More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4051 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_1252  crotonyl-CoA reductase  78.4 
 
 		 455 aa  742    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3612  crotonyl-CoA reductase  78.22 
 
 		 468 aa  729    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.66002 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4114  crotonyl-CoA reductase  80.18 
 
 		 443 aa  761    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.136176  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3014  crotonyl-CoA reductase  85.97 
 
 		 451 aa  817    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4138  crotonyl-CoA reductase  76.12 
 
 		 443 aa  707    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.723867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1041  crotonyl-CoA reductase  95.1 
 
 		 449 aa  880    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.135498  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0999  crotonyl-CoA reductase  81.66 
 
 		 445 aa  774    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3690  crotonyl-CoA reductase  84.63 
 
 		 449 aa  808    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.789983  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4051  crotonyl-CoA reductase  100 
 
 		 449 aa  921    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.571827  normal  0.173638 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1795  crotonyl-CoA reductase  77.38 
 
 		 450 aa  738    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.692745  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3994  crotonyl-CoA reductase  78 
 
 		 451 aa  730    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00096835 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3474  crotonyl-CoA reductase  67.33 
 
 		 441 aa  624  1e-177  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.195644  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0105  crotonyl-CoA reductase  60.14 
 
 		 464 aa  538  9.999999999999999e-153  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8814  crotonyl-CoA reductase  58 
 
 		 436 aa  481  1e-134  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.710207  normal  0.156585 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4755  crotonyl-CoA reductase  53.42 
 
 		 436 aa  449  1e-125  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1018  crotonyl-CoA reductase  53.98 
 
 		 460 aa  417  9.999999999999999e-116  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0121802  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3664  crotonyl-CoA reductase  53.62 
 
 		 451 aa  375  1e-103  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1332  crotonyl-CoA reductase  46.8 
 
 		 441 aa  362  6e-99  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.382584  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4182  crotonyl-CoA reductase  42.64 
 
 		 418 aa  290  5.0000000000000004e-77  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.90036 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6221  crotonyl-CoA reductase  41.56 
 
 		 425 aa  286  4e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.271241  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0960  alcohol dehydrogenase  40.56 
 
 		 430 aa  284  3.0000000000000004e-75  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1067  crotonyl-CoA reductase  41.67 
 
 		 424 aa  283  3.0000000000000004e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.72991  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2620  crotonyl-CoA reductase  40.31 
 
 		 430 aa  283  4.0000000000000003e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1621  crotonyl-CoA reductase  40.05 
 
 		 421 aa  280  3e-74  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000162503  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3873  crotonyl-CoA reductase  41.07 
 
 		 429 aa  280  3e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.940122 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1195  crotonyl-CoA reductase  39.9 
 
 		 427 aa  280  4e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.191625  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3009  crotonyl-CoA reductase  39.54 
 
 		 430 aa  276  4e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.503286 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3104  crotonyl-CoA reductase  39.54 
 
 		 426 aa  276  6e-73  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.44731  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0793  crotonyl-CoA reductase  40.05 
 
 		 435 aa  272  9e-72  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1105  crotonyl-CoA reductase  39.64 
 
 		 428 aa  270  4e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0037  crotonyl-CoA reductase  39.8 
 
 		 431 aa  269  7e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00205217 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2853  alcohol dehydrogenase  39.54 
 
 		 430 aa  268  1e-70  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0039  crotonyl-CoA reductase  38.79 
 
 		 431 aa  267  2e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.392309  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3063  crotonyl-CoA reductase  38.44 
 
 		 427 aa  266  4e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0288  crotonyl-CoA reductase  38.82 
 
 		 432 aa  265  1e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.901794 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0332  crotonyl-CoA reductase  38.57 
 
 		 432 aa  264  3e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.214387 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0364  crotonyl-CoA reductase  38.57 
 
 		 432 aa  261  1e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.583341  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4689  crotonyl-CoA reductase  34.83 
 
 		 401 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0488  crotonyl-CoA reductase  36.55 
 
 		 414 aa  215  9.999999999999999e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.999387  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5660  crotonyl-CoA reductase  41.67 
 
 		 392 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5822  alcohol dehydrogenase  30.83 
 
 		 338 aa  145  1e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.274342  hitchhiker  0.00763949 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3027  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.8 
 
 		 342 aa  136  6.0000000000000005e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2932  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.53 
 
 		 342 aa  136  9e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2843  zinc-binding alcohol dehydrogenase  32.26 
 
 		 342 aa  134  3.9999999999999996e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.991277  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2357  putative zinc-containing alcohol dehydrogenase  29.95 
 
 		 337 aa  133  6e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.400276 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1815  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.16 
 
 		 350 aa  132  1.0000000000000001e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.37101  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1250  zinc-binding alcohol dehydrogenase  30.21 
 
 		 339 aa  130  5.0000000000000004e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2871  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.59 
 
 		 342 aa  129  1.0000000000000001e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.872591 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0765  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.56 
 
 		 341 aa  128  3e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2974  zinc-binding alcohol dehydrogenase  30.58 
 
 		 337 aa  127  3e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.133874  normal  0.173766 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3084  alcohol dehydrogenase  29.15 
 
 		 337 aa  127  4.0000000000000003e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1148  alcohol dehydrogenase  30.25 
 
 		 339 aa  125  1e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.712603 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2774  alcohol dehydrogenase  30.65 
 
 		 342 aa  123  6e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2412  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  30.98 
 
 		 341 aa  117  5e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2722  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  30.03 
 
 		 346 aa  117  5e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2779  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  30.86 
 
 		 342 aa  117  5e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.322077  normal  0.949472 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1565  alcohol dehydrogenase  26.77 
 
 		 361 aa  112  2.0000000000000002e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1113  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  26.43 
 
 		 341 aa  110  4.0000000000000004e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2645  zinc-binding alcohol dehydrogenase  26.76 
 
 		 339 aa  109  8.000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.165067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2398  zinc-binding alcohol dehydrogenase  30.21 
 
 		 335 aa  109  9.000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.860037  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0338  alcohol dehydrogenase  31.66 
 
 		 344 aa  108  3e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0222833  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2062  zinc-binding alcohol dehydrogenase  29.04 
 
 		 341 aa  107  5e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.236604  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1622  alcohol dehydrogenase  25.54 
 
 		 358 aa  107  5e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3087  quinone oxidoreductase (NADPH:quinone reductase)  31.72 
 
 		 331 aa  105  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2743  alcohol dehydrogenase  30.09 
 
 		 347 aa  104  3e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000100489 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3186  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  28.65 
 
 		 335 aa  103  6e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3438  alcohol dehydrogenase  28.65 
 
 		 335 aa  103  6e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3168  quinone oxidoreductase (NADPH:quinone reductase)  31.38 
 
 		 331 aa  103  7e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00212321  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2036  NADPH:quinone reductase  27.65 
 
 		 342 aa  103  8e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.2481  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3686  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  26.5 
 
 		 359 aa  102  9e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0985962 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0692  zinc-binding alcohol dehydrogenase  29.75 
 
 		 320 aa  102  1e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0913  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  27.35 
 
 		 326 aa  101  2e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0537467  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0936  zinc-binding alcohol dehydrogenase  27.89 
 
 		 327 aa  102  2e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1737  alcohol dehydrogenase  28.74 
 
 		 342 aa  101  3e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.297845 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3419  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  28.34 
 
 		 331 aa  101  3e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.816241  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3406  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  31.03 
 
 		 331 aa  101  3e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0290  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  27.56 
 
 		 329 aa  100  4e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2229  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  27.17 
 
 		 340 aa  100  4e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5428  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.82 
 
 		 330 aa  100  5e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2355  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  28.15 
 
 		 342 aa  100  5e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.354268  normal  0.0256633 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2797  zinc-binding alcohol dehydrogenase  30 
 
 		 317 aa  100  6e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0771012  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3391  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  31.03 
 
 		 331 aa  100  6e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.116422  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0102  zinc-binding alcohol dehydrogenase  28.8 
 
 		 333 aa  100  7e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.703358  normal  0.907682 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1258  alcohol dehydrogenase  27.92 
 
 		 340 aa  99  1e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.184329 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2113  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  27.86 
 
 		 342 aa  98.6  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.035771  normal  0.03403 
 
 
-
 
NC_004310  BR0852  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  28.12 
 
 		 342 aa  98.2  3e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3357  alcohol dehydrogenase  27.27 
 
 		 340 aa  97.8  3e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0469865 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0304  zinc-binding alcohol dehydrogenase  28 
 
 		 333 aa  97.8  3e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.337818  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2374  alcohol dehydrogenase  28.28 
 
 		 360 aa  97.8  3e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12740  Zn-dependent oxidoreductase, NADPH:quinone reductase  27.6 
 
 		 321 aa  97.8  4e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2107  zinc-binding alcohol dehydrogenase  27.79 
 
 		 340 aa  97.1  5e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.622443 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0112  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  27.54 
 
 		 334 aa  97.4  5e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.985575  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2228  putative quinone oxidoreductase  28.53 
 
 		 322 aa  96.3  9e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.806393  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0844  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  27.84 
 
 		 342 aa  96.3  9e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1565  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  27.96 
 
 		 320 aa  96.3  1e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0793677  normal  0.20128 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2124  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.21 
 
 		 328 aa  95.9  1e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.386337  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1030  zinc-binding alcohol dehydrogenase  27.37 
 
 		 339 aa  95.5  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0180  alcohol dehydrogenase  27.42 
 
 		 325 aa  95.5  2e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6082  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  27.53 
 
 		 333 aa  94.4  3e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1694  zinc-binding alcohol dehydrogenase  28.38 
 
 		 325 aa  94.7  3e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0377622  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>