More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_0427 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_0427  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  100 
 
 
261 aa  506  9.999999999999999e-143  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000720891  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2769  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  60.7 
 
 
259 aa  313  9.999999999999999e-85  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2722  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  60.7 
 
 
259 aa  314  9.999999999999999e-85  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2440  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  60.31 
 
 
259 aa  313  2.9999999999999996e-84  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0204292  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2586  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  60.31 
 
 
259 aa  313  2.9999999999999996e-84  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0713308 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2717  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  60.31 
 
 
259 aa  312  3.9999999999999997e-84  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000013117 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2444  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  60.31 
 
 
259 aa  312  3.9999999999999997e-84  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.893911  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2479  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  60.7 
 
 
259 aa  311  7.999999999999999e-84  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000149761  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2732  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  59.53 
 
 
259 aa  306  2.0000000000000002e-82  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000407022  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1660  Bacitracin resistance protein BacA  44.4 
 
 
267 aa  210  2e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1266  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  42.91 
 
 
260 aa  207  2e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08750  putative undecaprenol kinase  43.7 
 
 
259 aa  198  7.999999999999999e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.951651  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1243  undecaprenyl-diphosphatase  40.77 
 
 
272 aa  175  8e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.373475  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2519  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  64.57 
 
 
135 aa  172  3.9999999999999995e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0532062  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3133  undecaprenyl-diphosphatase  40.98 
 
 
269 aa  172  5.999999999999999e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000445999  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1174  bacitracin resistance protein BacA  41.2 
 
 
273 aa  171  1e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0646  bacitracin resistance protein  38.52 
 
 
263 aa  171  1e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000570462  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3596  undecaprenol kinase  35.85 
 
 
272 aa  168  9e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.557046  normal  0.0100362 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4137  putative undecaprenol kinase  39.23 
 
 
270 aa  166  4e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.383043  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0387  undecaprenol kinase, putative  39.1 
 
 
269 aa  162  5.0000000000000005e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0750  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  35.19 
 
 
270 aa  162  7e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0593  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  35.19 
 
 
270 aa  162  7e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0594  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  35.19 
 
 
270 aa  162  7e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0738  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  35.19 
 
 
270 aa  162  7e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.6963000000000003e-19 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0810  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  35.19 
 
 
270 aa  162  7e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4622  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  34.81 
 
 
270 aa  162  7e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000330334 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0714  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  34.81 
 
 
270 aa  161  9e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.38134  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0649  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  34.81 
 
 
270 aa  161  1e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1039  undecaprenol kinase  38.64 
 
 
279 aa  160  1e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0683  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  34.81 
 
 
270 aa  161  1e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.309351  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0597  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  34.59 
 
 
270 aa  160  2e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0571  undecaprenyl-diphosphatase  38.71 
 
 
261 aa  160  2e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000920571  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0572  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  35.34 
 
 
270 aa  159  3e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2634  Undecaprenyl-diphosphatase  35.98 
 
 
269 aa  159  4e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0196  Bacitracin resistance protein BacA  37 
 
 
269 aa  159  5e-38  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000127959  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04545  putative undecaprenol kinase  38.38 
 
 
264 aa  159  6e-38  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0835  putative undecaprenol kinase  35.55 
 
 
261 aa  157  1e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3115  undecaprenol kinase  36.96 
 
 
264 aa  156  3e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0859  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  36.4 
 
 
265 aa  156  3e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.136204  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1845  undecaprenol kinase  38.85 
 
 
262 aa  155  8e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0067  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  36.88 
 
 
264 aa  154  2e-36  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3583  putative undecaprenol kinase  37.78 
 
 
273 aa  154  2e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0482  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  35.4 
 
 
282 aa  152  7e-36  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0712412  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2690  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  37.31 
 
 
267 aa  152  7e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00940094  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1289  undecaprenyl-diphosphatase  36.58 
 
 
258 aa  150  1e-35  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0967  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  36.29 
 
 
266 aa  150  2e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000277611  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0054  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  34.87 
 
 
267 aa  149  4e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.849769  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1004  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  34.88 
 
 
266 aa  149  5e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00218186  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001615  undecaprenyl-diphosphatase  34.48 
 
 
267 aa  149  6e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.754191  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1080  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  34.59 
 
 
266 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.025115  normal  0.0318175 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00857  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  34.48 
 
 
267 aa  147  2.0000000000000003e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2518  bacitracin resistance protein, C-terminal  55.3 
 
 
135 aa  145  5e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0532062  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1834  Bacitracin resistance protein BacA  36.54 
 
 
265 aa  145  5e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3867  undecaprenol kinase  39.08 
 
 
271 aa  145  6e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1692  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  34.53 
 
 
282 aa  145  8.000000000000001e-34  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1869  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  37.04 
 
 
282 aa  144  1e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0119311 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03448  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  35.41 
 
 
266 aa  144  1e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1161  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  34.59 
 
 
266 aa  144  2e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000507346  normal  0.0186967 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2305  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  33.46 
 
 
272 aa  143  3e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.855528  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2623  undecaprenyl-diphosphatase  32.97 
 
 
274 aa  143  4e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.151549  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1735  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  34.41 
 
 
283 aa  142  5e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1910  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  35.32 
 
 
277 aa  142  5e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000014335 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1112  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  34.88 
 
 
266 aa  142  6e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0511751  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3783  undecaprenol kinase  39.08 
 
 
271 aa  141  9e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.261565  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2232  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  35.32 
 
 
265 aa  141  9e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00497106  hitchhiker  0.0000196312 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0789  Undecaprenyl-diphosphatase  33.21 
 
 
279 aa  140  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0413787  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1046  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  35.71 
 
 
266 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.403088  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2900  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  34.11 
 
 
266 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000171872  hitchhiker  0.00310474 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2982  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  34.11 
 
 
266 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000265247  normal  0.0325105 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3079  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  34.11 
 
 
266 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000402787  hitchhiker  0.000110781 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02927  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  34.07 
 
 
273 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00198226  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0643  undecaprenol kinase  34.07 
 
 
273 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0008288  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02877  hypothetical protein  34.07 
 
 
273 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00183865  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0642  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  34.07 
 
 
273 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000274172  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1823  Bacitracin resistance protein BacA  35.61 
 
 
265 aa  140  1.9999999999999998e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3350  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  34.07 
 
 
270 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3520  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  34.07 
 
 
273 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.483237  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2250  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  33.45 
 
 
282 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.246331  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3235  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  34.07 
 
 
273 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4369  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  34.07 
 
 
273 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.934613  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3488  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  34.07 
 
 
273 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1937  undecaprenol kinase  33.85 
 
 
272 aa  139  3e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.07864  normal  0.489948 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2988  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  33.6 
 
 
266 aa  140  3e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.22302  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2660  undecaprenol kinase  36.36 
 
 
277 aa  139  4.999999999999999e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.235772  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1734  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  34.75 
 
 
264 aa  139  4.999999999999999e-32  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00685278  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2775  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  35.64 
 
 
280 aa  139  4.999999999999999e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000224739  hitchhiker  0.000207521 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3460  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  34.43 
 
 
273 aa  139  6e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0059068  normal  0.174069 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09180  Undecaprenyl-diphosphatase  34.24 
 
 
281 aa  139  6e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.352379  normal  0.402204 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0186  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  36 
 
 
273 aa  139  6e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1229  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  33.33 
 
 
266 aa  138  7.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.188967  normal  0.828376 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3161  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  33.33 
 
 
266 aa  138  7.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.166065 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1152  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  33.33 
 
 
266 aa  138  7.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0107738  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0831  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  33.59 
 
 
266 aa  138  7.999999999999999e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000733877  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1196  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  33.33 
 
 
266 aa  138  7.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.38552  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2826  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  34.5 
 
 
266 aa  138  8.999999999999999e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0258083  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2167  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  33.98 
 
 
286 aa  138  8.999999999999999e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00790926  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0302  bacitracin resistance protein BacA  38.74 
 
 
248 aa  138  1e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.425765  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0116  Bacitracin resistance protein BacA  37.12 
 
 
293 aa  137  1e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0466  bacitracin resistance protein BacA  37.01 
 
 
249 aa  138  1e-31  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.13617  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09021  bacitracin resistance protein BacA  32.45 
 
 
266 aa  137  2e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>