28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_3254 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_3254  LamB porin family protein, putative  100 
 
 		 472 aa  956    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000126624  decreased coverage  1.37943e-21 
 
 
 
NC_002939  GSU3304  LamB porin family protein, putative  70.04 
 
 		 457 aa  614  9.999999999999999e-175  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00991387  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0110  hypothetical protein  49.79 
 
 		 454 aa  414  1e-114  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3403  hypothetical protein  49.28 
 
 		 460 aa  393  1e-108  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0717001  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0656  hypothetical protein  44.79 
 
 		 462 aa  358  9.999999999999999e-98  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000988469  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0521  LamB porin family protein, putative  38.3 
 
 		 464 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000174972  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0557  hypothetical protein  40.62 
 
 		 452 aa  264  3e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000338101  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0570  hypothetical protein  36.4 
 
 		 433 aa  259  5.0000000000000005e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.74433e-18 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2284  hypothetical protein  38.96 
 
 		 447 aa  251  2e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000344842 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1933  hypothetical protein  38.51 
 
 		 434 aa  248  1e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000351856  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2187  hypothetical protein  35.34 
 
 		 502 aa  247  4e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.080107  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3257  LamB porin family protein, putative  35.52 
 
 		 493 aa  242  9e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000051646  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1309  hypothetical protein  38.56 
 
 		 381 aa  216  9.999999999999999e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1745  hypothetical protein  37.78 
 
 		 534 aa  96.3  1e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000216111  unclonable  0.0000185199 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0310  hypothetical protein  29.11 
 
 		 439 aa  62  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.0000000163597  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0582  hypothetical protein  32.6 
 
 		 505 aa  62.4  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000609741  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1010  hypothetical protein  28.04 
 
 		 447 aa  60.1  0.00000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.395908  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1011  hypothetical protein  35.44 
 
 		 448 aa  58.2  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000000669415  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2562  hypothetical protein  30.99 
 
 		 474 aa  57.8  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00382555 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1856  hypothetical protein  28.57 
 
 		 543 aa  56.6  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1310  hypothetical protein  45.59 
 
 		 376 aa  54.7  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2846  hypothetical protein  34.23 
 
 		 464 aa  52.8  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1248  hypothetical protein  40.79 
 
 		 542 aa  48.5  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0419522  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0563  hypothetical protein  30.67 
 
 		 510 aa  47.8  0.0005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000287642  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0011  hypothetical protein  30.69 
 
 		 435 aa  45.1  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000177215  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2177  hypothetical protein  34.21 
 
 		 476 aa  45.8  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00360265  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2095  hypothetical protein  36.49 
 
 		 529 aa  45.4  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2176  hypothetical protein  32.89 
 
 		 466 aa  43.9  0.006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.000000312867  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>