36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6539 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_6539  Excalibur domain-containing protein  100 
 
 
211 aa  395  1e-109  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.199317 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2154  excalibur domain family  63.41 
 
 
287 aa  63.2  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0576  Excalibur domain protein  64.58 
 
 
212 aa  63.2  0.000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.00000012089  unclonable  0.00000255125 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1973  hypothetical protein  63.41 
 
 
303 aa  63.2  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000663025  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2180  hypothetical protein  63.41 
 
 
318 aa  62.8  0.000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2149  hypothetical protein  65 
 
 
333 aa  62.8  0.000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2000  hypothetical protein  65 
 
 
333 aa  62.8  0.000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2215  hypothetical protein  65 
 
 
332 aa  62.4  0.000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2296  hypothetical protein  65 
 
 
331 aa  62  0.000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.396677  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1952  hypothetical protein  58.14 
 
 
287 aa  61.6  0.000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.571007  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0504  Excalibur  59.09 
 
 
138 aa  58.2  0.00000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0059  LGFP repeat protein  75 
 
 
351 aa  57.4  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.183151  normal  0.560607 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1992  Excalibur domain-containing protein  51.22 
 
 
334 aa  57.4  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00268093  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3160  hypothetical protein  46.27 
 
 
330 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0554413 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0136  Excalibur domain protein  43.04 
 
 
382 aa  56.2  0.0000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4287  Domain of unknown function DUF1994  52.63 
 
 
303 aa  55.8  0.0000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.671447  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3931  Excalibur domain protein  57.89 
 
 
77 aa  52.8  0.000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0594  Excalibur domain-containing protein  63.83 
 
 
211 aa  49.7  0.00003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.535797  normal  0.187659 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0301  Excalibur domain protein  71.79 
 
 
154 aa  49.3  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02630  protein of unknown function (DUF1994)  56.76 
 
 
389 aa  48.9  0.00006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.91242  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0134  Excalibur  65.85 
 
 
220 aa  48.9  0.00006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.194412  normal  0.895355 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3801  Excalibur domain protein  53.33 
 
 
219 aa  48.5  0.00007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.533693  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2296  NLP/P60 protein  58.33 
 
 
625 aa  48.1  0.00009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000910624  hitchhiker  0.00399846 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1214  putative CheA signal transduction histidine kinase  56.41 
 
 
349 aa  47.8  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2387  Excalibur domain protein  33.98 
 
 
233 aa  48.1  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000276627  hitchhiker  0.000344764 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4550  S-layer protein  35.06 
 
 
276 aa  46.2  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4693  S-layer protein  38.96 
 
 
268 aa  44.3  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5054  S-layer protein  38.96 
 
 
268 aa  44.3  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4952  S-layer protein, putative  35.06 
 
 
272 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0302  Excalibur domain protein  62.5 
 
 
319 aa  43.5  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4918  putative S-layer protein  35.06 
 
 
272 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4937  putative S-layer protein  35.06 
 
 
272 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0809  hypothetical protein  31.58 
 
 
916 aa  43.1  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.455366  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0952  Excalibur domain-containing protein  62.5 
 
 
232 aa  43.1  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0808637  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5183  Excalibur domain protein  68.42 
 
 
156 aa  42  0.007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0844  Excalibur domain protein  60.98 
 
 
115 aa  41.6  0.01  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>