59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2568 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_2578  regulatory protein ArsR  100 
 
 		 112 aa  144  4.0000000000000006e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2568  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 		 70 aa  142  2e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.211094  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1615  transcriptional regulator, ArsR family  84.06 
 
 		 112 aa  121  3e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.859354  normal  0.319077 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1274  ArsR family transcriptional regulator  83.08 
 
 		 113 aa  116  9.999999999999999e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0866  transcriptional regulator, ArsR family  54.84 
 
 		 110 aa  67  0.00000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.129477  normal  0.947667 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5891  regulatory protein, ArsR  53.23 
 
 		 109 aa  67  0.00000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2454  ArsR family transcriptional regulator  44.93 
 
 		 115 aa  66.6  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2387  regulatory protein ArsR  47.83 
 
 		 113 aa  66.6  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.176458  normal  0.250848 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2213  transcriptional regulator, ArsR family  46.38 
 
 		 118 aa  65.1  0.0000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2722  putative transcriptional regulator, ArsR family  48.39 
 
 		 116 aa  62.8  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.168697  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5370  ArsR family transcriptional regulator  51.72 
 
 		 120 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1960  putative transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  46.77 
 
 		 118 aa  62.8  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.234312  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1802  ArsR family transcriptional regulator  46.38 
 
 		 116 aa  61.2  0.000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.35409  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0955  ArsR family transcriptional regulator  44.93 
 
 		 113 aa  61.2  0.000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.246128  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0939  ArsR family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 111 aa  60.8  0.000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2811  transcriptional regulator, ArsR family  50.85 
 
 		 330 aa  60.1  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.377915  normal  0.0677625 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1799  ArsR family transcriptional regulator  45.71 
 
 		 121 aa  60.1  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.349475  normal  0.4808 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3434  ArsR family transcriptional regulator  44.93 
 
 		 113 aa  59.7  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.181701  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3633  transcriptional regulator, ArsR family  43.55 
 
 		 118 aa  58.5  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.744723 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4710  transcriptional regulator, ArsR family  43.55 
 
 		 118 aa  58.5  0.00000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.114202  normal  0.0108792 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2412  ArsR family transcriptional regulator  46.03 
 
 		 146 aa  57.8  0.00000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.589069  normal  0.516922 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0190  ArsR family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 121 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.595349 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2090  ArsR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 119 aa  54.7  0.0000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.461045  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4810  ArsR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 121 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.254931  normal  0.851115 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1214  regulatory protein, ArsR  39.71 
 
 		 117 aa  54.3  0.0000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2932  regulatory protein ArsR  37.68 
 
 		 111 aa  54.3  0.0000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00263901  hitchhiker  0.00135799 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2860  ArsR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 115 aa  53.9  0.0000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4595  ArsR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 109 aa  53.1  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.610627 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4142  regulatory protein ArsR  44.83 
 
 		 114 aa  52.4  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.668124  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5459  ArsR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 131 aa  52.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.192477 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5402  ArsR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 131 aa  52.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2063  transcriptional regulator, ArsR family  40.32 
 
 		 113 aa  52.8  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2296  transcriptional regulator, ArsR family  50 
 
 		 113 aa  49.7  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.654183 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1974  regulatory protein ArsR  37.1 
 
 		 113 aa  47  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1735  transcriptional regulator, ArsR family  35.94 
 
 		 115 aa  46.6  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1365  ArsR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 169 aa  46.6  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2317  transcriptional regulator, ArsR family  44.23 
 
 		 115 aa  45.4  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.161195 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3812  ArsR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 112 aa  45.1  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.232399  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11930  transcriptional regulator, ArsR family  39.06 
 
 		 105 aa  44.7  0.0004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.68951  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3869  regulatory protein ArsR  36.76 
 
 		 112 aa  45.1  0.0004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.361439  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3956  regulatory protein ArsR  36.76 
 
 		 112 aa  44.7  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2500  ArsR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 118 aa  44.7  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.143553  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2339  ArsR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 122 aa  43.9  0.0007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.825152  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2820  transcriptional regulator, ArsR family  35.59 
 
 		 111 aa  43.5  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2191  ArsR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 115 aa  42.4  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3504  regulatory protein ArsR  35.94 
 
 		 119 aa  42.4  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.374372 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3075  ArsR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 117 aa  42.4  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0287  regulatory protein ArsR  39.06 
 
 		 112 aa  42.7  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5296  regulatory protein ArsR  34.43 
 
 		 129 aa  41.6  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.891098  normal  0.548159 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0993  putative transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  37.5 
 
 		 121 aa  41.6  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.620055  normal  0.359529 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1168  ArsR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 110 aa  41.6  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.590716  normal  0.186158 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1158  ArsR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 110 aa  41.6  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7744  transcriptional regulator, ArsR family  41.18 
 
 		 113 aa  41.6  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1141  ArsR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 110 aa  41.6  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0765  ArsR family transcriptional regulator  43.18 
 
 		 145 aa  41.6  0.004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1071  regulatory protein ArsR  35.48 
 
 		 142 aa  41.2  0.005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0824  transcriptional regulator, ArsR family  30.77 
 
 		 110 aa  40.8  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1040  ArsR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 120 aa  40.4  0.008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.425807  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2701  regulatory protein, ArsR  40.91 
 
 		 117 aa  40.4  0.008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.091183 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>