketo-D-gluconate reductase A  48.9 
 
 
275 aa  271  6e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0362  aldo/keto reductase family oxidoreductase  47.73 
 
 
279 aa  270  2e-71  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2314  oxidoreductase, chromogranin/secretogranin  46.84 
 
 
272 aa  269  4e-71  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2028  2,5-didehydrogluconate reductase  49.62 
 
 
277 aa  269  4e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0586  2,5-diketo-D-gluconate reductase A  50 
 
 
275 aa  268  5.9999999999999995e-71  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0667  2,5-diketo-D-gluconate reductase A  49.63 
 
 
277 aa  268  8.999999999999999e-71  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14340  aldo/keto reductase, diketogulonate reductase  47.89 
 
 
299 aa  267  1e-70  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.414164  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0265  aldo/keto reductase  49.06 
 
 
281 aa  267  1e-70  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0272  2,5-diketo-D-gluconate reductase A  50 
 
 
277 aa  268  1e-70  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2252  2,5-didehydrogluconate reductase  44.6 
 
 
291 aa  267  2e-70  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.202758  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3009  2,5-didehydrogluconate reductase  49.28 
 
 
294 aa  265  5.999999999999999e-70  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000425946 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2768  2,5-didehydrogluconate reductase  48.72 
 
 
278 aa  265  8.999999999999999e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.988077  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30490  aldo/keto reductase, diketogulonate reductase  47.04 
 
 
282 aa  264  1e-69  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3766  2,5-diketo-D-gluconate reductase A  46.84 
 
 
281 aa  263  3e-69  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.739123  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0600  2,5-didehydrogluconate reductase  45.52 
 
 
267 aa  263  3e-69  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31230  aldo/keto reductase, diketogulonate reductase  49.13 
 
 
293 aa  262  4e-69  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3945  aldo/keto reductase  47.52 
 
 
295 aa  261  6e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06660  aldo/keto reductase, diketogulonate reductase  46.55 
 
 
277 aa  261  8e-69  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1540  aldo/keto reductase  48.89 
 
 
287 aa  260  2e-68  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.199224 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14610  aldo/keto reductase, diketogulonate reductase  46.93 
 
 
294 aa  259  2e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3423  2,5-diketo-D-gluconate reductase A  46.89 
 
 
275 aa  259  3e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3297  2,5-diketo-D-gluconate reductase A  46.91 
 
 
275 aa  259  4e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.292953 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0687  2,5-didehydrogluconate reductase  46.55 
 
 
275 aa  258  1e-67  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02835  hypothetical protein  46.55 
 
 
275 aa  258  1e-67  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0491  aldo/keto reductase  48.33 
 
 
273 aa  257  1e-67  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.333273 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1501  2,5-didehydrogluconate reductase  45.66 
 
 
274 aa  258  1e-67  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0684  2,5-diketo-D-gluconate reductase A  46.55 
 
 
275 aa  258  1e-67  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>