20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_2176 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008751  Dvul_2176  hypothetical protein  100 
 
 
466 aa  942    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.000000312867  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2846  hypothetical protein  66.67 
 
 
464 aa  619  1e-176  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2177  hypothetical protein  60.17 
 
 
476 aa  557  1e-157  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00360265  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2558  hypothetical protein  53.25 
 
 
471 aa  478  1e-133  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2562  hypothetical protein  51.66 
 
 
474 aa  461  9.999999999999999e-129  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00382555 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2707  hypothetical protein  51.29 
 
 
460 aa  444  1e-123  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.205798  normal  0.461713 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1011  hypothetical protein  49.07 
 
 
448 aa  432  1e-120  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000000669415  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1010  hypothetical protein  49.69 
 
 
447 aa  422  1e-117  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.395908  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0582  hypothetical protein  44.93 
 
 
505 aa  361  2e-98  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000609741  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0563  hypothetical protein  43.99 
 
 
510 aa  341  2e-92  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000287642  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1248  hypothetical protein  40.38 
 
 
542 aa  318  2e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0419522  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1856  hypothetical protein  36.1 
 
 
543 aa  312  6.999999999999999e-84  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2095  hypothetical protein  36.48 
 
 
529 aa  309  9e-83  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1413  hypothetical protein  37.89 
 
 
510 aa  277  2e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0310  hypothetical protein  34.76 
 
 
439 aa  224  2e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.0000000163597  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1883  hypothetical protein  32.15 
 
 
476 aa  183  7e-45  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0565061  hitchhiker  0.00344442 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1745  hypothetical protein  32.92 
 
 
534 aa  63.2  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000216111  unclonable  0.0000185199 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3304  LamB porin family protein, putative  37.18 
 
 
457 aa  51.2  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00991387  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3403  hypothetical protein  31.25 
 
 
460 aa  46.2  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0717001  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3254  LamB porin family protein, putative  32.89 
 
 
472 aa  43.9  0.007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000126624  decreased coverage  1.37943e-21 
 
 
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>