21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_1309 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_1309  hypothetical protein  100 
 
 		 381 aa  774    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0110  hypothetical protein  37.4 
 
 		 454 aa  215  9e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3254  LamB porin family protein, putative  37.8 
 
 		 472 aa  213  4.9999999999999996e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000126624  decreased coverage  1.37943e-21 
 
 
 
NC_002939  GSU3403  hypothetical protein  38.92 
 
 		 460 aa  199  5e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0717001  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3304  LamB porin family protein, putative  37.83 
 
 		 457 aa  193  5e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00991387  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2187  hypothetical protein  35.01 
 
 		 502 aa  179  9e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.080107  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0521  LamB porin family protein, putative  34.48 
 
 		 464 aa  170  4e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000174972  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0656  hypothetical protein  30.91 
 
 		 462 aa  159  7e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000988469  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0570  hypothetical protein  32.54 
 
 		 433 aa  155  1e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.74433e-18 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0557  hypothetical protein  33.43 
 
 		 452 aa  149  8e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000338101  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2284  hypothetical protein  33.81 
 
 		 447 aa  138  2e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000344842 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1933  hypothetical protein  30.79 
 
 		 434 aa  126  7e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000351856  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3257  LamB porin family protein, putative  27.32 
 
 		 493 aa  106  7e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000051646  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1745  hypothetical protein  30.96 
 
 		 534 aa  72  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000216111  unclonable  0.0000185199 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1011  hypothetical protein  30.77 
 
 		 448 aa  54.7  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000000669415  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0582  hypothetical protein  33.59 
 
 		 505 aa  53.1  0.000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000609741  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1010  hypothetical protein  29.75 
 
 		 447 aa  53.1  0.000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.395908  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1856  hypothetical protein  30.53 
 
 		 543 aa  49.7  0.00008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2846  hypothetical protein  30.77 
 
 		 464 aa  48.1  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1248  hypothetical protein  31.5 
 
 		 542 aa  46.6  0.0007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0419522  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0310  hypothetical protein  24.74 
 
 		 439 aa  43.9  0.005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.0000000163597  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>