159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3015 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_3015  transposase  100 
 
 
317 aa  649    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.837317  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2739  transposase  70 
 
 
462 aa  320  1.9999999999999998e-86  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.515856  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2877  transposase  70 
 
 
462 aa  320  1.9999999999999998e-86  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.156235  normal  0.359702 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4606  transposase  70 
 
 
462 aa  320  1.9999999999999998e-86  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7107  transposase  70 
 
 
462 aa  320  1.9999999999999998e-86  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0311  putative IS4 family transposase  47.89 
 
 
445 aa  199  7e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1650  transposase IS4 family protein  51.87 
 
 
432 aa  196  4.0000000000000005e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.156297  normal  0.0326148 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2904  transposase  48.79 
 
 
389 aa  186  5e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3272  transposase IS4 family protein  48.79 
 
 
390 aa  185  1.0000000000000001e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2600  transposase  42.34 
 
 
399 aa  183  3e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0535521  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3530  transposase  42.34 
 
 
399 aa  183  3e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.407698  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6861  transposase  45.28 
 
 
402 aa  181  1e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4421  putative IS4 family transposase  46.86 
 
 
427 aa  181  2e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0265932 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1302  IS4 family transposase  43.89 
 
 
396 aa  176  4e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.24004  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36140  FOG transposase  43.48 
 
 
401 aa  175  9.999999999999999e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2323  transposase IS701  45.12 
 
 
416 aa  171  2e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.564706  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1727  transposase IS701  45.12 
 
 
416 aa  171  2e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2731  transposase IS701  45.12 
 
 
416 aa  171  2e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.73421  normal  0.105734 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0467  transposase IS701  45.12 
 
 
416 aa  171  2e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.529272  normal  0.0154733 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1738  transposase IS701  45.12 
 
 
416 aa  171  2e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4487  transposase IS4 family protein  39.35 
 
 
403 aa  160  4e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5626  transposase  41.23 
 
 
417 aa  158  1e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.35278 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4639  transposase IS4 family protein  41.96 
 
 
394 aa  157  3e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3143  transposase IS4 family protein  41.96 
 
 
418 aa  156  4e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1937  hypothetical protein  61.02 
 
 
165 aa  145  8.000000000000001e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.107266  normal  0.0858288 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6714  transposase  49.3 
 
 
225 aa  135  9.999999999999999e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2296  transposase  36.67 
 
 
396 aa  102  1e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00584103  normal  0.663647 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2511  transposase  36.67 
 
 
396 aa  102  1e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0160995  normal  0.39101 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0691  putative transposase, ISRS017  32.74 
 
 
431 aa  100  4e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.900264 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6787  transposase IS4 family protein  30.95 
 
 
430 aa  97.1  4e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.205931 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0126  ISRSO17-transposase protein  36.84 
 
 
443 aa  92  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00370218  normal  0.579487 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0156  ISRSO17-transposase protein  36.84 
 
 
445 aa  92  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0179045  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0475  ISRSO17-transposase protein  36.84 
 
 
443 aa  92  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1135  ISRSO17-transposase protein  36.84 
 
 
453 aa  91.7  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.408398  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1301  ISRSO17-transposase protein  36.84 
 
 
453 aa  91.7  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1331  ISRSO17-transposase protein  36.84 
 
 
453 aa  91.7  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1362  ISRSO17-transposase protein  36.84 
 
 
453 aa  91.7  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.717233  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4960  transposase IS4 family protein  29.09 
 
 
439 aa  91.7  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.651536  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0574  transposase, IS4 family protein  29.24 
 
 
463 aa  90.1  4e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.75513  normal  0.0558864 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4018  transposase  29.47 
 
 
439 aa  87.8  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03028  ISXo8 transposase  31.95 
 
 
460 aa  86.7  5e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00082  ISXo8 transposase  36.84 
 
 
544 aa  85.9  9e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.362769  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05514  ISXo8 transposase  36.84 
 
 
460 aa  84.7  0.000000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.39447  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16660  ISRSO17-transposase protein  31.21 
 
 
453 aa  84.7  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04166  ISXo8 transposase  36.84 
 
 
460 aa  84.7  0.000000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.954673  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32030  ISRSO17-transposase protein  31.21 
 
 
453 aa  84.7  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02651  ISXo8 transposase  36.84 
 
 
460 aa  84.7  0.000000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.684072  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03162  ISXo8 transposase  36.84 
 
 
460 aa  84.7  0.000000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.25382  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04035  ISXo8 transposase  36.09 
 
 
460 aa  84  0.000000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05704  ISXo8 transposase  36.09 
 
 
426 aa  84  0.000000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06256  ISXo8 transposase  36.09 
 
 
405 aa  84  0.000000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00708165  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01499  ISXo8 transposase  36.09 
 
 
313 aa  84  0.000000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.709991  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05635  ISXo8 transposase  36.09 
 
 
405 aa  84  0.000000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.286916  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01612  ISXo8 transposase  36.09 
 
 
460 aa  84  0.000000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03013  ISXo8 transposase  36.09 
 
 
382 aa  84  0.000000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03193  ISXo8 transposase  36.09 
 
 
412 aa  84  0.000000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03415  ISXo8 transposase  36.09 
 
 
403 aa  84  0.000000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.487953  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05580  ISXo8 transposase  36.09 
 
 
460 aa  83.6  0.000000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00568142  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04708  ISXo8 transposase  36.09 
 
 
460 aa  83.6  0.000000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05629  ISXo8 transposase  36.09 
 
 
460 aa  83.6  0.000000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.166088  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05624  ISXo8 transposase  36.09 
 
 
747 aa  83.6  0.000000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0050002  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04704  ISXo8 transposase  36.09 
 
 
460 aa  83.6  0.000000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.669194  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04675  ISXo8 transposase  36.09 
 
 
467 aa  83.6  0.000000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04596  ISXo8 transposase  36.09 
 
 
375 aa  83.6  0.000000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04096  ISXo8 transposase  36.09 
 
 
501 aa  83.6  0.000000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04331  ISXo8 transposase  36.09 
 
 
469 aa  83.6  0.000000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00000435503  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05690  ISXo8 transposase  36.09 
 
 
460 aa  83.6  0.000000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05780  ISXo8 transposase  36.09 
 
 
462 aa  83.6  0.000000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05751  ISXo8 transposase  36.09 
 
 
467 aa  83.6  0.000000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06087  ISXo8 transposase  36.09 
 
 
747 aa  83.6  0.000000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06240  ISXo8 transposase  36.09 
 
 
460 aa  83.6  0.000000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06217  ISXo8 transposase  36.09 
 
 
460 aa  83.6  0.000000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.975919  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05549  ISXo8 transposase  36.09 
 
 
460 aa  83.6  0.000000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000558409  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03882  ISXo8 transposase  36.09 
 
 
460 aa  83.6  0.000000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04033  ISXo8 transposase  36.09 
 
 
460 aa  84  0.000000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00275  ISXo8 transposase  36.09 
 
 
460 aa  83.6  0.000000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00367  ISXo8 transposase  35.34 
 
 
460 aa  83.6  0.000000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.35667  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00462  ISXo8 transposase  36.09 
 
 
483 aa  83.6  0.000000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.345593  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00496  ISXo8 transposase  36.09 
 
 
460 aa  83.6  0.000000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.278841  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00516  ISXo8 transposase  36.09 
 
 
483 aa  83.6  0.000000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.445658  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05525  ISXo8 transposase  36.09 
 
 
460 aa  83.6  0.000000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.164261  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00638  ISXo8 transposase  36.09 
 
 
460 aa  83.6  0.000000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.357805  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00949  ISXo8 transposase  36.09 
 
 
460 aa  83.6  0.000000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0119493  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01079  ISXo8 transposase  36.09 
 
 
460 aa  83.6  0.000000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00198124  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06095  ISXo8 transposase  36.09 
 
 
460 aa  83.6  0.000000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01189  ISXo8 transposase  36.09 
 
 
460 aa  83.6  0.000000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.289676  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01752  ISXo8 transposase  36.09 
 
 
460 aa  83.6  0.000000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.418277  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05750  ISXo8 transposase  36.09 
 
 
460 aa  84  0.000000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.019264  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02022  ISXo8 transposase  36.09 
 
 
327 aa  84  0.000000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02540  ISXo8 transposase  36.09 
 
 
460 aa  83.6  0.000000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02542  ISXo8 transposase  36.09 
 
 
495 aa  83.6  0.000000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02570  ISXo8 transposase  36.09 
 
 
453 aa  83.6  0.000000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02582  ISXo8 transposase  36.09 
 
 
403 aa  83.6  0.000000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02646  ISXo8 transposase  36.09 
 
 
243 aa  83.6  0.000000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02784  ISXo8 transposase  35.34 
 
 
313 aa  83.6  0.000000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02889  ISXo8 transposase  36.09 
 
 
483 aa  83.6  0.000000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03368  ISXo8 transposase  36.09 
 
 
470 aa  83.6  0.000000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00015936  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03658  ISXo8 transposase  36.09 
 
 
460 aa  83.6  0.000000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.629527  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05428  ISXo8 transposase  36.09 
 
 
460 aa  83.2  0.000000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03220  ISXo8 transposase  36.09 
 
 
473 aa  83.6  0.000000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>