14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_3257 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_3257  LamB porin family protein, putative  100 
 
 		 493 aa  1001    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000051646  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0110  hypothetical protein  33.93 
 
 		 454 aa  248  2e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3304  LamB porin family protein, putative  35.48 
 
 		 457 aa  236  9e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00991387  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3254  LamB porin family protein, putative  35.52 
 
 		 472 aa  227  4e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000126624  decreased coverage  1.37943e-21 
 
 
 
NC_009483  Gura_0656  hypothetical protein  32.16 
 
 		 462 aa  214  2.9999999999999995e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000988469  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0521  LamB porin family protein, putative  33.59 
 
 		 464 aa  213  9e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000174972  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3403  hypothetical protein  30.75 
 
 		 460 aa  191  2e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0717001  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0570  hypothetical protein  30 
 
 		 433 aa  177  3e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.74433e-18 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2187  hypothetical protein  29.11 
 
 		 502 aa  168  2e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.080107  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1933  hypothetical protein  29.35 
 
 		 434 aa  155  2e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000351856  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0557  hypothetical protein  30.22 
 
 		 452 aa  150  6e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000338101  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2284  hypothetical protein  28.6 
 
 		 447 aa  144  3e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000344842 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1309  hypothetical protein  27.32 
 
 		 381 aa  106  1e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1745  hypothetical protein  30.52 
 
 		 534 aa  60.5  0.00000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000216111  unclonable  0.0000185199 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>