20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCE_3084 on replicon NC_003909
Organism: Bacillus cereus ATCC 10987



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_005945  BAS2838  ABC transporter permease  88.57 
 
 
420 aa  724    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0117028  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2812  ABC transporter, permease  87.86 
 
 
420 aa  717    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.02347  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2772  ABC transporter, permease  88.33 
 
 
420 aa  727    Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00717003  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3053  ABC transporter permease  88.57 
 
 
420 aa  724    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3084  ABC transporter, permease protein  100 
 
 
420 aa  847    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.589781  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3065  ABC transporter, permease protein  88.81 
 
 
420 aa  731    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3082  ABC transporter, permease protein  86.9 
 
 
421 aa  711    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.40777  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2198  ABC transporter, permease protein  65.8 
 
 
421 aa  525  1e-148  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000781138 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3803  protein of unknown function DUF214  22.47 
 
 
421 aa  73.6  0.000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0656  ABC transporter permease  21.91 
 
 
413 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000134974  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0903  ABC transporter, permease  20.62 
 
 
408 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1180  hypothetical protein  22.22 
 
 
412 aa  51.6  0.00003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1980  permease domain-containing protein  24.81 
 
 
413 aa  49.7  0.00009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1780  protein of unknown function DUF214  21.38 
 
 
413 aa  48.5  0.0002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0770  ABC transporter related  22.73 
 
 
656 aa  46.6  0.0009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.920342  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1627  ABC transporter-related protein  22.7 
 
 
658 aa  44.7  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0297  ABC efflux pump, inner membrane subunit  24.79 
 
 
813 aa  43.5  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.655759 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0469  protein of unknown function DUF214  20.39 
 
 
405 aa  43.1  0.009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0798  hypothetical protein  35.62 
 
 
470 aa  43.1  0.01  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2757  ABC efflux pump, inner membrane subunit  27.2 
 
 
413 aa  43.1  0.01  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>