28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_1010 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_1010  hypothetical protein  100 
 
 		 447 aa  889    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.395908  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1011  hypothetical protein  74.29 
 
 		 448 aa  657    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000000669415  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2846  hypothetical protein  52.44 
 
 		 464 aa  466  9.999999999999999e-131  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2176  hypothetical protein  49.69 
 
 		 466 aa  438  1e-121  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.000000312867  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2177  hypothetical protein  46.75 
 
 		 476 aa  396  1e-109  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00360265  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2562  hypothetical protein  42.86 
 
 		 474 aa  369  1e-101  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00382555 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2558  hypothetical protein  44.76 
 
 		 471 aa  366  1e-100  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2707  hypothetical protein  42.74 
 
 		 460 aa  347  3e-94  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.205798  normal  0.461713 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0563  hypothetical protein  36.15 
 
 		 510 aa  279  6e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000287642  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0582  hypothetical protein  35.09 
 
 		 505 aa  265  8.999999999999999e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000609741  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1248  hypothetical protein  35.69 
 
 		 542 aa  250  3e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0419522  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1856  hypothetical protein  31.26 
 
 		 543 aa  246  4.9999999999999997e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2095  hypothetical protein  30.73 
 
 		 529 aa  238  2e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0310  hypothetical protein  36.6 
 
 		 439 aa  230  3e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.0000000163597  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1413  hypothetical protein  30.77 
 
 		 510 aa  205  1e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1883  hypothetical protein  33.94 
 
 		 476 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0565061  hitchhiker  0.00344442 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1745  hypothetical protein  35.12 
 
 		 534 aa  74.3  0.000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000216111  unclonable  0.0000185199 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3403  hypothetical protein  33.63 
 
 		 460 aa  61.2  0.00000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0717001  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3254  LamB porin family protein, putative  32.5 
 
 		 472 aa  58.5  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000126624  decreased coverage  1.37943e-21 
 
 
 
NC_002939  GSU3304  LamB porin family protein, putative  35.37 
 
 		 457 aa  57  0.0000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00991387  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0656  hypothetical protein  27.55 
 
 		 462 aa  56.6  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000988469  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0110  hypothetical protein  31.39 
 
 		 454 aa  56.2  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2284  hypothetical protein  29.86 
 
 		 447 aa  55.8  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000344842 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1309  hypothetical protein  29.75 
 
 		 381 aa  53.1  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0521  LamB porin family protein, putative  28.31 
 
 		 464 aa  48.5  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000174972  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0570  hypothetical protein  23.35 
 
 		 433 aa  48.1  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.74433e-18 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0557  hypothetical protein  31.65 
 
 		 452 aa  46.6  0.0008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000338101  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0011  hypothetical protein  33.33 
 
 		 435 aa  43.5  0.008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000177215  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>