More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU1696 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU1696  MoxR family protein  100 
 
 
313 aa  631  1e-180  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1632  MoxR family protein  85.94 
 
 
313 aa  524  1e-148  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000221226  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2426  ATPase  65.57 
 
 
314 aa  425  1e-118  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.624284  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2964  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  66.12 
 
 
305 aa  423  1e-117  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00460178 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1319  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  65.79 
 
 
305 aa  419  1e-116  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.225363  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2054  MoxR-like ATPases  66.67 
 
 
312 aa  411  1e-114  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0418936  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2044  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  64.12 
 
 
314 aa  392  1e-108  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3277  ATPase  55.44 
 
 
310 aa  360  2e-98  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1523  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  55.05 
 
 
305 aa  351  1e-95  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0210  ATPase  49.51 
 
 
347 aa  301  1e-80  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.283743  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3146  ATPase  49.19 
 
 
306 aa  299  5e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.109548 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1076  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  54.31 
 
 
319 aa  294  1e-78  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0622  ATPase  50.52 
 
 
327 aa  294  1e-78  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0692  ATPase  50 
 
 
323 aa  294  1e-78  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0405623 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1592  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.83 
 
 
325 aa  293  2e-78  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.488895  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6584  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  51.44 
 
 
325 aa  293  3e-78  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.597099 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19020  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  46.75 
 
 
313 aa  292  4e-78  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1431  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  53.58 
 
 
309 aa  292  4e-78  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0928  ATPase  49.32 
 
 
314 aa  292  4e-78  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02436  methanol dehydrogenase regulator  49.83 
 
 
308 aa  291  9e-78  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.808259  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2529  AAA_3 ATPase  49.19 
 
 
306 aa  290  1e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0659  ATPase  49.16 
 
 
341 aa  291  1e-77  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.936381 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0941  ATPase  45.9 
 
 
308 aa  290  3e-77  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2069  succinyl-CoA ligase, alpha subunit  49.64 
 
 
306 aa  288  7e-77  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.534339  normal  0.58415 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2386  ATPase  53.62 
 
 
306 aa  288  8e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0864  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50.35 
 
 
317 aa  287  2e-76  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2163  ATPase  51.62 
 
 
306 aa  287  2e-76  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.591841  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3626  putative ATPase  49.68 
 
 
308 aa  286  2.9999999999999996e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2912  ATPase  49.32 
 
 
331 aa  286  2.9999999999999996e-76  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0275816  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2096  ATPase  50.36 
 
 
306 aa  286  2.9999999999999996e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1359  ATPase  49.66 
 
 
310 aa  286  4e-76  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.020418  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1709  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  43.51 
 
 
321 aa  285  5e-76  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1116  ATPase  47.85 
 
 
317 aa  284  1.0000000000000001e-75  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26910  hypothetical protein  51.32 
 
 
305 aa  284  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1760  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50.92 
 
 
333 aa  283  2.0000000000000002e-75  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00353191  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1245  putative MoxR like protein  51.26 
 
 
306 aa  283  2.0000000000000002e-75  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0487098  normal  0.300383 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3112  ATPase  48.98 
 
 
331 aa  283  3.0000000000000004e-75  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0335747 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3009  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.66 
 
 
331 aa  282  4.0000000000000003e-75  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.116146  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1210  methanol dehydrogenase regulatory protein  47.85 
 
 
317 aa  283  4.0000000000000003e-75  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2279  hypothetical protein  50.99 
 
 
305 aa  282  5.000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2275  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  53.01 
 
 
322 aa  281  7.000000000000001e-75  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0216  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50.53 
 
 
302 aa  281  1e-74  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0316575  normal  0.204344 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1676  methanol dehydrogenase regulatory protein  50.95 
 
 
335 aa  280  2e-74  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1945  ATPase  50.57 
 
 
335 aa  280  2e-74  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1397  ATPase  49.15 
 
 
326 aa  279  4e-74  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.464074  normal  0.0203934 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0438  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  44.88 
 
 
316 aa  279  5e-74  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3377  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  46.58 
 
 
306 aa  278  6e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.28342  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0345  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  46.45 
 
 
310 aa  278  6e-74  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.898086  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2538  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  46.92 
 
 
314 aa  279  6e-74  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0280  ATPase  46.23 
 
 
312 aa  278  9e-74  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.760866  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1369  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50.94 
 
 
306 aa  278  1e-73  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1399  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50.94 
 
 
306 aa  278  1e-73  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2517  ATPase  52.22 
 
 
315 aa  277  2e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.431864  normal  0.118214 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2416  ATPase  48.81 
 
 
303 aa  277  2e-73  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.858381  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0889  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50 
 
 
329 aa  277  2e-73  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1219  ATPase  47.12 
 
 
310 aa  277  2e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.240667  normal  0.223931 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5776  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.12 
 
 
354 aa  276  3e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.895461  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2530  ATPase  47.96 
 
 
303 aa  276  3e-73  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2450  ATPase  49.67 
 
 
305 aa  276  3e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.620681  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4029  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.81 
 
 
306 aa  276  3e-73  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2126  ATPase  50 
 
 
303 aa  276  4e-73  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8515  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  51.28 
 
 
327 aa  275  7e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0550529  normal  0.0546803 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0704  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  46.9 
 
 
314 aa  275  7e-73  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1176  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50.17 
 
 
327 aa  275  8e-73  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.997573  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2912  ATPase  49.15 
 
 
349 aa  275  9e-73  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.275117 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2824  AAA family ATPase  45.93 
 
 
310 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0314282  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2759  magnesium chelatase; methanol dehydrogenase regulator  47.42 
 
 
309 aa  274  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2303  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.5 
 
 
306 aa  274  1.0000000000000001e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3038  AAA family ATPase  45.93 
 
 
310 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.392336  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2814  ATPase  48.5 
 
 
306 aa  274  1.0000000000000001e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.826305  normal  0.378923 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0473  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.94 
 
 
320 aa  273  3e-72  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.482238  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0813  ATPase  49.82 
 
 
310 aa  273  3e-72  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1953  methanol dehydrogenase regulatory protein; magnesium chelatase  46.74 
 
 
320 aa  272  4.0000000000000004e-72  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5567  ATPase  49.48 
 
 
305 aa  272  4.0000000000000004e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0627555  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2157  methanol dehydrogenase regulatory protein; magnesium chelatase  46.39 
 
 
320 aa  272  5.000000000000001e-72  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3073  AAA family ATPase  45.28 
 
 
310 aa  272  5.000000000000001e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.209671  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2153  MoxR protein  50 
 
 
303 aa  272  6e-72  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3810  ATPase  43.69 
 
 
318 aa  272  6e-72  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1054  ATPase  43.14 
 
 
318 aa  272  6e-72  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3201  ATPase  44.44 
 
 
319 aa  271  8.000000000000001e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.306413  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1778  ATPase  50 
 
 
303 aa  271  8.000000000000001e-72  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3068  ATPase, AAA family  45.28 
 
 
310 aa  271  9e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0718148  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2936  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.47 
 
 
341 aa  271  9e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000363093  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1968  ATPase  46.39 
 
 
320 aa  271  9e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1883  ATPase  49.63 
 
 
306 aa  271  9e-72  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.666763 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1679  ATPase  50.94 
 
 
305 aa  271  9e-72  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3034  ATPase, AAA family  47.08 
 
 
310 aa  271  1e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0802  ATPase  51.69 
 
 
317 aa  271  1e-71  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1856  ATPase  49.62 
 
 
303 aa  271  1e-71  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.195599  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0819  ATPase  48.86 
 
 
315 aa  271  1e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2248  moxR protein, putative  51.04 
 
 
305 aa  270  2e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.161333  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2119  magnesium chelatase, ChlI subunit  49.3 
 
 
302 aa  271  2e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2348  ATPase  46.99 
 
 
315 aa  270  2e-71  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0494  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  46.28 
 
 
313 aa  270  2e-71  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2242  ATPase  49.62 
 
 
313 aa  271  2e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.839891  normal  0.451068 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2107  ATPase  49.62 
 
 
303 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1967  ATPase  48.12 
 
 
303 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.379731  normal  0.918061 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2773  magnesium chelatase; methanol dehydrogenase regulator  46.74 
 
 
310 aa  269  4e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0680478  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2098  ATPase  48.5 
 
 
303 aa  269  4e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2623  ATPase  48.87 
 
 
303 aa  269  4e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.3673  normal  0.0965943 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>