More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0387 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0387  undecaprenol kinase, putative  100 
 
 		 269 aa  520  1e-146  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3133  undecaprenyl-diphosphatase  70.63 
 
 		 269 aa  384  1e-105  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000445999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4137  putative undecaprenol kinase  69.78 
 
 		 270 aa  361  7.0000000000000005e-99  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.383043  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3867  undecaprenol kinase  67.04 
 
 		 271 aa  332  3e-90  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3783  undecaprenol kinase  66.67 
 
 		 271 aa  330  1e-89  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.261565  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3583  putative undecaprenol kinase  62.17 
 
 		 273 aa  297  1e-79  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0524  undecaprenol kinase  58.65 
 
 		 272 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1039  undecaprenol kinase  48.46 
 
 		 279 aa  233  3e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0859  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  49.44 
 
 		 265 aa  224  8e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.136204  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0571  undecaprenyl-diphosphatase  48.7 
 
 		 261 aa  214  8e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000920571  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1834  Bacitracin resistance protein BacA  41.64 
 
 		 265 aa  212  3.9999999999999995e-54  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0067  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  49.04 
 
 		 264 aa  209  4e-53  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1845  undecaprenol kinase  49.43 
 
 		 262 aa  209  5e-53  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1161  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  44.53 
 
 		 266 aa  207  1e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000507346  normal  0.0186967 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1258  putative undecaprenol kinase  48.21 
 
 		 266 aa  207  2e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.906554 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0054  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  43.49 
 
 		 267 aa  204  9e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.849769  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00857  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  43.49 
 
 		 267 aa  204  1e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03448  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  45.76 
 
 		 266 aa  203  2e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001615  undecaprenyl-diphosphatase  42.91 
 
 		 267 aa  204  2e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.754191  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1112  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  43.82 
 
 		 266 aa  202  4e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0511751  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3641  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  42.32 
 
 		 265 aa  202  6e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1289  undecaprenyl-diphosphatase  45 
 
 		 258 aa  201  9e-51  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2900  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  44.19 
 
 		 266 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000171872  hitchhiker  0.00310474 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1004  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  45.15 
 
 		 266 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00218186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2982  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  44.19 
 
 		 266 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000265247  normal  0.0325105 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3079  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  43.82 
 
 		 266 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000402787  hitchhiker  0.000110781 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2232  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  47.1 
 
 		 265 aa  199  3e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00497106  hitchhiker  0.0000196312 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1734  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  46.13 
 
 		 264 aa  199  3.9999999999999996e-50  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00685278  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0708  undecaprenyl-diphosphatase  44.94 
 
 		 302 aa  198  6e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3115  undecaprenol kinase  41.26 
 
 		 264 aa  197  1.0000000000000001e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2988  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  44.71 
 
 		 266 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.22302  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3161  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  42.7 
 
 		 266 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.166065 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1152  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  42.7 
 
 		 266 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0107738  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1196  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  42.7 
 
 		 266 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.38552  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1229  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  42.7 
 
 		 266 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.188967  normal  0.828376 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1080  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  43.54 
 
 		 266 aa  196  3e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.025115  normal  0.0318175 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2690  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  44.61 
 
 		 267 aa  194  1e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00940094  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1293  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  42.7 
 
 		 266 aa  193  3e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0831  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.64 
 
 		 266 aa  192  5e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000733877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2835  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  45.1 
 
 		 265 aa  192  7e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0967  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  43.61 
 
 		 266 aa  191  9e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000277611  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0835  putative undecaprenol kinase  44.87 
 
 		 261 aa  190  2e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1243  undecaprenyl-diphosphatase  43.08 
 
 		 272 aa  190  2e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.373475  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20990  Undecaprenyl-diphosphatase  45.56 
 
 		 285 aa  190  2e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.475195 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0174  putative undecaprenol kinase  46.01 
 
 		 267 aa  189  2.9999999999999997e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0330  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  42.7 
 
 		 266 aa  189  4e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2826  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  42.42 
 
 		 266 aa  186  5e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0258083  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3596  undecaprenol kinase  46.1 
 
 		 272 aa  185  8e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.557046  normal  0.0100362 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1967  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.33 
 
 		 288 aa  184  1.0000000000000001e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.39732  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1869  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  42.49 
 
 		 282 aa  183  2.0000000000000003e-45  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0119311 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1046  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  46.09 
 
 		 266 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.403088  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2623  undecaprenyl-diphosphatase  43.01 
 
 		 274 aa  182  4.0000000000000006e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.151549  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4342  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  42.75 
 
 		 272 aa  182  5.0000000000000004e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2250  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.01 
 
 		 282 aa  181  2e-44  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.246331  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0633  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.7 
 
 		 320 aa  179  2.9999999999999997e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.395478 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4191  undecaprenol kinase  40.38 
 
 		 320 aa  177  1e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.195911 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2282  undecaprenol kinase  42.49 
 
 		 273 aa  177  2e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000232331  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1937  undecaprenol kinase  43.01 
 
 		 272 aa  175  7e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.07864  normal  0.489948 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02211  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  42.22 
 
 		 293 aa  174  9.999999999999999e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3383  putative undecaprenol kinase  40.86 
 
 		 290 aa  173  2.9999999999999996e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0358  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.63 
 
 		 283 aa  171  1e-41  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3522  undecaprenol kinase  40.31 
 
 		 274 aa  171  1e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.555118  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1735  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.86 
 
 		 283 aa  170  2e-41  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2332  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.63 
 
 		 287 aa  171  2e-41  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.684943  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0482  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40.15 
 
 		 282 aa  169  3e-41  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0712412  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1692  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.42 
 
 		 282 aa  170  3e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1838  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.35 
 
 		 292 aa  169  5e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.155916  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2660  undecaprenol kinase  41.04 
 
 		 277 aa  169  6e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.235772  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0789  Undecaprenyl-diphosphatase  39.02 
 
 		 279 aa  167  1e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0413787  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0116  Bacitracin resistance protein BacA  38.87 
 
 		 293 aa  167  1e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4500  undecaprenol kinase  39.41 
 
 		 386 aa  167  2e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3232  undecaprenol kinase  40.66 
 
 		 322 aa  167  2e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.14463 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2864  undecaprenol kinase  40.66 
 
 		 322 aa  167  2e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1194  undecaprenol kinase  39.72 
 
 		 289 aa  167  2e-40  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0743133  normal  0.0386066 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0458  undecaprenol kinase  38.35 
 
 		 302 aa  167  2e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.111812  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20010  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40.52 
 
 		 286 aa  166  2.9999999999999998e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00122239 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0665  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.32 
 
 		 282 aa  166  4e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.790774  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0725  putative undecaprenol kinase  39.69 
 
 		 281 aa  166  5e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.60596  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0444  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.57 
 
 		 282 aa  164  1.0000000000000001e-39  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0335  undecaprenol kinase  39.46 
 
 		 291 aa  163  2.0000000000000002e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.395953  normal  0.197846 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2797  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40.44 
 
 		 292 aa  162  6e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3549  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  37.22 
 
 		 269 aa  160  1e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.750643  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2775  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40 
 
 		 280 aa  161  1e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000224739  hitchhiker  0.000207521 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3483  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.55 
 
 		 276 aa  161  1e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0662586  normal  0.599871 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1209  undecaprenol kinase  37.83 
 
 		 290 aa  160  2e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4798  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  36.15 
 
 		 312 aa  160  2e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0638126  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1266  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.69 
 
 		 260 aa  159  3e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0427  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40.45 
 
 		 261 aa  160  3e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000720891  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3043  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.72 
 
 		 276 aa  159  6e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1910  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.72 
 
 		 277 aa  159  6e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000014335 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2769  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  36.22 
 
 		 259 aa  158  7e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2440  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  36.22 
 
 		 259 aa  158  8e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0204292  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0282  Undecaprenyl-diphosphatase  40.15 
 
 		 291 aa  158  9e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.160611 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0115  bacitracin resistance protein BacA  40.67 
 
 		 268 aa  158  9e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.153231  normal  0.364693 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11800  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  42.55 
 
 		 277 aa  157  1e-37  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.105146  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2444  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  36.22 
 
 		 259 aa  157  2e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.893911  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2717  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  36.22 
 
 		 259 aa  157  2e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000013117 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2722  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  36.61 
 
 		 259 aa  156  3e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2167  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.95 
 
 		 286 aa  156  3e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00790926  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2732  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  35.32 
 
 		 259 aa  156  4e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000407022  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>