24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0582 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_0582  hypothetical protein  100 
 
 
505 aa  1025    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000609741  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0563  hypothetical protein  49.91 
 
 
510 aa  459  9.999999999999999e-129  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000287642  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2095  hypothetical protein  43.68 
 
 
529 aa  416  9.999999999999999e-116  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1248  hypothetical protein  46.22 
 
 
542 aa  414  1e-114  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0419522  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2176  hypothetical protein  45.15 
 
 
466 aa  364  2e-99  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.000000312867  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2177  hypothetical protein  41.33 
 
 
476 aa  346  6e-94  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00360265  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2846  hypothetical protein  40.39 
 
 
464 aa  337  1.9999999999999998e-91  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1856  hypothetical protein  39.15 
 
 
543 aa  330  5.0000000000000004e-89  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2562  hypothetical protein  38.79 
 
 
474 aa  315  9.999999999999999e-85  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00382555 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2558  hypothetical protein  40.57 
 
 
471 aa  313  6.999999999999999e-84  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1413  hypothetical protein  36.85 
 
 
510 aa  303  5.000000000000001e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2707  hypothetical protein  36.77 
 
 
460 aa  280  4e-74  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.205798  normal  0.461713 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1011  hypothetical protein  36.28 
 
 
448 aa  272  1e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000000669415  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1010  hypothetical protein  35.34 
 
 
447 aa  256  6e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.395908  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1883  hypothetical protein  30.75 
 
 
476 aa  157  4e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0565061  hitchhiker  0.00344442 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0310  hypothetical protein  28.31 
 
 
439 aa  152  2e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.0000000163597  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1745  hypothetical protein  32.29 
 
 
534 aa  76.6  0.000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000216111  unclonable  0.0000185199 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3254  LamB porin family protein, putative  35.92 
 
 
472 aa  57.8  0.0000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000126624  decreased coverage  1.37943e-21 
 
 
 
NC_002939  GSU3304  LamB porin family protein, putative  44.87 
 
 
457 aa  56.2  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00991387  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0110  hypothetical protein  31.11 
 
 
454 aa  53.5  0.000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1309  hypothetical protein  33.59 
 
 
381 aa  53.5  0.000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2284  hypothetical protein  33.63 
 
 
447 aa  51.6  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000344842 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3403  hypothetical protein  37.5 
 
 
460 aa  50.1  0.00009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0717001  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0570  hypothetical protein  30.38 
 
 
433 aa  45.4  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.74433e-18 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>