15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU1397 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1397  cytochrome c family protein, putative  100 
 
 		 567 aa  1161    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1483  cytochrome c family protein, putative  72.69 
 
 		 563 aa  818    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2293  hypothetical protein  36.45 
 
 		 526 aa  283  5.000000000000001e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.289828  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4696  hypothetical protein  31.64 
 
 		 541 aa  243  7.999999999999999e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.797222  normal  0.786812 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3792  hypothetical protein  29.84 
 
 		 635 aa  192  1e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3486  cytochrome c, putative  23.92 
 
 		 559 aa  100  5e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0158874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1979  cytochrome c, putative  25.27 
 
 		 516 aa  100  5e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.67916 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3889  extracellular ligand-binding receptor  24.49 
 
 		 541 aa  100  9e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2451  cytochrome c  25.49 
 
 		 558 aa  99.8  1e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.131224  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2285  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  23.48 
 
 		 559 aa  95.9  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1257  ABC transporter, periplasmic-substrate binding protein, putative  21.95 
 
 		 541 aa  92.8  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2460  cytochrome c  35.4 
 
 		 508 aa  79.7  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.360393  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2628  cytochrome c, putative  31.61 
 
 		 551 aa  74.7  0.000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0327  hypothetical protein  32.64 
 
 		 187 aa  60.1  0.0000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.126793  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1065  hypothetical protein  25.44 
 
 		 416 aa  46.2  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.145619  normal  0.0411422 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>