25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_3833 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_3833  hypothetical protein  100 
 
 		 164 aa  322  2e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3917  hypothetical protein  96.32 
 
 		 164 aa  305  2.0000000000000002e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0470843 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4208  hypothetical protein  55.4 
 
 		 181 aa  157  6e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0415  hypothetical protein  53.17 
 
 		 169 aa  121  3e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3107  hypothetical protein  53.28 
 
 		 182 aa  120  8e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3431  hypothetical protein  44.26 
 
 		 179 aa  86.7  1e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3299  hypothetical protein  41.67 
 
 		 184 aa  71.6  0.000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5505  hypothetical protein  25.71 
 
 		 256 aa  59.7  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2706  hypothetical protein  28.95 
 
 		 208 aa  57.4  0.00000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.5213  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1511  hypothetical protein  31.91 
 
 		 255 aa  57.4  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2838  hypothetical protein  24.75 
 
 		 238 aa  55.8  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3782  hypothetical protein  26.67 
 
 		 259 aa  54.3  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2072  hypothetical protein  27.83 
 
 		 214 aa  54.7  0.0000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0631434 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1688  hypothetical protein  25.71 
 
 		 255 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0687483  normal  0.086166 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4418  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  27.27 
 
 		 254 aa  51.6  0.000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1388  hypothetical protein  28.72 
 
 		 266 aa  50.8  0.000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0881994  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1688  hypothetical protein  29.57 
 
 		 192 aa  47.8  0.00006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1436  hypothetical protein  29.9 
 
 		 258 aa  44.3  0.0008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.860283 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4717  hypothetical protein  23.02 
 
 		 295 aa  43.5  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0194174  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0574  hypothetical protein  24.03 
 
 		 176 aa  43.9  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0058  hypothetical protein  22.06 
 
 		 170 aa  42.7  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.202005 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1394  hypothetical protein  26.8 
 
 		 325 aa  42.4  0.003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1126  hypothetical protein  22.34 
 
 		 267 aa  42  0.003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.577564  normal  0.803766 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2250  hypothetical protein  29.17 
 
 		 219 aa  41.6  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.599567  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4202  hypothetical protein  24.11 
 
 		 310 aa  41.6  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0193396  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>