196 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1378 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_3299  magnesium chelatase subunit ChlI  75.11 
 
 
473 aa  677    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0952  putative magnesium chelatase subunit ChlI  75.38 
 
 
462 aa  672    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1378  Mg-chelatase subunit ChlI-like protein  100 
 
 
480 aa  950    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4854  putative magnesium chelatase  73.32 
 
 
463 aa  629  1e-179  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.454565 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1877  putative magnesium chelatase  72.89 
 
 
463 aa  629  1e-179  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0595129 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4314  putative magnesium chelatase  72.89 
 
 
461 aa  624  1e-178  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.569649  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4400  putative magnesium chelatase  72.89 
 
 
461 aa  624  1e-178  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.803447  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4694  putative magnesium chelatase  72.89 
 
 
461 aa  624  1e-178  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0396421  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1986  putative magnesium chelatase  70.22 
 
 
469 aa  622  1e-177  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.106493  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2192  magnesium protoporphyrin chelatase, putative  70.07 
 
 
461 aa  611  9.999999999999999e-175  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1769  putative magnesium chelatase  70.19 
 
 
478 aa  611  9.999999999999999e-175  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000539061 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10976  magnesium chelatase  72.71 
 
 
459 aa  600  1e-170  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.915369  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22300  Mg-chelatase subunit ChlI  66.38 
 
 
475 aa  571  1e-161  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.102515  normal  0.184518 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0551  Mg-chelatase subunit ChlI-like protein  70.7 
 
 
464 aa  560  1e-158  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0443  magnesium chelatase subunit ChlI  62.91 
 
 
475 aa  554  1e-156  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1892  magnesium chelatase, ChlI subunit  62.77 
 
 
463 aa  552  1e-156  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.460358  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1054  Mg-chelatase subunit ChlI-like protein  61.82 
 
 
471 aa  540  9.999999999999999e-153  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1097  magnesium chelatase, ChlI subunit  63.87 
 
 
476 aa  530  1e-149  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.3392 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3114  magnesium protoporphyrin chelatase, putative  60.93 
 
 
469 aa  522  1e-147  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.53029  hitchhiker  0.0000243059 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8559  magnesium protoporphyrin chelatase, putative  62.06 
 
 
465 aa  520  1e-146  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0823  putative magnesium chelatase  60.17 
 
 
503 aa  510  1e-143  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.421013 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0934  putative magnesium chelatase  58.51 
 
 
511 aa  499  1e-140  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.550686  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3905  magnesium chelatase, ChlI subunit  60.04 
 
 
507 aa  486  1e-136  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0246892  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0090  magnesium protoporphyrin chelatase, putative  57.17 
 
 
477 aa  478  1e-134  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.320912  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1872  magnesium protoporphyrin chelatase, putative  50.22 
 
 
464 aa  430  1e-119  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0311  magnesium chelatase, ChlI subunit  49.11 
 
 
460 aa  384  1e-105  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1164  magnesium protoporphyrin chelatase, putative  43.13 
 
 
475 aa  380  1e-104  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2682  magnesium protoporphyrin chelatase, putative  44.28 
 
 
505 aa  365  1e-100  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3256  magnesium protoporphyrin chelatase, putative  44.61 
 
 
502 aa  362  7.0000000000000005e-99  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.149717  normal  0.233846 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4671  magnesium protoporphyrin chelatase, putative  45.38 
 
 
499 aa  357  2.9999999999999997e-97  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.268952  hitchhiker  0.00000156753 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08801  magnesium protoporphyrin chelatase, putative  47.46 
 
 
487 aa  343  2.9999999999999997e-93  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.240112  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0326  Mg-chelatase subunit ChlI-like protein  39.96 
 
 
510 aa  342  1e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3739  magnesium chelatase, subunit ChlI  46.31 
 
 
510 aa  341  1e-92  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4336  Mg-chelatase subunit ChlI-like protein  44.65 
 
 
487 aa  330  4e-89  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.799132  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0006  magnesium chelatase, subunit ChlI  39.51 
 
 
512 aa  328  1.0000000000000001e-88  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.388384  normal  0.114957 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0370  Mg-chelatase subunit ChlI  45.45 
 
 
497 aa  327  4.0000000000000003e-88  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.591136  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0412  magnesium protoporphyrin chelatase, putative  41.1 
 
 
486 aa  324  2e-87  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1093  magnesium chelatase related protein  41.67 
 
 
473 aa  309  5.9999999999999995e-83  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2429  magnesium protoporphyrin chelatase putative  45.41 
 
 
473 aa  308  2.0000000000000002e-82  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1519  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  27.87 
 
 
374 aa  71.6  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0208517  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0511  ATPase  26.15 
 
 
334 aa  63.2  0.00000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.269432  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3502  magnesium chelatase subunit I  28.63 
 
 
334 aa  61.2  0.00000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.602006  normal  0.630421 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0648  magnesium chelatase ATPase subunit I  27 
 
 
357 aa  60.5  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3280  magnesium chelatase ATPase subunit I  26.23 
 
 
373 aa  60.1  0.00000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0583  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  27.55 
 
 
364 aa  59.7  0.0000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00224642  normal  0.0296662 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3622  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  29.22 
 
 
405 aa  59.7  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.164219 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0454  magnesium chelatase ATPase subunit I  27.13 
 
 
358 aa  58.9  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0970  magnesium chelatase ATPase subunit I  28.51 
 
 
369 aa  58.9  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.726798  normal  0.50852 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1403  ATPase  26.59 
 
 
306 aa  58.5  0.0000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1916  magnesium chelatase subunit I  28.39 
 
 
334 aa  58.5  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.808705 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0467  magnesium chelatase ATPase subunit I  27.13 
 
 
358 aa  58.9  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.571149  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0273  magnesium chelatase subunit I  28.39 
 
 
334 aa  58.5  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.308898  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08951  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  26.1 
 
 
363 aa  57.8  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.469371 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0850  ATPase  26.72 
 
 
304 aa  57.8  0.0000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.243473 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1693  magnesium chelatase ATPase subunit I  25.84 
 
 
340 aa  57.4  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.578375  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3152  ATPase  31.11 
 
 
620 aa  57  0.0000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1022  magnesium chelatase subunit I  26.98 
 
 
334 aa  57  0.0000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0936495  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2611  magnesium chelatase ATPase subunit D  25.58 
 
 
673 aa  57  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3505  magnesium chelatase ATPase subunit D  25.58 
 
 
673 aa  57  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1622  magnesium chelatase ATPase subunit I  25.66 
 
 
341 aa  56.6  0.000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3771  magnesium chelatase ATPase subunit I  26.74 
 
 
340 aa  55.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0136041 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2068  magnesium chelatase ATPase subunit I  30.49 
 
 
341 aa  55.5  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.876863 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1250  magnesium chelatase ATPase subunit I  25.19 
 
 
340 aa  55.1  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00136205 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2455  ATPase  28.17 
 
 
332 aa  54.7  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0954  ATPase  28.04 
 
 
307 aa  55.1  0.000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11361  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  24.8 
 
 
362 aa  54.3  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.810628 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4017  magnesium chelatase ATPase subunit I  26.25 
 
 
340 aa  54.3  0.000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0371739  normal  0.311095 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1076  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  29.7 
 
 
319 aa  53.9  0.000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1974  hypothetical protein  24.28 
 
 
296 aa  53.1  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.253006  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2122  hypothetical protein  24.28 
 
 
296 aa  53.1  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4029  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  30.91 
 
 
306 aa  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1952  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  26.51 
 
 
362 aa  50.8  0.00005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0857411  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0485  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  25.98 
 
 
394 aa  50.8  0.00005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0861468  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2044  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  34.69 
 
 
314 aa  50.4  0.00006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3731  magnesium chelatase ATPase subunit I  27.05 
 
 
368 aa  50.4  0.00007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.786606  normal  0.0984598 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3413  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  32.38 
 
 
324 aa  50.1  0.00008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.265752  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2964  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  28.57 
 
 
305 aa  50.4  0.00008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00460178 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2728  magnesium chelatase ATPase subunit I  27.02 
 
 
337 aa  50.1  0.00009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.111269 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2433  magnesium chelatase ATPase subunit I  27.16 
 
 
337 aa  49.7  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1860  Magnesium chelatase  26.23 
 
 
719 aa  49.7  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.217661 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2229  ATPase  28.89 
 
 
337 aa  49.7  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2505  magnesium chelatase ATPase subunit I  28 
 
 
337 aa  49.7  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.57993  normal  0.244137 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3171  magnesium chelatase, ChlI subunit; methanol dehydrogenase regulator  27.93 
 
 
309 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3552  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  31.11 
 
 
403 aa  48.9  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3856  Magnesium chelatase  25.61 
 
 
365 aa  48.5  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.257397  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0449  magnesium chelatase  24.9 
 
 
669 aa  48.5  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0156382  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1319  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  28.02 
 
 
305 aa  48.5  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.225363  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0692  ATPase  27.71 
 
 
323 aa  48.5  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0405623 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0153  Mg chelatase-like protein  29.38 
 
 
507 aa  49.3  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0210  ATPase  30.59 
 
 
347 aa  48.9  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.283743  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4762  Mg chelatase, subunit ChlI  27.78 
 
 
507 aa  48.9  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0481  Mg chelatase-like protein  29.38 
 
 
507 aa  49.3  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0704284 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4062  Mg chelatase, subunit ChlI  29.38 
 
 
507 aa  49.3  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1835  magnesium chelatase ATPase subunit I  27.16 
 
 
336 aa  49.3  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.053644 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3181  MoxR protein  28.47 
 
 
320 aa  48.5  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38370  hypothetical protein  35.29 
 
 
328 aa  48.1  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1686  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  30.66 
 
 
326 aa  48.5  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2134  MoxR protein  28.47 
 
 
320 aa  48.5  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1006  von Willebrand factor type A  26.51 
 
 
749 aa  48.5  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2041  Fis family GAF modulated sigma54 specific transcriptional regulator  29.7 
 
 
611 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.115359  normal  0.637814 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>