26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3675 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_3675  putative tellurium resistance protein TerA  100 
 
 		 225 aa  452  1.0000000000000001e-126  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.433163 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1057  tellurium resistance protein TerA  84.14 
 
 		 226 aa  355  1.9999999999999998e-97  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.614683  normal  0.916687 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4753  Tellurium resistance  48.82 
 
 		 244 aa  220  9.999999999999999e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3016  tellurium resistance protein TerA  52.36 
 
 		 233 aa  219  3e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000734851  decreased coverage  0.000036152 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0404  hypothetical protein  56.12 
 
 		 245 aa  206  2e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.184039  normal  0.027185 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2992  stress protein  43.15 
 
 		 432 aa  197  1.0000000000000001e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000268445  normal  0.372941 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3876  stress protein  45.16 
 
 		 394 aa  196  2.0000000000000003e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000202647  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0663  tellurite resistance protein  45.16 
 
 		 394 aa  196  2.0000000000000003e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000164398  normal  0.444043 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3788  tellurite resistance protein  45.16 
 
 		 394 aa  196  2.0000000000000003e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000690158  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0809  stress protein  50 
 
 		 389 aa  195  6e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.616867  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0941  tellurium resistance protein TerA  49.52 
 
 		 401 aa  192  3e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0760  tellurium resistance protein  44.2 
 
 		 419 aa  189  2e-47  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0966858  normal  0.220902 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0273  stress protein  48.6 
 
 		 402 aa  186  2e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.448139 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1351  TerA  46.38 
 
 		 385 aa  184  8e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000447285  normal  0.483179 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0892  stress protein  48.1 
 
 		 418 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4663  stress protein  44.14 
 
 		 404 aa  182  3e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.298991 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0080  stress protein  42.65 
 
 		 412 aa  180  1e-44  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0763  stress protein  43.81 
 
 		 427 aa  179  4e-44  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.156224 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3695  Tellurium resistance  43 
 
 		 384 aa  177  9e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00168572  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1589  stress protein  45.54 
 
 		 401 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00887419  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1562  hypothetical protein  43.54 
 
 		 233 aa  161  9e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0473387  normal  0.0693726 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2005  stress protein, tellurium resistance protein TerD  37.33 
 
 		 370 aa  149  4e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.432333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0345  hypothetical protein  39.58 
 
 		 232 aa  73.2  0.000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6385  stress protein  26.42 
 
 		 568 aa  62.4  0.000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0413348  normal  0.258333 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3309  hypothetical protein  25.93 
 
 		 279 aa  57.8  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.838284  normal  0.151358 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6996  stress protein  33.33 
 
 		 402 aa  43.5  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>