More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_1085 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011146  Gbem_1085  acetyltransferase (isoleucine patch superfamily)-like protein  100 
 
 
162 aa  331  3e-90  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3176  acetyltransferase (isoleucine patch superfamily)-like protein  98.15 
 
 
162 aa  327  5.0000000000000004e-89  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2869  acetyltransferase  69.68 
 
 
172 aa  237  5.999999999999999e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.860417  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4953  transferase  41.23 
 
 
168 aa  81.6  0.000000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5009  transferase hexapeptide domain-containing protein  40.35 
 
 
170 aa  80.1  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4838  hexapeptide repeat-containing transferase  40.35 
 
 
170 aa  80.1  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0271  acetyltransferase  37.04 
 
 
182 aa  79.7  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.326 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5389  transferase hexapeptide domain-containing protein  40.35 
 
 
170 aa  80.1  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3167  transferase hexapeptide repeat containing protein  40.94 
 
 
165 aa  80.5  0.00000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5245  transferase hexapeptide domain protein  40.35 
 
 
170 aa  80.1  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4853  hexapeptide repeat-containing transferase  40.35 
 
 
170 aa  79.7  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3703  hexapaptide repeat-containing transferase  40 
 
 
166 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1157  transferase hexapeptide repeat containing protein  41.03 
 
 
179 aa  78.2  0.00000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.205323  hitchhiker  0.0000317617 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5264  transferase hexapeptide domain-containing protein  38.6 
 
 
168 aa  77.4  0.00000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5321  transferase hexapeptide domain protein  36.84 
 
 
168 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5279  transferase hexapeptide domain protein  38.6 
 
 
170 aa  76.3  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5678  transferase hexapeptide domain protein  37.72 
 
 
170 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3719  hexapaptide repeat-containing transferase  38.05 
 
 
191 aa  73.6  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.13438  normal  0.0108777 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2983  acetyltransferase  37.72 
 
 
170 aa  72  0.000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.833594  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0158  acetyltransferase  35.2 
 
 
182 aa  71.6  0.000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3543  hexapaptide repeat-containing transferase  36.28 
 
 
207 aa  70.9  0.000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.106718  normal  0.163609 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1294  galactoside O-acetyltransferase 3; maltose O-acetyltransferase 3  36.07 
 
 
194 aa  70.1  0.00000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.356111  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0413  acetyl/acyl transferase related protein  42.45 
 
 
230 aa  69.7  0.00000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0399  hexapeptide repeat-containing acetyltransferase  41.13 
 
 
192 aa  68.6  0.00000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.345276  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0299  acetyltransferase-like protein  33.33 
 
 
185 aa  67.8  0.00000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0238775  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6294  acetyltransferase  37.5 
 
 
191 aa  67.4  0.00000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.148142  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2577  hexapaptide repeat-containing transferase  37.19 
 
 
199 aa  67  0.00000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2631  hexapaptide repeat-containing transferase  37.19 
 
 
199 aa  67  0.00000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.778978  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3590  hexapeptide repeat-containing acetyltransferase  38.89 
 
 
191 aa  67  0.0000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000791  acetyltransferase  37.07 
 
 
184 aa  66.6  0.0000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0300  O-acetyltransferase  37.74 
 
 
197 aa  65.5  0.0000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.00851676  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2317  galactoside O-acetyltransferase 3; maltose O- acetyltransferase 3  34.19 
 
 
172 aa  64.7  0.0000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.350058 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2073  transferase hexapeptide repeat containing protein  39.64 
 
 
187 aa  64.3  0.0000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0723  transferase hexapeptide repeat containing protein  43.24 
 
 
213 aa  63.9  0.0000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0300  hypothetical protein  40.66 
 
 
251 aa  63.9  0.0000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.246063  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1308  Acetyltransferase (isoleucine patch superfamily)-like protein  40.57 
 
 
163 aa  63.5  0.000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1974  hypothetical protein  36.8 
 
 
187 aa  63.5  0.000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.931779  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1531  hexapaptide repeat-containing transferase  37.07 
 
 
184 aa  63.5  0.000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000154529  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06688  acetyltransferase  35.83 
 
 
184 aa  63.2  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0786  hexapaptide repeat-containing transferase  38.61 
 
 
161 aa  62  0.000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.758971  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0803  hexapaptide repeat-containing transferase  38.61 
 
 
161 aa  62  0.000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1408  acetyltransferase  35.51 
 
 
203 aa  62  0.000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0573867  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6403  transferase hexapeptide repeat containing protein  37.07 
 
 
214 aa  62.4  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.552985 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3669  transferase hexapeptide repeat containing protein  35.14 
 
 
229 aa  62  0.000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.252735 
 
 
-
 
NC_003296  RS02346  putative acyl transferase protein  35.25 
 
 
170 aa  62  0.000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.876426  normal  0.444308 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2421  serine O-acetyltransferase  32.81 
 
 
314 aa  62  0.000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.710192  normal  0.151556 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5179  transferase hexapeptide repeat containing protein  44 
 
 
192 aa  61.6  0.000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.781731  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2989  hexapaptide repeat-containing transferase  38.33 
 
 
185 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.29453  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2852  hexapaptide repeat-containing transferase  38.33 
 
 
185 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.581317 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1390  hexapaptide repeat-containing transferase  32.61 
 
 
163 aa  60.8  0.000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0276639 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1458  tetrahydrodipicolinate succinyltransferase domain-containing protein  28.67 
 
 
239 aa  60.5  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.484512  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2264  transferase hexapeptide repeat containing protein  36.79 
 
 
210 aa  60.1  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0688  acetyltransferase  32.59 
 
 
195 aa  60.5  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2880  chloramphenicol acetyltransferase  49.21 
 
 
219 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0131  acetyltransferase  35.97 
 
 
205 aa  60.5  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.494408 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0721  galactoside-O-acetyltransferase  31.97 
 
 
149 aa  60.1  0.00000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0542567  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1487  tetrahydrodipicolinate succinyltransferase domain-containing protein  28.67 
 
 
239 aa  60.5  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.187706  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2683  tetrahydrodipicolinate succinyltransferase domain-containing protein  29.46 
 
 
240 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000102069  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1780  acetyltransferase  38.74 
 
 
203 aa  58.9  0.00000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0954  maltose O-acetyltransferase  35.83 
 
 
183 aa  59.3  0.00000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.186778  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2377  transferase hexapeptide repeat containing protein  35.45 
 
 
188 aa  59.3  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3541  transferase hexapeptide repeat containing protein  35.9 
 
 
198 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0739  transferase hexapeptide repeat containing protein  33.55 
 
 
200 aa  59.7  0.00000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.597159 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0600  hexapaptide repeat-containing transferase  50.91 
 
 
226 aa  59.3  0.00000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.152008  normal  0.590208 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1354  acetyltransferase (isoleucine patch superfamily)  37.17 
 
 
195 aa  58.9  0.00000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4185  hexapaptide repeat-containing transferase  37.39 
 
 
186 aa  58.9  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06836  acetyltransferase, CysE/LacA/LpxA/NodL family (AFU_orthologue; AFUA_2G08430)  34.92 
 
 
244 aa  58.5  0.00000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_28841  predicted protein  32.05 
 
 
204 aa  58.2  0.00000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2456  chloramphenicol acetyltransferase  50.91 
 
 
219 aa  58.2  0.00000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0223  hexapaptide repeat-containing transferase  46.27 
 
 
226 aa  58.2  0.00000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3909  putative colanic acid biosynthesis acetyltransferase WcaF  28.47 
 
 
184 aa  58.2  0.00000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.19089  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1688  carbonic anhydrase  39 
 
 
170 aa  57.8  0.00000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.243557 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0849  thiogalactoside acetyltransferase  30.95 
 
 
217 aa  57.8  0.00000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.148081  normal  0.207247 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1070  lipopolysaccharide biosynthesis protein  41.25 
 
 
316 aa  57.8  0.00000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.710053  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5557  hexapaptide repeat-containing transferase  49.09 
 
 
219 aa  57.4  0.00000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102322 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2102  serine O-acetyltransferase  34.82 
 
 
257 aa  57.8  0.00000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.348935 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4281  acetyltransferase  42.55 
 
 
177 aa  57.4  0.00000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2303  hexapaptide repeat-containing transferase  50.91 
 
 
219 aa  57.8  0.00000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.025404  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4918  hexapaptide repeat-containing transferase  32.65 
 
 
191 aa  57.8  0.00000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.198536  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0407  transferase hexapeptide repeat containing protein  42.31 
 
 
223 aa  57.4  0.00000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1952  acetyltransferase  35.85 
 
 
191 aa  57.4  0.00000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.582602  normal  0.324618 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1683  hexapaptide repeat-containing transferase  35.4 
 
 
166 aa  57.4  0.00000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.518627  normal  0.557053 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2830  acetyltransferase  30.66 
 
 
176 aa  57.4  0.00000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00579309  normal  0.0978513 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000385  acetyltransferase (isoleucine patch superfamily)  36.57 
 
 
160 aa  57.4  0.00000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1066  transferase hexapeptide repeat  35.48 
 
 
175 aa  57  0.00000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2893  acetyl transferase  39.5 
 
 
240 aa  57.4  0.00000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00000824087  normal  0.0256653 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1548  transferase hexapeptide repeat containing protein  40.45 
 
 
231 aa  57  0.00000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3195  transferase hexapeptide repeat protein  35.48 
 
 
175 aa  57  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09403  maltose O-acetyltransferase  34.13 
 
 
188 aa  57  0.0000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.419805  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2036  transferase hexapeptide repeat containing protein  42.86 
 
 
193 aa  56.6  0.0000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.327248  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3930  WxcM domain-containing protein  40 
 
 
317 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.505027  normal  0.395139 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1220  serine O-acetyltransferase  36.54 
 
 
259 aa  55.8  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0430  acetyltransferase, putative  31.36 
 
 
175 aa  56.2  0.0000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2186  tetrahydrodipicolinate succinyltransferase domain-containing protein  35.45 
 
 
241 aa  56.6  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2691  galactoside O-acetyltransferase  35 
 
 
178 aa  55.8  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000193243  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0046  hypothetical protein  36.21 
 
 
185 aa  56.2  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000000164559  normal  0.0456795 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2232  hexapaptide repeat-containing transferase  41.58 
 
 
199 aa  56.2  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2350  response regulator receiver domain-containing protein  38.89 
 
 
203 aa  56.6  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.254431 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1731  galactoside O-acetyltransferase  34.48 
 
 
198 aa  56.6  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.142359  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1660  acetyltransferase  37.86 
 
 
175 aa  56.2  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.135233  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>