24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_2095 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_2095  hypothetical protein  100 
 
 
529 aa  1084    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0582  hypothetical protein  43.12 
 
 
505 aa  400  9.999999999999999e-111  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000609741  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0563  hypothetical protein  39.71 
 
 
510 aa  351  2e-95  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000287642  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1248  hypothetical protein  39.46 
 
 
542 aa  343  2.9999999999999997e-93  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0419522  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2846  hypothetical protein  36.09 
 
 
464 aa  319  7.999999999999999e-86  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2176  hypothetical protein  36.48 
 
 
466 aa  309  1.0000000000000001e-82  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.000000312867  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2558  hypothetical protein  36.09 
 
 
471 aa  278  2e-73  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2177  hypothetical protein  34.09 
 
 
476 aa  276  6e-73  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00360265  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1856  hypothetical protein  32.2 
 
 
543 aa  268  2e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1413  hypothetical protein  34.53 
 
 
510 aa  262  1e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2707  hypothetical protein  32.76 
 
 
460 aa  258  2e-67  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.205798  normal  0.461713 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2562  hypothetical protein  31.73 
 
 
474 aa  255  1.0000000000000001e-66  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00382555 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1010  hypothetical protein  30.73 
 
 
447 aa  223  6e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.395908  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1011  hypothetical protein  30.5 
 
 
448 aa  220  5e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000000669415  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0310  hypothetical protein  23.96 
 
 
439 aa  116  1.0000000000000001e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.0000000163597  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1883  hypothetical protein  26.48 
 
 
476 aa  114  6e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0565061  hitchhiker  0.00344442 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1745  hypothetical protein  32.96 
 
 
534 aa  69.3  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000216111  unclonable  0.0000185199 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0570  hypothetical protein  27.84 
 
 
433 aa  52.4  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.74433e-18 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3403  hypothetical protein  33.33 
 
 
460 aa  51.6  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0717001  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0110  hypothetical protein  28.67 
 
 
454 aa  49.3  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0521  LamB porin family protein, putative  26.02 
 
 
464 aa  48.5  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000174972  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3304  LamB porin family protein, putative  38.67 
 
 
457 aa  47.4  0.0007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00991387  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3254  LamB porin family protein, putative  36.49 
 
 
472 aa  45.4  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000126624  decreased coverage  1.37943e-21 
 
 
 
NC_011146  Gbem_0557  hypothetical protein  28.8 
 
 
452 aa  43.9  0.007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000338101  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>