More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_1967 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP0793  ATP-dependent DNA helicase RecG  50.38 
 
 
682 aa  682    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1286  ATP-dependent DNA helicase RecG  51.42 
 
 
686 aa  693    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.231666  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3897  ATP-dependent DNA helicase RecG  68.04 
 
 
682 aa  970    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00158642  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1682  ATP-dependent DNA helicase RecG  50.45 
 
 
671 aa  691    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.193208  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2507  ATP-dependent DNA helicase RecG  68.33 
 
 
682 aa  977    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0246082  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3706  ATP-dependent DNA helicase RecG  68.04 
 
 
682 aa  970    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.152385  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3596  ATP-dependent DNA helicase RecG  68.34 
 
 
657 aa  942    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3614  ATP-dependent DNA helicase RecG  68.04 
 
 
682 aa  970    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.135491  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1162  ATP-dependent DNA helicase RecG  51.38 
 
 
678 aa  684    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000110827  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3903  ATP-dependent DNA helicase RecG  68.04 
 
 
682 aa  971    Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000501886  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1967  ATP-dependent DNA helicase RecG  100 
 
 
682 aa  1392    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3869  ATP-dependent DNA helicase RecG  68.04 
 
 
682 aa  970    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.12234e-39 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3678  ATP-dependent DNA helicase RecG  67.74 
 
 
685 aa  967    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.113157  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3954  ATP-dependent DNA helicase RecG  67.6 
 
 
682 aa  964    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0156287  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3993  ATP-dependent DNA helicase RecG  68.04 
 
 
682 aa  970    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000184974  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1289  ATP-dependent DNA helicase RecG  67.6 
 
 
682 aa  964    Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00448212  hitchhiker  0.00000000161574 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1311  ATP-dependent DNA helicase RecG  51.42 
 
 
686 aa  693    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1077  ATP-dependent DNA helicase RecG  76.39 
 
 
682 aa  1104    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.012078  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2553  ATP-dependent DNA helicase RecG  48.9 
 
 
681 aa  666    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0449  ATP-dependent DNA helicase RecG  48.03 
 
 
676 aa  648    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0217624  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1700  ATP-dependent DNA helicase RecG  48.37 
 
 
672 aa  676    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.828998  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0771  ATP-dependent DNA helicase RecG  46.91 
 
 
679 aa  627  1e-178  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000386747 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0536  ATP-dependent DNA helicase RecG  46.63 
 
 
676 aa  610  1e-173  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.626163  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1330  ATP-dependent DNA helicase RecG  47.59 
 
 
678 aa  598  1e-169  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1882  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.84 
 
 
689 aa  577  1.0000000000000001e-163  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.490572  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1278  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.53 
 
 
694 aa  564  1.0000000000000001e-159  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.177254  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0923  ATP-dependent DNA helicase RecG  47.51 
 
 
680 aa  556  1e-157  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.452189  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10120  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.94 
 
 
683 aa  550  1e-155  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.232228  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2088  ATP-dependent DNA helicase RecG  46.22 
 
 
685 aa  550  1e-155  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0126  ATP-dependent DNA helicase RecG  46.74 
 
 
685 aa  544  1e-153  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1741  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.79 
 
 
681 aa  536  1e-151  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1140  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.47 
 
 
779 aa  529  1e-149  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.291381  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1164  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.57 
 
 
692 aa  528  1e-148  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1224  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.62 
 
 
679 aa  514  1e-144  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1268  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.21 
 
 
740 aa  509  1e-143  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.630381  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1498  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.64 
 
 
819 aa  510  1e-143  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1051  ATP-dependent DNA helicase  41.21 
 
 
818 aa  512  1e-143  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1525  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.64 
 
 
819 aa  510  1e-143  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1079  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.8 
 
 
818 aa  508  9.999999999999999e-143  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.357653  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3834  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.25 
 
 
805 aa  506  9.999999999999999e-143  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.492162  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1079  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.31 
 
 
817 aa  504  1e-141  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.568332  hitchhiker  0.00243484 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1150  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.56 
 
 
818 aa  502  1e-141  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6915  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.31 
 
 
703 aa  499  1e-140  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.644521  normal  0.70543 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1650  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.07 
 
 
786 aa  501  1e-140  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0743  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.98 
 
 
763 aa  497  1e-139  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1019  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.91 
 
 
776 aa  498  1e-139  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000635751  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0719  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.68 
 
 
779 aa  494  9.999999999999999e-139  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3641  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.58 
 
 
862 aa  494  9.999999999999999e-139  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.091559  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2142  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.71 
 
 
700 aa  494  9.999999999999999e-139  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.118355  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1158  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.55 
 
 
827 aa  492  9.999999999999999e-139  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.350185  hitchhiker  0.00819024 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10468  ATP-dependent DNA helicase recG  41.49 
 
 
700 aa  492  9.999999999999999e-139  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.938842  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4880  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.15 
 
 
827 aa  490  1e-137  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0539602  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0601  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.97 
 
 
842 aa  489  1e-137  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3545  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.12 
 
 
688 aa  491  1e-137  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.020177  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1326  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.15 
 
 
714 aa  487  1e-136  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4575  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.48 
 
 
822 aa  487  1e-136  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0160  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.86 
 
 
846 aa  485  1e-136  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1975  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.47 
 
 
704 aa  486  1e-136  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.589837  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2518  ATP-dependent DNA helicase RecG  42 
 
 
778 aa  486  1e-136  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.758996  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10071  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.47 
 
 
815 aa  485  1e-135  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.212332 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1777  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.5 
 
 
767 aa  485  1e-135  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00030706  normal  0.0437642 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2935  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.64 
 
 
702 aa  482  1e-135  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.220068  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1869  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.01 
 
 
829 aa  485  1e-135  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0363135  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1117  ATP-dependent DNA helicase RecG  37.56 
 
 
689 aa  480  1e-134  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07921  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.77 
 
 
846 aa  482  1e-134  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0311  ATP-dependent DNA helicase RecG  40 
 
 
695 aa  481  1e-134  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2058  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.81 
 
 
822 aa  478  1e-133  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0511004  normal  0.682636 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1609  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.68 
 
 
717 aa  476  1e-133  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000503341  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1984  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.32 
 
 
690 aa  476  1e-133  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2192  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.52 
 
 
787 aa  473  1e-132  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3518  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.06 
 
 
842 aa  474  1e-132  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.82204 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2890  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.45 
 
 
678 aa  470  1.0000000000000001e-131  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000445621  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2305  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.66 
 
 
772 aa  469  1.0000000000000001e-131  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0034  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.64 
 
 
773 aa  468  9.999999999999999e-131  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0189216  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1225  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.94 
 
 
812 aa  468  9.999999999999999e-131  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.477406 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1459  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.01 
 
 
903 aa  467  9.999999999999999e-131  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.107258 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0196  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.04 
 
 
781 aa  467  9.999999999999999e-131  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.639349  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0158  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.72 
 
 
701 aa  468  9.999999999999999e-131  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0288  ATP-dependent DNA helicase RecG  38.46 
 
 
832 aa  466  9.999999999999999e-131  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.116338  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1903  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.8 
 
 
772 aa  468  9.999999999999999e-131  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.15263  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0386  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.57 
 
 
706 aa  463  1e-129  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.000000000898372  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2579  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.15 
 
 
678 aa  464  1e-129  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0922078  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1401  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.69 
 
 
701 aa  460  9.999999999999999e-129  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.413204  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08281  ATP-dependent DNA helicase RecG  36.93 
 
 
818 aa  459  9.999999999999999e-129  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16671  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.71 
 
 
846 aa  459  9.999999999999999e-129  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.461543 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3682  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.53 
 
 
696 aa  460  9.999999999999999e-129  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.146591  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1954  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.9 
 
 
765 aa  457  1e-127  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48450  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.48 
 
 
691 aa  457  1e-127  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0198  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.45 
 
 
691 aa  459  1e-127  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2025  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.8 
 
 
691 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08171  ATP-dependent DNA helicase RecG  35.82 
 
 
815 aa  454  1.0000000000000001e-126  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0579135  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4522  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.31 
 
 
753 aa  454  1.0000000000000001e-126  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1139  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.04 
 
 
776 aa  454  1.0000000000000001e-126  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.00836981  normal  0.0179484 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0967  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.67 
 
 
691 aa  450  1e-125  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.309793  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0764  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.64 
 
 
818 aa  450  1e-125  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08161  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.52 
 
 
818 aa  452  1e-125  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0640  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.74 
 
 
691 aa  451  1e-125  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5358  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.62 
 
 
692 aa  449  1e-125  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.419369  normal  0.636559 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1728  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.38 
 
 
701 aa  452  1e-125  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0201  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.73 
 
 
691 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>