24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_1933 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_1933  hypothetical protein  100 
 
 		 434 aa  877    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000351856  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2284  hypothetical protein  77.06 
 
 		 447 aa  644    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000344842 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3403  hypothetical protein  44.25 
 
 		 460 aa  322  7e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0717001  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0110  hypothetical protein  40.56 
 
 		 454 aa  303  3.0000000000000004e-81  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0656  hypothetical protein  39.59 
 
 		 462 aa  280  5e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000988469  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3254  LamB porin family protein, putative  39.41 
 
 		 472 aa  275  8e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000126624  decreased coverage  1.37943e-21 
 
 
 
NC_002939  GSU3304  LamB porin family protein, putative  40.13 
 
 		 457 aa  257  2e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00991387  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2187  hypothetical protein  32.8 
 
 		 502 aa  215  1.9999999999999998e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.080107  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0570  hypothetical protein  34.91 
 
 		 433 aa  208  1e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.74433e-18 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0521  LamB porin family protein, putative  33.26 
 
 		 464 aa  203  5e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000174972  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0557  hypothetical protein  35.87 
 
 		 452 aa  196  6e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000338101  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3257  LamB porin family protein, putative  30.39 
 
 		 493 aa  181  2e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000051646  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1309  hypothetical protein  31.64 
 
 		 381 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1010  hypothetical protein  30.41 
 
 		 447 aa  63.5  0.000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.395908  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1011  hypothetical protein  29.49 
 
 		 448 aa  60.8  0.00000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000000669415  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2846  hypothetical protein  25.86 
 
 		 464 aa  54.3  0.000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0582  hypothetical protein  30.86 
 
 		 505 aa  54.3  0.000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000609741  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1745  hypothetical protein  32.12 
 
 		 534 aa  53.1  0.000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000216111  unclonable  0.0000185199 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1856  hypothetical protein  28.25 
 
 		 543 aa  52.8  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0310  hypothetical protein  28.42 
 
 		 439 aa  50.8  0.00004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.0000000163597  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0011  hypothetical protein  35.96 
 
 		 435 aa  51.2  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000177215  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2562  hypothetical protein  30.33 
 
 		 474 aa  48.1  0.0003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00382555 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0563  hypothetical protein  26.78 
 
 		 510 aa  45.4  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000287642  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1248  hypothetical protein  24.35 
 
 		 542 aa  44.3  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0419522  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>