30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GBAA_3053 on replicon NC_007530
Organism: Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003909  BCE_3084  ABC transporter, permease protein  88.57 
 
 
420 aa  723    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.589781  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2838  ABC transporter permease  100 
 
 
420 aa  845    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0117028  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2812  ABC transporter, permease  98.57 
 
 
420 aa  831    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.02347  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3065  ABC transporter, permease protein  97.86 
 
 
420 aa  796    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2772  ABC transporter, permease  97.38 
 
 
420 aa  791    Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00717003  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3053  ABC transporter permease  100 
 
 
420 aa  845    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3082  ABC transporter, permease protein  88.81 
 
 
421 aa  725    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.40777  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2198  ABC transporter, permease protein  64.61 
 
 
421 aa  512  1e-144  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000781138 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0656  ABC transporter permease  22.69 
 
 
413 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000134974  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0903  ABC transporter, permease  22.81 
 
 
408 aa  73.2  0.000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3803  protein of unknown function DUF214  22.43 
 
 
421 aa  68.2  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4857  protein of unknown function DUF214  22.27 
 
 
793 aa  49.3  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.586648  normal  0.220658 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2813  ABC transporter, permease  24.76 
 
 
361 aa  48.5  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00714729  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3054  ABC transporter permease  24.9 
 
 
361 aa  48.1  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3066  ABC transporter, permease protein  24.9 
 
 
361 aa  48.1  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2839  ABC transporter permease  24.9 
 
 
250 aa  48.1  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0621252  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1780  protein of unknown function DUF214  20.73 
 
 
413 aa  47.8  0.0003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0742  protein of unknown function DUF214  25.19 
 
 
387 aa  47.8  0.0004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0302807  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2773  ABC transporter, permease  24.9 
 
 
361 aa  47.4  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00446458  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1980  permease domain-containing protein  20 
 
 
413 aa  47.4  0.0005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1180  hypothetical protein  24.38 
 
 
412 aa  45.8  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2047  ABC efflux pump, inner membrane subunit  18.7 
 
 
882 aa  43.9  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2757  ABC efflux pump, inner membrane subunit  28 
 
 
413 aa  44.3  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0798  hypothetical protein  35.62 
 
 
470 aa  44.3  0.005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0616  ABC efflux pump, inner membrane subunit  20.08 
 
 
862 aa  44.3  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4610  protein of unknown function DUF214  26.11 
 
 
798 aa  43.5  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.22275 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5041  putative ABC transporter, permease protein  28.1 
 
 
441 aa  43.1  0.009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0469  protein of unknown function DUF214  21.94 
 
 
405 aa  43.1  0.01  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0636  ABC transporter related  38.57 
 
 
648 aa  43.1  0.01  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0608  ABC transporter related  38.57 
 
 
648 aa  43.1  0.01  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>