27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0561 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0561  hypothetical protein  100 
 
 		 577 aa  1189    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0010  KAP P-loop domain-containing protein  41.73 
 
 		 728 aa  439  9.999999999999999e-123  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00154725 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1598  KAP P-loop domain protein  37.7 
 
 		 749 aa  350  6e-95  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0025  KAP family P-loop domain protein  27.23 
 
 		 884 aa  200  5e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.046413 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001492  hypothetical protein  29.07 
 
 		 758 aa  152  1e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.199722  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4676  hypothetical protein  31.56 
 
 		 736 aa  131  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0090  hypothetical protein  30.88 
 
 		 706 aa  130  7.000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0396414  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1639  KAP P-loop domain-containing protein  27.27 
 
 		 862 aa  110  8.000000000000001e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.552489  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3890  KAP P-loop domain protein  23.38 
 
 		 706 aa  102  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.329172  normal  0.0371093 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2922  P-loop ATPase-like protein  26.39 
 
 		 715 aa  79.7  0.0000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.182539 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1014  P-loop ATPase  42.86 
 
 		 315 aa  70.1  0.0000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.287262  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0229  KAP P-loop domain-containing protein  23.03 
 
 		 735 aa  69.3  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.471102  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3386  hypothetical protein  28.42 
 
 		 784 aa  66.2  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.256029  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5211  KAP P-loop domain-containing protein  27.31 
 
 		 419 aa  53.9  0.000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2881  KAP P-loop domain-containing protein  35.29 
 
 		 671 aa  53.1  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.660206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2126  KAP P-loop domain-containing protein  29.29 
 
 		 945 aa  53.1  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4250  KAP P-loop domain-containing protein  25.81 
 
 		 594 aa  51.2  0.00005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000235835 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28360  KAP family P-loop domain protein  33.75 
 
 		 564 aa  50.8  0.00007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.143031 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2314  KAP P-loop domain-containing protein  26.6 
 
 		 601 aa  50.4  0.00008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.318081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1051  KAP P-loop domain-containing protein  23.53 
 
 		 672 aa  49.3  0.0002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3618  putative oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  29.55 
 
 		 830 aa  45.8  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.387409  normal  0.12655 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5061  KAP P-loop domain-containing protein  25.23 
 
 		 628 aa  44.7  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5213  KAP P-loop domain-containing protein  25.23 
 
 		 628 aa  44.7  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.125841 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3155  KAP P-loop  25.23 
 
 		 628 aa  44.7  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4815  KAP P-loop domain-containing protein  23.4 
 
 		 623 aa  44.3  0.006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.678803  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1472  KAP P-loop  27.71 
 
 		 644 aa  43.9  0.007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.628222  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0936  KAP P-loop domain protein  26.51 
 
 		 647 aa  43.9  0.009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>