More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3364 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_3364  cytochrome P450  100 
 
 		 440 aa  873    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0937489  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5093  cytochrome P450  55.18 
 
 		 449 aa  482  1e-135  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.187266  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5181  cytochrome P450  55.18 
 
 		 449 aa  482  1e-135  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1104  cytochrome P450  58.12 
 
 		 428 aa  481  1e-134  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.897628  normal  0.632762 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5472  cytochrome P450  54.73 
 
 		 449 aa  478  1e-134  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10137  cytochrome P450 138 cyp138  56.19 
 
 		 441 aa  471  1e-132  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5712  cytochrome P450  57.95 
 
 		 450 aa  470  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.119413  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3108  cytochrome P450  48.97 
 
 		 454 aa  392  1e-108  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3376  cytochrome P450  48.71 
 
 		 455 aa  374  1e-102  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.591253  normal  0.444181 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0355  cytochrome P450  47.02 
 
 		 460 aa  349  6e-95  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.06802  normal  0.110441 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1038  cytochrome P450  37.5 
 
 		 459 aa  249  1e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.63067  normal  0.984932 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13716  cytochrome P450 137 cyp137  39.71 
 
 		 476 aa  247  2e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.168265 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0785  cytochrome P450  38.99 
 
 		 447 aa  246  4.9999999999999997e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0800  cytochrome P450  38.99 
 
 		 447 aa  246  4.9999999999999997e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.088822 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0781  cytochrome P450  38.99 
 
 		 447 aa  246  6e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.620196  normal  0.775939 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22260  cytochrome P450  37.85 
 
 		 451 aa  245  9.999999999999999e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.140076  normal  0.497051 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2644  cytochrome P450  38.21 
 
 		 448 aa  245  9.999999999999999e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.111659 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10578  cytochrome P450 135B1 cyp135B1  40.28 
 
 		 472 aa  239  9e-62  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3752  cytochrome P450  37.89 
 
 		 481 aa  237  4e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0371725 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0401  cytochrome P450  36.32 
 
 		 448 aa  228  2e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.12209  normal  0.0394038 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0675  cytochrome P450  37.41 
 
 		 453 aa  213  7e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0202  cytochrome P450  37.28 
 
 		 462 aa  212  9e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4375  cytochrome P450  34.08 
 
 		 464 aa  211  2e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.000475823  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1981  cytochrome P450  32.28 
 
 		 468 aa  204  3e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0150704  normal  0.856547 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5060  cytochrome P450  31.66 
 
 		 455 aa  203  4e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1542  cytochrome P450  30.24 
 
 		 463 aa  203  5e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.161044 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10332  cytochrome P450 135A1 cyp135A1  32.1 
 
 		 449 aa  202  9.999999999999999e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0827  cytochrome P450  30.09 
 
 		 453 aa  202  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00913269 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4026  cytochrome P450  35.12 
 
 		 468 aa  199  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000210048 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4677  cytochrome P450  33.26 
 
 		 480 aa  198  2.0000000000000003e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3693  cytochrome P450  33.09 
 
 		 462 aa  198  2.0000000000000003e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.429017  normal  0.314695 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1413  cytochrome P450  34.37 
 
 		 490 aa  197  4.0000000000000005e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3921  cytochrome P450  28.73 
 
 		 459 aa  196  9e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.986656 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5162  cytochrome P450  32.54 
 
 		 445 aa  192  8e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000604347 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2103  cytochrome P450  31.89 
 
 		 455 aa  190  5e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.869814  hitchhiker  0.00839009 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1356  cytochrome P450  30.65 
 
 		 457 aa  187  3e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5488  cytochrome P450  34.45 
 
 		 440 aa  186  5e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.251072  normal  0.124542 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1110  cytochrome P450  31.49 
 
 		 473 aa  186  7e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1139  cytochrome P450  31.49 
 
 		 473 aa  186  7e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2191  cytochrome P450  30.05 
 
 		 454 aa  186  7e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2143  cytochrome P450  30.05 
 
 		 454 aa  186  8e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1386  cytochrome P450  30 
 
 		 457 aa  186  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1367  cytochrome P450  31.98 
 
 		 455 aa  184  3e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1543  cytochrome P450  30.38 
 
 		 467 aa  179  1e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.257407 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0181  cytochrome P450  31.74 
 
 		 457 aa  176  6e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.000068031  normal  0.336498 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1697  cytochrome P450  28.12 
 
 		 447 aa  172  6.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2940  cytochrome P450  34.29 
 
 		 450 aa  169  6e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1722  cytochrome P450  28.12 
 
 		 447 aa  170  6e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0675089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2984  cytochrome P450  34.29 
 
 		 450 aa  169  6e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0747208 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3132  cytochrome P450  32.51 
 
 		 444 aa  169  8e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2955  cytochrome P450  33.73 
 
 		 450 aa  169  1e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.503984  normal  0.725849 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3119  cytochrome P450  28.97 
 
 		 444 aa  168  2e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0220264  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5591  cytochrome P450  30.37 
 
 		 429 aa  167  4e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.362948  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2973  cytochrome P450  33.57 
 
 		 467 aa  155  1e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0248286  hitchhiker  0.0000662302 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1417  cytochrome P450  31.13 
 
 		 439 aa  146  9e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4177  cytochrome P450  31.5 
 
 		 459 aa  144  2e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00497532  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0744  cytochrome P450  28.64 
 
 		 452 aa  140  4.999999999999999e-32  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.491653  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5081  cytochrome P450  30.46 
 
 		 447 aa  139  7e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0451  cytochrome P450  30.26 
 
 		 454 aa  139  7e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.360422  normal  0.928248 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1920  cytochrome P450  29.27 
 
 		 492 aa  139  1e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.276792  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4522  cytochrome P450  31.32 
 
 		 462 aa  137  5e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1896  cytochrome P450  28.96 
 
 		 492 aa  135  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4464  cytochrome P450  33.24 
 
 		 489 aa  135  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2167  cytochrome P450  30.88 
 
 		 448 aa  134  3e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2324  cytochrome P450  28.01 
 
 		 444 aa  133  6e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.950685  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5157  cytochrome P450  32.93 
 
 		 474 aa  133  6e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0481875  hitchhiker  0.00610054 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5257  cytochrome P450  30 
 
 		 446 aa  132  1.0000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4969  cytochrome P450  28.98 
 
 		 473 aa  132  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.151016  normal  0.174544 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0290  cytochrome P450  28.24 
 
 		 431 aa  130  4.0000000000000003e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00132315  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1255  cytochrome P450  30.81 
 
 		 445 aa  130  5.0000000000000004e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4599  cytochrome P450  31.69 
 
 		 445 aa  129  1.0000000000000001e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.798682  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0434  cytochrome P450-related protein  30.73 
 
 		 430 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0479  cytochrome P450  31.34 
 
 		 484 aa  128  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.990518 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3868  putative cytochrome P450  31.51 
 
 		 473 aa  128  2.0000000000000002e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3729  cytochrome P450  31.04 
 
 		 446 aa  128  2.0000000000000002e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3260  cytochrome P450 family protein  28.32 
 
 		 1373 aa  126  6e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3146  cytochrome P450 family protein  28.32 
 
 		 1373 aa  127  6e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4102  cytochrome P450  30.17 
 
 		 452 aa  126  9e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.117897  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0005  cytochrome P450  27.11 
 
 		 433 aa  125  1e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00156979  normal  0.256492 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2711  cytochrome P450 51  27.9 
 
 		 551 aa  125  2e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2088  cytochrome P450-related protein  28.32 
 
 		 1373 aa  125  2e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1475  cytochrome P450 family protein  28.32 
 
 		 1373 aa  125  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2347  cytochrome P450-related protein  28.32 
 
 		 1380 aa  125  2e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2379  cytochrome P450-related protein  28.32 
 
 		 1373 aa  125  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.276948  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1115  cytochrome P450-related protein  28.32 
 
 		 1373 aa  125  2e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.273914  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1394  cytochrome P450-related protein  28.32 
 
 		 1373 aa  125  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6996  cytochrome P450 family protein  28.53 
 
 		 482 aa  124  3e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00633728 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0846  cytochrome P450  27.08 
 
 		 479 aa  124  4e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.734293 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3709  cytochrome P450 CYP110H1  29.2 
 
 		 442 aa  124  5e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.275139 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2423  cytochrome P450  26.05 
 
 		 470 aa  123  7e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.243249  normal  0.0544032 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6661  cytochrome P450  30.13 
 
 		 463 aa  123  8e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.181447  decreased coverage  0.0065391 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3529  cytochrome P450  30.97 
 
 		 479 aa  122  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08350  cytochrome P450  30.39 
 
 		 416 aa  122  9.999999999999999e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1303  cytochrome P450  26.77 
 
 		 432 aa  122  9.999999999999999e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0191796  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0326  cytochrome P450  27.85 
 
 		 441 aa  122  9.999999999999999e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.301346  normal  0.0106447 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0777  cytochrome P450  29.31 
 
 		 466 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1094  cytochrome P450  28.57 
 
 		 464 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00217839 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0812  cytochrome P450  26.78 
 
 		 447 aa  118  1.9999999999999998e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0554  cytochrome P450  29.1 
 
 		 452 aa  118  1.9999999999999998e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0120875 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1807  cytochrome P450  28.65 
 
 		 458 aa  117  3e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0665551  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>