29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1745 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_1745  hypothetical protein  100 
 
 		 534 aa  1087    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000216111  unclonable  0.0000185199 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3254  LamB porin family protein, putative  37.99 
 
 		 472 aa  87.4  6e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000126624  decreased coverage  1.37943e-21 
 
 
 
NC_011769  DvMF_2846  hypothetical protein  35.39 
 
 		 464 aa  87  7e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3304  LamB porin family protein, putative  26.58 
 
 		 457 aa  79  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00991387  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0110  hypothetical protein  31.43 
 
 		 454 aa  78.6  0.0000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0582  hypothetical protein  32.29 
 
 		 505 aa  76.3  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000609741  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1010  hypothetical protein  35.12 
 
 		 447 aa  74.3  0.000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.395908  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1011  hypothetical protein  35.59 
 
 		 448 aa  73.9  0.000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000000669415  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0656  hypothetical protein  29.76 
 
 		 462 aa  73.2  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000988469  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1309  hypothetical protein  30.96 
 
 		 381 aa  72  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2562  hypothetical protein  32.43 
 
 		 474 aa  69.7  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00382555 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2095  hypothetical protein  32.96 
 
 		 529 aa  69.3  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0521  LamB porin family protein, putative  33.57 
 
 		 464 aa  67.8  0.0000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000174972  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1248  hypothetical protein  34.13 
 
 		 542 aa  67.4  0.0000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0419522  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0310  hypothetical protein  31.55 
 
 		 439 aa  66.2  0.000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.0000000163597  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0563  hypothetical protein  25.52 
 
 		 510 aa  65.9  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000287642  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3403  hypothetical protein  42.11 
 
 		 460 aa  65.5  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0717001  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0557  hypothetical protein  35.45 
 
 		 452 aa  64.7  0.000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000338101  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0570  hypothetical protein  25.36 
 
 		 433 aa  63.9  0.000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.74433e-18 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1856  hypothetical protein  28.42 
 
 		 543 aa  63.5  0.000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2707  hypothetical protein  35.11 
 
 		 460 aa  63.2  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.205798  normal  0.461713 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2176  hypothetical protein  32.92 
 
 		 466 aa  63.2  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.000000312867  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3257  LamB porin family protein, putative  30.52 
 
 		 493 aa  60.5  0.00000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000051646  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2177  hypothetical protein  30.72 
 
 		 476 aa  58.5  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00360265  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2558  hypothetical protein  29.27 
 
 		 471 aa  53.9  0.000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2187  hypothetical protein  25.71 
 
 		 502 aa  51.2  0.00004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.080107  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2284  hypothetical protein  24.82 
 
 		 447 aa  48.5  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000344842 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0652  hypothetical protein  21.37 
 
 		 448 aa  46.2  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.758355  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2271  hypothetical protein  22.91 
 
 		 473 aa  45.8  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.62038e-17  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>