23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_0589 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_0589  N-terminal methylation protein  100 
 
 		 201 aa  416  9.999999999999999e-116  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0602  N-terminal methylation protein  94.53 
 
 		 201 aa  368  1e-101  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000162543 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3370  N-terminal methylation  52.74 
 
 		 211 aa  204  6e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.306452 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0677  hypothetical protein  53.93 
 
 		 190 aa  190  2e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0323  general secretion pathway protein j, putative  50.82 
 
 		 186 aa  178  4e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1275  N-terminal methylation  48.47 
 
 		 202 aa  157  1e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0714  hypothetical protein  29.72 
 
 		 220 aa  56.2  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0511321  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0680  hypothetical protein  29.19 
 
 		 220 aa  55.8  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.197262  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0715  hypothetical protein  29.72 
 
 		 220 aa  55.1  0.0000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2614  putative general secretion pathway protein J  24.76 
 
 		 237 aa  52  0.000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.460481 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001886  general secretion pathway protein J  24.53 
 
 		 225 aa  51.6  0.000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1418  general secretion pathway protein J  21.83 
 
 		 216 aa  47  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2854  general secretion pathway protein J  22.45 
 
 		 216 aa  47  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.400784  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2035  general secretion pathway protein J  42.42 
 
 		 237 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3422  general secretion pathway protein J  38.71 
 
 		 232 aa  47  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000633509 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0724  hypothetical protein  27.7 
 
 		 239 aa  46.2  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.521463  normal  0.453877 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4585  general secretion pathway protein J  25 
 
 		 219 aa  46.6  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.979233  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24060  general secretion pathway protein J  43.08 
 
 		 237 aa  45.4  0.0005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2388  general secretion pathway protein J  31 
 
 		 212 aa  45.4  0.0006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000292779 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00607  general secretion pathway protein J  24.14 
 
 		 250 aa  43.9  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1895  general secretion pathway protein J  24.26 
 
 		 206 aa  42.4  0.005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2920  general secretion pathway protein J  27.36 
 
 		 239 aa  42  0.007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.34948  normal  0.107134 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60320  type 4 fimbrial biogenesis protein PilE  47.06 
 
 		 141 aa  41.6  0.008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000362369 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>