87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0202 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_0202  hypothetical protein  100 
 
 		 333 aa  662    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.499323  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2543  hypothetical protein  46.33 
 
 		 332 aa  247  2e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.730703 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5416  putative acyl-CoA dehydrogenase-related protein  46.78 
 
 		 388 aa  223  3e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.699876 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3131  hypothetical protein  44.33 
 
 		 337 aa  222  6e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.470644  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0512  hypothetical protein  46.42 
 
 		 338 aa  222  6e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0189199  decreased coverage  0.000000311595 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2998  hypothetical protein  43.05 
 
 		 337 aa  220  3e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5871  putative acyl-CoA dehydrogenase-related protein  43.38 
 
 		 363 aa  217  2e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.845489  normal  0.406047 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2027  putative acyl-CoA dehydrogenase-related protein  44.86 
 
 		 335 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2240  putative acyl-CoA dehydrogenase-related protein  45.21 
 
 		 392 aa  210  3e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3272  putative acyl-CoA dehydrogenase-related protein  46.18 
 
 		 396 aa  199  5e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000123433  hitchhiker  0.0000576183 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3259  acyl-CoA dehydrogenase-related protein  41.98 
 
 		 347 aa  195  9e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.543921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2502  hypothetical protein  41.98 
 
 		 347 aa  195  1e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2636  acyl-CoA dehydrogenase  42.32 
 
 		 347 aa  192  7e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.292935  normal  0.528602 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2652  acyl-CoA dehydrogenase  42.47 
 
 		 347 aa  192  9e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.530272  normal  0.685897 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0021  dehydrogenase  49.03 
 
 		 313 aa  192  9e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0755375  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4937  acyl-CoA dehydrogenase-related protein  41.56 
 
 		 334 aa  192  9e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0335  hypothetical protein  40 
 
 		 341 aa  190  2.9999999999999997e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2567  putative acyl-CoA dehydrogenase-related protein  43.56 
 
 		 359 aa  181  2e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.752192  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20110  hypothetical protein  39.31 
 
 		 382 aa  180  2.9999999999999997e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.252423  normal  0.481515 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1801  putative acyl-CoA dehydrogenase-related protein  36.21 
 
 		 362 aa  176  6e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.162926 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0555  hypothetical protein  38.6 
 
 		 350 aa  169  4e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01080  hypothetical protein  39.49 
 
 		 372 aa  162  8.000000000000001e-39  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3848  acyl-CoA dehydrogenase type 2  29.41 
 
 		 391 aa  84  0.000000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.680066 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4157  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  29.18 
 
 		 391 aa  80.9  0.00000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0737881  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4305  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  32.96 
 
 		 412 aa  76.6  0.0000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0499711  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0138  cyclic nucleotide-binding protein  28.82 
 
 		 382 aa  76.6  0.0000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.363055  normal  0.0562136 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0796  Acyl-CoA dehydrogenase-like protein  30.72 
 
 		 381 aa  75.9  0.000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.585612  normal  0.628725 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2922  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  25.16 
 
 		 391 aa  71.6  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1346  hypothetical protein  26.3 
 
 		 364 aa  69.7  0.00000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0806475  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3593  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  27.61 
 
 		 385 aa  68.6  0.0000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3329  acyl-CoA dehydrogenase type 2  26.94 
 
 		 382 aa  65.9  0.0000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.684525  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0575  Acyl-CoA dehydrogenase  26.81 
 
 		 322 aa  60.5  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04805  acyl-CoA dehydrogenase 1  41.98 
 
 		 391 aa  58.9  0.0000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4098  acyl-CoA dehydrogenase  27.27 
 
 		 373 aa  54.7  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.461592  normal  0.148654 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1126  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  30.83 
 
 		 373 aa  50.8  0.00003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2075  Acyl-CoA dehydrogenase-like  40 
 
 		 392 aa  50.1  0.00005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000570553  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1208  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  35.78 
 
 		 391 aa  49.7  0.00007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.166701  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1329  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  28.5 
 
 		 389 aa  48.5  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.066051  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7127  Acyl-CoA dehydrogenase  36.92 
 
 		 385 aa  48.9  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2876  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  39.56 
 
 		 383 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0157602  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4628  Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal:Acyl-CoA dehydrogenase, central region  26.29 
 
 		 397 aa  47.8  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.383414  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31350  DszC-like desulfurization enzyme  31.82 
 
 		 392 aa  47  0.0004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13078  acyl-CoA dehydrogenase fadE22  30.97 
 
 		 721 aa  47  0.0005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.273933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2304  acyl-CoA dehydrogenase type 2  32 
 
 		 392 aa  47  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0799931  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1085  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  29.41 
 
 		 373 aa  47  0.0005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.863384  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8460  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  40.54 
 
 		 391 aa  47  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0246683 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4613  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  25.86 
 
 		 397 aa  46.6  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17470  acyl-CoA dehydrogenase  35.37 
 
 		 396 aa  46.2  0.0008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.773993  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1807  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  31.96 
 
 		 578 aa  46.2  0.0008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.9558  normal  0.985453 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0929  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  29.17 
 
 		 541 aa  46.2  0.0008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000115197  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3206  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  34.15 
 
 		 392 aa  45.8  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0674188  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2737  putative acyl-CoA dehydrogenase  30.21 
 
 		 385 aa  45.8  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0159  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  30 
 
 		 397 aa  45.4  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1529  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  35.4 
 
 		 389 aa  45.8  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.845789  normal  0.622728 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2351  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  34.29 
 
 		 378 aa  45.8  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.188906  normal  0.0134667 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2352  acyl-CoA dehydrogenase type 2  25.44 
 
 		 384 aa  45.1  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.657423  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3917  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  33.33 
 
 		 381 aa  45.1  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0198331  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2334  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  40.68 
 
 		 400 aa  44.7  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.615469 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1857  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  34.65 
 
 		 401 aa  45.1  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2310  acyl-CoA dehydrogenase type 2  25.44 
 
 		 384 aa  45.1  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.154104  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2083  monoxygenase  34 
 
 		 423 aa  45.1  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0176  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  28.11 
 
 		 385 aa  45.4  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.142689  normal  1 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_22019  predicted protein  27.6 
 
 		 437 aa  43.9  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1094  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  31.96 
 
 		 581 aa  44.3  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0303784  normal  0.0187892 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1183  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  31.91 
 
 		 390 aa  43.9  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03880  conserved hypothetical protein  39.73 
 
 		 458 aa  44.3  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5213  acyl-CoA dehydrogenase type 2  33.66 
 
 		 403 aa  43.9  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.174771 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4292  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  35.05 
 
 		 389 aa  43.9  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3775  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  27.1 
 
 		 388 aa  43.9  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0119178  unclonable  0.00000752707 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10405  acyl-CoA dehydrogenase fadE7  35 
 
 		 395 aa  43.5  0.004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4934  acyl-CoA dehydrogenase type 2  33.66 
 
 		 403 aa  43.5  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.236936  normal  0.753815 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4513  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  34 
 
 		 402 aa  43.5  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0801  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  36.51 
 
 		 736 aa  43.5  0.005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1224  acyl-CoA dehydrogenase-like  28.99 
 
 		 394 aa  43.5  0.005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0161366  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5650  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  28.57 
 
 		 377 aa  43.1  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0517  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  29.61 
 
 		 386 aa  43.5  0.006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.602895  decreased coverage  0.000687036 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2904  acyl-CoA dehydrogenase type 2  34.78 
 
 		 380 aa  43.1  0.006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000160937  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1084  butyryl-CoA dehydrogenase  32 
 
 		 377 aa  43.5  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0155468 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6219  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  32.94 
 
 		 387 aa  43.1  0.007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1109  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  27.1 
 
 		 388 aa  43.1  0.007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.168915  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2116  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  39.13 
 
 		 403 aa  42.7  0.008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.708611  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4372  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  32.94 
 
 		 374 aa  42.7  0.009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.367452  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1288  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  29.68 
 
 		 379 aa  42.7  0.009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.751821 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0241  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  37.35 
 
 		 389 aa  42.7  0.009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9061  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  32.29 
 
 		 385 aa  42.4  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4684  acyl-CoA dehydrogenase type 2  32.67 
 
 		 403 aa  42.7  0.01  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4346  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  28.92 
 
 		 396 aa  42.4  0.01  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.758743  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>