139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0353 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0353  hypothetical protein  100 
 
 		 148 aa  293  7e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0345  hypothetical protein  65.99 
 
 		 147 aa  196  1.0000000000000001e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.141714  hitchhiker  0.00000000000399194 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0030  membrane protein-like protein  57.53 
 
 		 153 aa  176  7e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0561299  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0381  SNARE associated Golgi protein  58.16 
 
 		 162 aa  166  1e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.129917  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0493  hypothetical protein  53.73 
 
 		 134 aa  149  1e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3614  membrane protein-like protein  50.34 
 
 		 149 aa  147  5e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3548  membrane protein-like protein  51.03 
 
 		 149 aa  147  6e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2017  hypothetical protein  42.86 
 
 		 151 aa  122  1e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0715199  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1779  SNARE associated Golgi protein  48.06 
 
 		 144 aa  120  7e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.380295  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1381  membrane protein-like protein  41.96 
 
 		 146 aa  119  1.9999999999999998e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3229  transmembrane protein  48.06 
 
 		 167 aa  110  5e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.588156  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0335  hypothetical protein  46.67 
 
 		 142 aa  110  9e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0229  hypothetical protein  46.21 
 
 		 143 aa  109  1.0000000000000001e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4069  membrane protein-like  43.28 
 
 		 143 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4297  membrane protein-like protein  43.28 
 
 		 143 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2244  membrane protein-like protein  43.48 
 
 		 146 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0054372  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4308  membrane protein-like protein  44.78 
 
 		 143 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.266341 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3220  membrane protein-like protein  43.28 
 
 		 143 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.55153 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2552  hypothetical protein  44.53 
 
 		 144 aa  106  9.000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.945039 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3715  membrane protein-like protein  44.03 
 
 		 143 aa  106  1e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2405  hypothetical protein  45.89 
 
 		 145 aa  106  1e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2147  putative integral membrane protein  41.3 
 
 		 139 aa  106  1e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.864762  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1716  membrane protein-like  43.51 
 
 		 143 aa  104  4e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4193  membrane protein-like protein  42.54 
 
 		 143 aa  102  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.194091  normal  0.36355 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1825  hypothetical protein  43.07 
 
 		 145 aa  101  3e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.272987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3535  hypothetical protein  43.61 
 
 		 145 aa  101  4e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0020  SNARE associated Golgi protein  41.91 
 
 		 153 aa  100  6e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1852  hypothetical protein  43.8 
 
 		 145 aa  100  6e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00707673 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2202  hypothetical protein  43.61 
 
 		 145 aa  100  7e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0684  membrane protein-like protein  43.61 
 
 		 145 aa  100  9e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.766912 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0641  inner membrane protein  44.12 
 
 		 143 aa  99.8  1e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.346096  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5166  membrane protein  45.13 
 
 		 146 aa  98.6  3e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002528  hypothetical protein  42.54 
 
 		 153 aa  97.1  8e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03488  hypothetical protein  41.61 
 
 		 153 aa  96.3  1e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5610  SNARE associated Golgi protein  40.6 
 
 		 144 aa  95.5  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.407349 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28510  hypothetical protein  43.41 
 
 		 147 aa  94.7  3e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000173571 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1327  hypothetical protein  40 
 
 		 140 aa  95.1  3e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0199997 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2487  hypothetical protein  42.64 
 
 		 147 aa  94.4  4e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2318  hypothetical protein  46.97 
 
 		 136 aa  94.4  5e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1466  hypothetical protein  38.64 
 
 		 144 aa  94.4  5e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.412345  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3328  SNARE associated Golgi protein  41.54 
 
 		 140 aa  94  6e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00111498 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3561  hypothetical protein  42.34 
 
 		 141 aa  94  7e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0933  transmembrane protein  46.22 
 
 		 145 aa  93.2  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.590035 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2237  membrane protein-like protein  45.38 
 
 		 145 aa  93.2  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.564662  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4281  hypothetical protein  38.35 
 
 		 146 aa  92  3e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01067  membrane protein-like protein  38.46 
 
 		 132 aa  91.7  3e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0101097  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2259  transmembrane protein  44.54 
 
 		 145 aa  91.3  4e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.867153  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3162  hypothetical protein  41.61 
 
 		 141 aa  90.9  5e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2940  hypothetical protein  37.96 
 
 		 143 aa  90.9  6e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1070  hypothetical protein  43.61 
 
 		 142 aa  90.5  7e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0088  hypothetical protein  43.38 
 
 		 153 aa  90.5  7e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2982  hypothetical protein  41.61 
 
 		 141 aa  90.1  8e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3064  hypothetical protein  40.88 
 
 		 141 aa  89.4  2e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.994657 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0636  hypothetical protein  40.14 
 
 		 142 aa  87.8  4e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1225  hypothetical protein  39.44 
 
 		 140 aa  87.8  4e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3262  hypothetical protein  40 
 
 		 141 aa  85.5  2e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.175834  normal  0.086413 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3649  membrane protein-like protein  38.6 
 
 		 116 aa  86.3  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.593494 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0487  putative transmembrane protein  42.96 
 
 		 160 aa  85.1  3e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.528398  normal  0.0272623 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1029  hypothetical protein  40 
 
 		 141 aa  85.1  3e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1130  hypothetical protein  41.54 
 
 		 141 aa  85.1  3e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1056  hypothetical protein  42.22 
 
 		 138 aa  84.7  4e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.58639 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1096  hypothetical protein  40 
 
 		 141 aa  84.3  5e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.528904  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2534  hypothetical protein  39.71 
 
 		 142 aa  83.6  8e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000278761  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2910  hypothetical protein  38.19 
 
 		 181 aa  83.6  8e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1579  hypothetical protein  40.15 
 
 		 156 aa  83.6  9e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.49497  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02544  conserved inner membrane protein  39.86 
 
 		 142 aa  82.8  0.000000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00731446  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0995  conserved hypothetical protein  39.86 
 
 		 142 aa  82.8  0.000000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000205167  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02509  hypothetical protein  39.86 
 
 		 142 aa  82.8  0.000000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0129195  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2825  hypothetical protein  39.86 
 
 		 142 aa  82.8  0.000000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000883213  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1018  hypothetical protein  39.86 
 
 		 142 aa  82.8  0.000000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0859423  hitchhiker  0.00416875 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2811  hypothetical protein  39.86 
 
 		 142 aa  82.8  0.000000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000161283  hitchhiker  0.000505734 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0535  putative transmembrane protein  41.98 
 
 		 160 aa  83.2  0.000000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1001  hypothetical protein  40 
 
 		 143 aa  82.4  0.000000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.453071  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3935  hypothetical protein  39.86 
 
 		 142 aa  82.4  0.000000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00814425  normal  0.809511 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2972  hypothetical protein  39.16 
 
 		 142 aa  82  0.000000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000189151  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0190  uncharacterized membrane-associated protein  39.06 
 
 		 171 aa  82.4  0.000000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.421654  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3187  hypothetical protein  39.16 
 
 		 142 aa  81.6  0.000000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000058062  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1034  hypothetical protein  39.85 
 
 		 141 aa  81.6  0.000000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3587  hypothetical protein  37.84 
 
 		 202 aa  81.3  0.000000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.428384 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0386  hypothetical protein  30 
 
 		 147 aa  80.9  0.000000000000006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.369769  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0365  hypothetical protein  30 
 
 		 147 aa  80.9  0.000000000000006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3029  hypothetical protein  38.03 
 
 		 181 aa  80.1  0.000000000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.332295 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0287  hypothetical protein  39.82 
 
 		 140 aa  79.7  0.00000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0892  hypothetical protein  40.46 
 
 		 160 aa  79.7  0.00000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.241646 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1387  hypothetical protein  36.3 
 
 		 167 aa  79.7  0.00000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1344  hypothetical protein  29.23 
 
 		 147 aa  79.7  0.00000000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3374  hypothetical protein  36.88 
 
 		 138 aa  79.3  0.00000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3169  hypothetical protein  37.32 
 
 		 142 aa  79  0.00000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0441375  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1561  hypothetical protein  37.67 
 
 		 178 aa  79.3  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0574  hypothetical protein  35.25 
 
 		 167 aa  79.3  0.00000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0343  hypothetical protein  35.48 
 
 		 193 aa  77.4  0.00000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.38894  normal  0.477555 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2638  putative inner membrane protein  36 
 
 		 140 aa  76.6  0.0000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.111038  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3208  hypothetical protein  38.69 
 
 		 142 aa  76.6  0.0000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000592602  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0328  putative transmembrane protein  35.48 
 
 		 193 aa  76.6  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1129  hypothetical protein  39.26 
 
 		 162 aa  74.7  0.0000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0566076  normal  0.347898 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3361  hypothetical protein  37.4 
 
 		 160 aa  74.7  0.0000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.276443  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4122  putative inner membrane protein  36.96 
 
 		 141 aa  74.3  0.0000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4633  hypothetical protein  39.53 
 
 		 156 aa  74.3  0.0000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0426  hypothetical protein  34.9 
 
 		 192 aa  73.9  0.0000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.167258  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0892  hypothetical protein  39.29 
 
 		 142 aa  73.9  0.0000000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000438982  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>