24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1248 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_1248  hypothetical protein  100 
 
 		 542 aa  1101    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0419522  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0563  hypothetical protein  62.64 
 
 		 510 aa  640    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000287642  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0582  hypothetical protein  45.79 
 
 		 505 aa  405  1.0000000000000001e-112  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000609741  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2095  hypothetical protein  39.46 
 
 		 529 aa  343  2.9999999999999997e-93  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2846  hypothetical protein  40.75 
 
 		 464 aa  318  2e-85  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2176  hypothetical protein  40.38 
 
 		 466 aa  318  2e-85  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.000000312867  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1413  hypothetical protein  37.55 
 
 		 510 aa  313  2.9999999999999996e-84  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2177  hypothetical protein  38.1 
 
 		 476 aa  310  4e-83  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00360265  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2558  hypothetical protein  39.19 
 
 		 471 aa  289  7e-77  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2562  hypothetical protein  35.48 
 
 		 474 aa  286  7e-76  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00382555 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1856  hypothetical protein  36.8 
 
 		 543 aa  278  2e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2707  hypothetical protein  36.45 
 
 		 460 aa  257  4e-67  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.205798  normal  0.461713 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1010  hypothetical protein  35.69 
 
 		 447 aa  234  4.0000000000000004e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.395908  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1011  hypothetical protein  32.84 
 
 		 448 aa  229  1e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000000669415  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0310  hypothetical protein  30.78 
 
 		 439 aa  160  6e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.0000000163597  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1883  hypothetical protein  28.99 
 
 		 476 aa  125  2e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0565061  hitchhiker  0.00344442 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1745  hypothetical protein  34.13 
 
 		 534 aa  67.4  0.0000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000216111  unclonable  0.0000185199 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3304  LamB porin family protein, putative  43.59 
 
 		 457 aa  54.3  0.000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00991387  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3403  hypothetical protein  34.72 
 
 		 460 aa  52  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0717001  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0110  hypothetical protein  29.84 
 
 		 454 aa  50.4  0.00008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3254  LamB porin family protein, putative  40.79 
 
 		 472 aa  48.5  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000126624  decreased coverage  1.37943e-21 
 
 
 
NC_009483  Gura_1309  hypothetical protein  31.5 
 
 		 381 aa  46.6  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0656  hypothetical protein  27.75 
 
 		 462 aa  43.5  0.01  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000988469  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0570  hypothetical protein  32.06 
 
 		 433 aa  43.5  0.01  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.74433e-18 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>