More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0594 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_0594  redoxin domain-containing protein  100 
 
 
172 aa  335  1.9999999999999998e-91  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6120  redoxin domain-containing protein  53.33 
 
 
209 aa  121  5e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.16555  normal  0.593362 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0510  putative secreted protein  55.56 
 
 
209 aa  107  6e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.113668  normal  0.171566 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2203  redoxin domain-containing protein  41.41 
 
 
203 aa  75.5  0.0000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1898  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  36.67 
 
 
166 aa  75.1  0.0000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000277693  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07200  thiol-disulfide isomerase-like thioredoxin  35.4 
 
 
181 aa  73.2  0.000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.246784 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2704  hypothetical protein  38.46 
 
 
205 aa  72.8  0.000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.396222  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17970  thiol-disulfide isomerase-like thioredoxin  44.9 
 
 
203 aa  70.1  0.00000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4431  Redoxin domain protein  35.92 
 
 
193 aa  68.6  0.00000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2734  Redoxin domain protein  39.62 
 
 
204 aa  68.9  0.00000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0627049  normal  0.0544448 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0521  Redoxin domain protein  38.24 
 
 
206 aa  67.8  0.00000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000754545  hitchhiker  0.00309639 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0049  Redoxin domain protein  30.99 
 
 
180 aa  67  0.0000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0628  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  38.38 
 
 
206 aa  67  0.0000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.603467  hitchhiker  0.00557817 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4473  redoxin domain-containing protein  37.76 
 
 
203 aa  66.2  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4304  redoxin domain-containing protein  37.76 
 
 
203 aa  66.2  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.213617  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4204  redoxin domain-containing protein  37.76 
 
 
203 aa  66.2  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5008  Redoxin domain protein  40.38 
 
 
248 aa  65.9  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.437471  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3240  redoxin domain-containing protein  39.05 
 
 
198 aa  65.5  0.0000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0444  Redoxin domain protein  38.46 
 
 
176 aa  65.1  0.0000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.567513  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3292  redoxin domain-containing protein  36.73 
 
 
200 aa  64.7  0.0000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0269  Redoxin domain-containing protein  37.5 
 
 
188 aa  64.3  0.0000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.352663  normal  0.890492 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3412  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  35.96 
 
 
169 aa  64.7  0.0000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3091  Redoxin domain protein  36.73 
 
 
203 aa  63.5  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3474  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  35.96 
 
 
169 aa  63.9  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.163841 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1885  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  33.65 
 
 
447 aa  63.9  0.000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.404766  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4563  redoxin domain-containing protein  36.36 
 
 
237 aa  63.5  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5746  redoxin domain-containing protein  38.1 
 
 
188 aa  62.8  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.487229  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0572  thiol-disulfide isomerase and thioredoxins-like protein  34.29 
 
 
189 aa  62.8  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.220825  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3254  Redoxin domain protein  39.05 
 
 
198 aa  62  0.000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0648017  normal  0.303521 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0032  Redoxin domain protein  30.15 
 
 
182 aa  61.2  0.000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000358102  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2395  thioredoxin-like protein  32.29 
 
 
278 aa  61.2  0.000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000335524  hitchhiker  0.0000244413 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2109  redoxin  35.05 
 
 
271 aa  60.5  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2789  thiol:disulfide interchange protein  36.63 
 
 
269 aa  60.1  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1959  redoxin domain-containing protein  39.18 
 
 
189 aa  60.1  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0329542  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24350  thiol-disulfide isomerase-like thioredoxin  35.92 
 
 
203 aa  59.3  0.00000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4573  Redoxin domain protein  36.54 
 
 
191 aa  59.3  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0344  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  38.14 
 
 
183 aa  58.9  0.00000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00014833  hitchhiker  0.000312976 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24260  thiol-disulfide isomerase-like thioredoxin  33.33 
 
 
196 aa  58.5  0.00000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0670449  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1356  redoxin domain-containing protein  30.21 
 
 
278 aa  58.5  0.00000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.052167  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0247  Redoxin domain protein  33.33 
 
 
165 aa  57.8  0.00000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.549118  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2015  Redoxin domain protein  36.08 
 
 
169 aa  57.8  0.00000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.878112  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1468  Redoxin domain-containing protein  29.45 
 
 
164 aa  57  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0261888  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1355  thiol-disulfide oxidoreductase  26.26 
 
 
173 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0051  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31 
 
 
178 aa  57  0.0000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.523254  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2202  redoxin domain-containing protein  36.19 
 
 
194 aa  57.4  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2013  thiol:disulfide interchange protein, thioredoxin family protein  34.44 
 
 
176 aa  56.6  0.0000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1146  thiol-disulfide isomerase and thioredoxins-like protein  30.77 
 
 
433 aa  56.2  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.299964  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1396  thiol-disulfide oxidoreductase  27.27 
 
 
173 aa  56.2  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1108  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.32 
 
 
193 aa  55.8  0.0000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1445  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  37.86 
 
 
182 aa  55.8  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8082  Redoxin domain protein  32 
 
 
180 aa  55.8  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3603  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  35.29 
 
 
183 aa  55.8  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1598  thiol-disulfide oxidoreductase  27.27 
 
 
173 aa  55.5  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.966744  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1356  thiol-disulfide oxidoreductase  27.27 
 
 
173 aa  55.5  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1634  thiol-disulfide oxidoreductase  27.27 
 
 
173 aa  55.5  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1036  Redoxin domain protein  35.29 
 
 
196 aa  55.1  0.0000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2276  Redoxin domain protein  34.83 
 
 
171 aa  55.1  0.0000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2593  putative thiol:disulfide interchange protein  31.63 
 
 
276 aa  55.1  0.0000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.357458  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3560  redoxin domain-containing protein  36.26 
 
 
278 aa  54.3  0.0000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2939  redoxin domain-containing protein  37.5 
 
 
179 aa  54.3  0.0000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.670984  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1383  thiol-disulfide oxidoreductase  27.27 
 
 
173 aa  54.3  0.0000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1494  thiol-disulfide oxidoreductase  27.27 
 
 
173 aa  54.3  0.0000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1528  thiol-disulfide oxidoreductase  27.27 
 
 
173 aa  54.3  0.0000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0584  periplasmic protein thiol--disulphide oxidoreductase DsbE  41.38 
 
 
175 aa  54.3  0.0000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.188776  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1321  thioredoxin family protein  35.96 
 
 
168 aa  53.5  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2869  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  35.71 
 
 
200 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2724  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.31 
 
 
188 aa  53.5  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.32328  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2252  putative thiol:disulfide interchange protein  30.93 
 
 
271 aa  53.9  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1180  RecJ exonuclease  26.83 
 
 
160 aa  53.5  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0271144 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2597  Redoxin domain protein  34.62 
 
 
220 aa  53.5  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1036  thiol:disulfide interchange protein DsbE  38.37 
 
 
182 aa  53.1  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1566  thiol-disulfide oxidoreductase  26.26 
 
 
173 aa  53.1  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.62392e-19 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4771  periplasmic protein thiol:disulfide oxidoreductase DsbE  40.45 
 
 
179 aa  52.8  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0827  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  36.56 
 
 
179 aa  53.1  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0501  redoxin domain-containing protein  33.01 
 
 
200 aa  52.8  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0926  Redoxin domain protein  39.51 
 
 
199 aa  53.1  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2908  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxins-like  38.37 
 
 
199 aa  53.1  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.629655  normal  0.543638 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3826  redoxin domain-containing protein  30.93 
 
 
279 aa  53.1  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0841  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.9 
 
 
174 aa  52.8  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1410  periplasmic protein thiol--disulphide oxidoreductase DsbE  38.89 
 
 
172 aa  53.1  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.459055  normal  0.574637 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4484  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  36.54 
 
 
195 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.810998 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0520  periplasmic protein thiol  38.3 
 
 
199 aa  52.4  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.797158  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2903  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.21 
 
 
184 aa  52  0.000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4236  redoxin domain protein  35.16 
 
 
278 aa  51.6  0.000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1628  redoxin domain-containing protein  35.16 
 
 
278 aa  51.6  0.000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0881722  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0861  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.43 
 
 
189 aa  51.6  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.155376  hitchhiker  0.00638708 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0463  periplasmic protein thiol--disulphide oxidoreductase DsbE  38.61 
 
 
179 aa  51.6  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.198306 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18200  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.29 
 
 
178 aa  51.6  0.000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000397372  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4433  redoxin domain-containing protein  37.76 
 
 
208 aa  51.6  0.000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.390962  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0325  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.41 
 
 
189 aa  51.6  0.000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0365546 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0318  periplasmic protein thiol-disulfide oxidoreductase DsbE  35.11 
 
 
197 aa  51.6  0.000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0525  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.43 
 
 
178 aa  51.2  0.000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000136072  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0377  periplasmic thioredoxin (cytochrome c biogenesis)  37.23 
 
 
198 aa  51.6  0.000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3262  redoxin domain-containing protein  28.89 
 
 
269 aa  51.6  0.000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0170639  normal  0.755125 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3817  thiol-disulfide oxidoreductase  26.26 
 
 
173 aa  51.6  0.000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000518727 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3362  periplasmic protein thiol--disulphide oxidoreductase DsbE  31.58 
 
 
192 aa  51.6  0.000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.34018  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0760  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  36.63 
 
 
228 aa  51.2  0.000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.173874 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4129  periplasmic protein thiol--disulphide oxidoreductase DsbE  33.57 
 
 
200 aa  51.2  0.000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.213063  normal  0.330883 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2921  Thiol-disulfide isomerase/thioredoxin-like  28.89 
 
 
269 aa  51.2  0.000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.253355  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0689  Redoxin domain protein  35.51 
 
 
188 aa  51.2  0.000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0960762  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>