39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1804 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_1804  hypothetical protein  100 
 
 
275 aa  535  1e-151  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.863442  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5841  hypothetical protein  39.27 
 
 
289 aa  179  4e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.322989  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5403  hypothetical protein  38.35 
 
 
263 aa  163  3e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.36525 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5355  hypothetical protein  39.18 
 
 
266 aa  161  1e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1432  hypothetical protein  36.53 
 
 
268 aa  150  2e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.762599  normal  0.87586 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5140  hypothetical protein  37.94 
 
 
265 aa  149  5e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5656  hypothetical protein  39.58 
 
 
257 aa  149  7e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4754  hypothetical protein  38.34 
 
 
265 aa  145  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.290335  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4840  hypothetical protein  38.34 
 
 
265 aa  145  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2803  hypothetical protein  37.08 
 
 
265 aa  141  9.999999999999999e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5353  hypothetical protein  37.17 
 
 
304 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0645  hypothetical protein  38.6 
 
 
256 aa  138  1e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.420731  normal  0.281398 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3436  hypothetical protein  34.91 
 
 
255 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0164  hypothetical protein  39.53 
 
 
263 aa  124  2e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3173  hypothetical protein  35.43 
 
 
248 aa  116  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.363559  normal  0.380855 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4648  hypothetical protein  34.92 
 
 
239 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.690095 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3023  hypothetical protein  31.32 
 
 
263 aa  113  3e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3463  hypothetical protein  31.58 
 
 
252 aa  112  7.000000000000001e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3242  hypothetical protein  33.33 
 
 
265 aa  110  3e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.766904  normal  0.363076 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2600  hypothetical protein  32.16 
 
 
246 aa  109  6e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000803588  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5086  hypothetical protein  30.59 
 
 
255 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0755005  normal  0.0704408 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6611  hypothetical protein  29.57 
 
 
246 aa  107  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.27384  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0019  hypothetical protein  34.02 
 
 
250 aa  106  5e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2249  hypothetical protein  32.82 
 
 
252 aa  105  9e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5288  hypothetical protein  31.08 
 
 
240 aa  102  6e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3079  hypothetical protein  31.08 
 
 
240 aa  102  6e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5887  hypothetical protein  34.81 
 
 
249 aa  102  6e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0269514  normal  0.859333 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4980  hypothetical protein  30.68 
 
 
240 aa  102  7e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3464  hypothetical protein  35.43 
 
 
248 aa  102  7e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.774216  normal  0.616486 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0360  hypothetical protein  31.47 
 
 
240 aa  100  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.171003  normal  0.610905 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5177  hypothetical protein  34.92 
 
 
240 aa  100  3e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.237679 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1543  hypothetical protein  28.74 
 
 
248 aa  99.4  6e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0856493  normal  0.144706 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2503  hypothetical protein  31.89 
 
 
238 aa  92.8  5e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.155963 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2882  hypothetical protein  32.42 
 
 
293 aa  85.9  7e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2488  hypothetical protein  33.59 
 
 
259 aa  83.6  0.000000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.378044 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4865  hypothetical protein  34.26 
 
 
266 aa  82.4  0.000000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.04962  normal  0.390443 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0633  hypothetical protein  32.1 
 
 
224 aa  61.6  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0878  hypothetical protein  24.39 
 
 
242 aa  59.7  0.00000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.312149 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0308  hypothetical protein  31.61 
 
 
264 aa  59.3  0.00000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>