16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_1980 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008262  CPR_1980  permease domain-containing protein  100 
 
 		 413 aa  815    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3803  protein of unknown function DUF214  24.32 
 
 		 421 aa  65.5  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0656  ABC transporter permease  25 
 
 		 413 aa  62  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000134974  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2198  ABC transporter, permease protein  19.95 
 
 		 421 aa  59.7  0.00000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000781138 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0903  ABC transporter, permease  25.96 
 
 		 408 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1600  permease  24.36 
 
 		 427 aa  58.9  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000167071  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0383  hypothetical protein  25.74 
 
 		 198 aa  53.5  0.000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5547  hypothetical protein  24.87 
 
 		 427 aa  50.8  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.860725  decreased coverage  0.00000137024 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2812  ABC transporter, permease  21.98 
 
 		 420 aa  50.1  0.00007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.02347  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3084  ABC transporter, permease protein  24.81 
 
 		 420 aa  49.7  0.00009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.589781  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2838  ABC transporter permease  20.81 
 
 		 420 aa  47.8  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0117028  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3053  ABC transporter permease  20.81 
 
 		 420 aa  47.8  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3082  ABC transporter, permease protein  22.05 
 
 		 421 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.40777  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3065  ABC transporter, permease protein  22.44 
 
 		 420 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2772  ABC transporter, permease  22.83 
 
 		 420 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00717003  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4776  hypothetical protein  23.5 
 
 		 857 aa  43.1  0.01  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>