28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU3304 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_3254  LamB porin family protein, putative  70.04 
 
 		 472 aa  634    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000126624  decreased coverage  1.37943e-21 
 
 
 
NC_002939  GSU3304  LamB porin family protein, putative  100 
 
 		 457 aa  924    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00991387  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0110  hypothetical protein  51.17 
 
 		 454 aa  416  9.999999999999999e-116  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3403  hypothetical protein  47.01 
 
 		 460 aa  378  1e-103  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0717001  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0656  hypothetical protein  44.81 
 
 		 462 aa  357  1.9999999999999998e-97  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000988469  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0521  LamB porin family protein, putative  39.48 
 
 		 464 aa  287  2.9999999999999996e-76  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000174972  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0557  hypothetical protein  42.17 
 
 		 452 aa  282  7.000000000000001e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000338101  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0570  hypothetical protein  38.94 
 
 		 433 aa  278  2e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.74433e-18 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3257  LamB porin family protein, putative  36.33 
 
 		 493 aa  269  8.999999999999999e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000051646  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1933  hypothetical protein  39.01 
 
 		 434 aa  248  1e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000351856  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2187  hypothetical protein  34.82 
 
 		 502 aa  241  2e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.080107  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2284  hypothetical protein  39.91 
 
 		 447 aa  239  6.999999999999999e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000344842 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1309  hypothetical protein  36.19 
 
 		 381 aa  202  8e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1745  hypothetical protein  27.04 
 
 		 534 aa  95.1  2e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000216111  unclonable  0.0000185199 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1011  hypothetical protein  22.75 
 
 		 448 aa  61.2  0.00000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000000669415  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2846  hypothetical protein  34.82 
 
 		 464 aa  60.5  0.00000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0310  hypothetical protein  28 
 
 		 439 aa  60.5  0.00000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.0000000163597  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2562  hypothetical protein  32.61 
 
 		 474 aa  60.1  0.00000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00382555 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0582  hypothetical protein  34.55 
 
 		 505 aa  59.7  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000609741  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1010  hypothetical protein  29.84 
 
 		 447 aa  59.7  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.395908  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0563  hypothetical protein  35.57 
 
 		 510 aa  57  0.0000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000287642  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1856  hypothetical protein  27.83 
 
 		 543 aa  56.2  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1310  hypothetical protein  44.93 
 
 		 376 aa  54.7  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1248  hypothetical protein  35.43 
 
 		 542 aa  54.7  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0419522  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2177  hypothetical protein  25.12 
 
 		 476 aa  52  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00360265  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2176  hypothetical protein  37.18 
 
 		 466 aa  51.6  0.00003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.000000312867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0011  hypothetical protein  31.52 
 
 		 435 aa  50.4  0.00006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000177215  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2095  hypothetical protein  29.45 
 
 		 529 aa  50.1  0.00009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>