28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_0570 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_0570  hypothetical protein  100 
 
 		 433 aa  870    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.74433e-18 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0557  hypothetical protein  67.11 
 
 		 452 aa  563  1.0000000000000001e-159  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000338101  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0656  hypothetical protein  42.23 
 
 		 462 aa  314  1.9999999999999998e-84  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000988469  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0110  hypothetical protein  38.81 
 
 		 454 aa  288  2e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3403  hypothetical protein  38.56 
 
 		 460 aa  252  8.000000000000001e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0717001  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3304  LamB porin family protein, putative  38.94 
 
 		 457 aa  248  1e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00991387  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3254  LamB porin family protein, putative  36.4 
 
 		 472 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000126624  decreased coverage  1.37943e-21 
 
 
 
NC_008609  Ppro_0521  LamB porin family protein, putative  33.47 
 
 		 464 aa  199  7.999999999999999e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000174972  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1933  hypothetical protein  33.49 
 
 		 434 aa  182  1e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000351856  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2187  hypothetical protein  29.34 
 
 		 502 aa  178  2e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.080107  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3257  LamB porin family protein, putative  30 
 
 		 493 aa  177  3e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000051646  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2284  hypothetical protein  33.55 
 
 		 447 aa  165  1.0000000000000001e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000344842 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1309  hypothetical protein  32.54 
 
 		 381 aa  155  1e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1745  hypothetical protein  25.36 
 
 		 534 aa  63.9  0.000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000216111  unclonable  0.0000185199 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0310  hypothetical protein  32.06 
 
 		 439 aa  57.4  0.0000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.0000000163597  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0652  hypothetical protein  23.09 
 
 		 448 aa  55.8  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.758355  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2271  hypothetical protein  22.38 
 
 		 473 aa  53.5  0.000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.62038e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2095  hypothetical protein  27.84 
 
 		 529 aa  52.4  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2846  hypothetical protein  26.25 
 
 		 464 aa  49.3  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1856  hypothetical protein  27.07 
 
 		 543 aa  48.5  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2562  hypothetical protein  35 
 
 		 474 aa  48.1  0.0003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00382555 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1010  hypothetical protein  27.01 
 
 		 447 aa  48.1  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.395908  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0582  hypothetical protein  30.38 
 
 		 505 aa  45.4  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000609741  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1310  hypothetical protein  38.24 
 
 		 376 aa  44.7  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0563  hypothetical protein  29.09 
 
 		 510 aa  44.7  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000287642  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0011  hypothetical protein  29.41 
 
 		 435 aa  43.9  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000177215  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1248  hypothetical protein  32.06 
 
 		 542 aa  43.5  0.007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0419522  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1011  hypothetical protein  27.14 
 
 		 448 aa  43.1  0.009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000000669415  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>